Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G041100.2
Synonym Sb07g003425
Functional annotation OsFBD16 - F-box and FBD domain containing protein, expressed
UniProt A0A1Z5R917
Pfam PF08387
Panther DB PTHR32212 PTHR32212:SF107
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G60040 : F-box family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g37110.1 : OsFBD16 - F-box and FBD domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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12 Sobic.007G081100 MBTB21 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
13 Sobic.003G428500 expressed protein -
14 Sobic.009G110333 - -
15 Sobic.003G075300 OsFBX64 - F-box domain containing protein, expressed -
16 Sobic.005G110505 - -
17 Sobic.002G097200 OsFBLD4 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed -
18 Sobic.009G060100 alliin lyase precursor, putative, expressed K16903: L-tryptophan---pyruvate aminotransferase
19 Sobic.010G012700 katanin p60 ATPase-containing subunit, putative, expressed -
20 Sobic.010G196700 gp176, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic007G041100 Sobic007G041100 Sobic010G129450 Sobic010G129450 Sobic007G041100--Sobic010G129450 Sobic005G037600 Sobic005G037600 Sobic007G041100--Sobic005G037600 Sobic002G060101 Sobic002G060101 Sobic007G041100--Sobic002G060101 Sobic005G077001 Sobic005G077001 Sobic007G041100--Sobic005G077001 Sobic005G201501 Sobic005G201501 Sobic007G041100--Sobic005G201501 Sobic005G052400 Sobic005G052400 Sobic007G041100--Sobic005G052400 Sobic005G058600 Sobic005G058600 Sobic007G041100--Sobic005G058600 Sobic002G014300 Sobic002G014300 Sobic007G041100--Sobic002G014300 Sobic003G133201 Sobic003G133201 Sobic007G041100--Sobic003G133201 Sobic009G060100 Sobic009G060100 Sobic010G129450--Sobic009G060100 Sobic001G136000 Sobic001G136000 Sobic010G129450--Sobic001G136000 Sobic010G129450--Sobic005G058600 Sobic007G082100 Sobic007G082100 Sobic010G129450--Sobic007G082100 Sobic010G129450--Sobic003G133201 Sobic003G191200 Sobic003G191200 Sobic010G129450--Sobic003G191200 Sobic010G123800 Sobic010G123800 Sobic010G129450--Sobic010G123800 Sobic005G058300 Sobic005G058300 Sobic010G129450--Sobic005G058300 Sobic007G081100 Sobic007G081100 Sobic010G129450--Sobic007G081100 Sobic005G037600--Sobic002G060101 Sobic006G266400 Sobic006G266400 Sobic005G037600--Sobic006G266400 Sobic002G189500 Sobic002G189500 Sobic005G037600--Sobic002G189500 Sobic002G333001 Sobic002G333001 Sobic005G037600--Sobic002G333001 Sobic004G190400 Sobic004G190400 Sobic005G037600--Sobic004G190400 Sobic002G101600 Sobic002G101600 Sobic005G037600--Sobic002G101600 Sobic005G037600--Sobic007G081100 Sobic009G068400 Sobic009G068400 Sobic005G037600--Sobic009G068400 Sobic003G070400 Sobic003G070400 Sobic005G037600--Sobic003G070400 Sobic002G060101--Sobic005G037600 Sobic002G060101--Sobic006G266400 Sobic002G060101--Sobic002G333001 Sobic002G060101--Sobic003G070400 Sobic002G060101--Sobic009G068400 Sobic002G060101--Sobic007G081100 Sobic002G015900 Sobic002G015900 Sobic002G060101--Sobic002G015900 Sobic002G060101--Sobic002G101600 Sobic005G140900 Sobic005G140900 Sobic002G060101--Sobic005G140900 Sobic009G110333 Sobic009G110333 Sobic005G077001--Sobic009G110333 Sobic005G077001--Sobic005G201501 Sobic005G077001--Sobic005G058600 Sobic004G258000 Sobic004G258000 Sobic005G077001--Sobic004G258000 Sobic005G077001--Sobic003G133201 Sobic002G266500 Sobic002G266500 Sobic005G077001--Sobic002G266500 Sobic006G276801 Sobic006G276801 Sobic005G077001--Sobic006G276801 Sobic001G325850 Sobic001G325850 Sobic005G077001--Sobic001G325850 Sobic005G112500 Sobic005G112500 Sobic005G077001--Sobic005G112500 Sobic005G201501--Sobic005G077001 Sobic003G075300 Sobic003G075300 Sobic005G201501--Sobic003G075300 Sobic003G191300 Sobic003G191300 Sobic005G201501--Sobic003G191300 Sobic005G201501--Sobic005G058600 Sobic010G012700 Sobic010G012700 Sobic005G201501--Sobic010G012700 Sobic005G201501--Sobic004G258000 Sobic005G201501--Sobic009G110333 Sobic005G201501--Sobic002G014300 Sobic005G201501--Sobic003G133201 Sobic005G052400--Sobic010G129450 Sobic007G128000 Sobic007G128000 Sobic005G052400--Sobic007G128000 Sobic009G244100 Sobic009G244100 Sobic005G052400--Sobic009G244100 Sobic001G417700 Sobic001G417700 Sobic005G052400--Sobic001G417700 Sobic005G052400--Sobic001G136000 Sobic004G277900 Sobic004G277900 Sobic005G052400--Sobic004G277900 Sobic009G145000 Sobic009G145000 Sobic005G052400--Sobic009G145000 Sobic005G052400--Sobic006G266400 Sobic005G052400--Sobic002G189500 Sobic005G058600--Sobic003G133201 Sobic007G031200 Sobic007G031200 Sobic005G058600--Sobic007G031200 Sobic004G050900 Sobic004G050900 Sobic005G058600--Sobic004G050900 Sobic008G169101 Sobic008G169101 Sobic005G058600--Sobic008G169101 Sobic005G058600--Sobic003G191200 Sobic005G058600--Sobic009G110333 Sobic002G402900 Sobic002G402900 Sobic005G058600--Sobic002G402900 Sobic005G058600--Sobic005G077001 Sobic005G000900 Sobic005G000900 Sobic005G058600--Sobic005G000900 Sobic002G014300--Sobic010G012700 Sobic002G014300--Sobic005G201501 Sobic003G428500 Sobic003G428500 Sobic002G014300--Sobic003G428500 Sobic002G014300--Sobic003G075300 Sobic001G332100 Sobic001G332100 Sobic002G014300--Sobic001G332100 Sobic002G000800 Sobic002G000800 Sobic002G014300--Sobic002G000800 Sobic002G014300--Sobic005G077001 Sobic001G021200 Sobic001G021200 Sobic002G014300--Sobic001G021200 Sobic002G014300--Sobic010G129450 Sobic003G133201--Sobic004G050900 Sobic003G133201--Sobic005G058600 Sobic003G133201--Sobic009G110333 Sobic009G182100 Sobic009G182100 Sobic003G133201--Sobic009G182100 Sobic003G133201--Sobic005G000900 Sobic003G133201--Sobic002G266500 Sobic009G047100 Sobic009G047100 Sobic003G133201--Sobic009G047100 Sobic003G133201--Sobic007G031200 Sobic006G017700 Sobic006G017700 Sobic003G133201--Sobic006G017700
Octagon: transcription factors


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