Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G504800.1
Synonym Sb01g047118
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6QQJ3
Pfam -
Panther DB PTHR36137 PTHR36137:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g41620.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G037600 - -
2 Sobic.002G060101 - -
3 Sobic.002G097200 OsFBLD4 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed -
4 Sobic.005G220250 - -
5 Sobic.009G048700 expressed protein -
6 Sobic.007G041100 OsFBD16 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
7 Sobic.006G199500 ara54-like RING finger protein, putative, expressed K11971: RNF14, E3 ubiquitin-protein ligase RNF14
8 Sobic.010G061600 - -
9 Sobic.007G109301 - -
10 Sobic.004G190400 expressed protein -
11 Sobic.009G145000 early-responsive to dehydration protein-related, putative, expressed -
12 Sobic.006G266400 B3 DNA binding domain containing protein, expressed -
13 Sobic.001G133400 - -
14 Sobic.002G189500 expressed protein -
15 Sobic.009G008000 transcription factor Dp, putative, expressed -
16 Sobic.010G129450 - -
17 Sobic.007G081100 MBTB21 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
18 Sobic.003G211800 expressed protein -
19 Sobic.001G417700 polyadenylate-binding protein, putative, expressed K13126: polyadenylate-binding protein
20 Sobic.010G242600 OsFBDUF52 - F-box and DUF domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G504800 Sobic001G504800 Sobic005G037600 Sobic005G037600 Sobic001G504800--Sobic005G037600 Sobic002G060101 Sobic002G060101 Sobic001G504800--Sobic002G060101 Sobic002G097200 Sobic002G097200 Sobic001G504800--Sobic002G097200 Sobic005G220250 Sobic005G220250 Sobic001G504800--Sobic005G220250 Sobic009G048700 Sobic009G048700 Sobic001G504800--Sobic009G048700 Sobic007G041100 Sobic007G041100 Sobic001G504800--Sobic007G041100 Sobic006G199500 Sobic006G199500 Sobic001G504800--Sobic006G199500 Sobic010G061600 Sobic010G061600 Sobic001G504800--Sobic010G061600 Sobic007G109301 Sobic007G109301 Sobic001G504800--Sobic007G109301 Sobic005G037600--Sobic002G060101 Sobic006G266400 Sobic006G266400 Sobic005G037600--Sobic006G266400 Sobic002G189500 Sobic002G189500 Sobic005G037600--Sobic002G189500 Sobic002G333001 Sobic002G333001 Sobic005G037600--Sobic002G333001 Sobic004G190400 Sobic004G190400 Sobic005G037600--Sobic004G190400 Sobic002G101600 Sobic002G101600 Sobic005G037600--Sobic002G101600 Sobic007G081100 Sobic007G081100 Sobic005G037600--Sobic007G081100 Sobic009G068400 Sobic009G068400 Sobic005G037600--Sobic009G068400 Sobic003G070400 Sobic003G070400 Sobic005G037600--Sobic003G070400 Sobic002G060101--Sobic005G037600 Sobic002G060101--Sobic006G266400 Sobic002G060101--Sobic002G333001 Sobic002G060101--Sobic003G070400 Sobic002G060101--Sobic009G068400 Sobic002G060101--Sobic007G081100 Sobic002G015900 Sobic002G015900 Sobic002G060101--Sobic002G015900 Sobic002G060101--Sobic002G101600 Sobic005G140900 Sobic005G140900 Sobic002G060101--Sobic005G140900 Sobic002G097200--Sobic002G060101 Sobic002G097200--Sobic005G037600 Sobic002G097200--Sobic006G199500 Sobic002G097200--Sobic009G048700 Sobic002G097200--Sobic001G504800 Sobic010G038300 Sobic010G038300 Sobic002G097200--Sobic010G038300 Sobic004G168900 Sobic004G168900 Sobic002G097200--Sobic004G168900 Sobic009G145000 Sobic009G145000 Sobic002G097200--Sobic009G145000 Sobic003G005700 Sobic003G005700 Sobic002G097200--Sobic003G005700 Sobic005G220250--Sobic007G109301 Sobic005G220250--Sobic010G061600 Sobic005G220250--Sobic004G190400 Sobic002G035733 Sobic002G035733 Sobic005G220250--Sobic002G035733 Sobic005G220250--Sobic009G145000 Sobic005G220250--Sobic002G189500 Sobic005G220250--Sobic005G037600 Sobic009G008000 Sobic009G008000 Sobic005G220250--Sobic009G008000 Sobic001G133400 Sobic001G133400 Sobic005G220250--Sobic001G133400 Sobic009G048700--Sobic009G008000 Sobic001G417700 Sobic001G417700 Sobic009G048700--Sobic001G417700 Sobic008G155700 Sobic008G155700 Sobic009G048700--Sobic008G155700 Sobic009G048700--Sobic009G145000 Sobic007G094700 Sobic007G094700 Sobic009G048700--Sobic007G094700 Sobic009G048700--Sobic006G199500 Sobic004G203150 Sobic004G203150 Sobic009G048700--Sobic004G203150 Sobic002G418300 Sobic002G418300 Sobic009G048700--Sobic002G418300 Sobic007G219601 Sobic007G219601 Sobic009G048700--Sobic007G219601 Sobic010G129450 Sobic010G129450 Sobic007G041100--Sobic010G129450 Sobic007G041100--Sobic005G037600 Sobic007G041100--Sobic002G060101 Sobic005G077001 Sobic005G077001 Sobic007G041100--Sobic005G077001 Sobic005G201501 Sobic005G201501 Sobic007G041100--Sobic005G201501 Sobic005G052400 Sobic005G052400 Sobic007G041100--Sobic005G052400 Sobic005G058600 Sobic005G058600 Sobic007G041100--Sobic005G058600 Sobic002G014300 Sobic002G014300 Sobic007G041100--Sobic002G014300 Sobic003G133201 Sobic003G133201 Sobic007G041100--Sobic003G133201 Sobic006G199500--Sobic009G048700 Sobic006G199500--Sobic009G008000 Sobic006G199500--Sobic002G097200 Sobic006G199500--Sobic001G417700 Sobic006G199500--Sobic009G145000 Sobic002G243400 Sobic002G243400 Sobic006G199500--Sobic002G243400 Sobic004G020200 Sobic004G020200 Sobic006G199500--Sobic004G020200 Sobic001G136000 Sobic001G136000 Sobic006G199500--Sobic001G136000 Sobic006G199500--Sobic008G155700 Sobic010G061600--Sobic007G109301 Sobic010G061600--Sobic004G190400 Sobic010G061600--Sobic002G189500 Sobic010G061600--Sobic009G145000 Sobic010G061600--Sobic005G220250 Sobic010G061600--Sobic009G008000 Sobic010G061600--Sobic009G048700 Sobic010G061600--Sobic001G417700 Sobic010G061600--Sobic002G243400 Sobic007G109301--Sobic010G061600 Sobic007G109301--Sobic004G190400 Sobic007G109301--Sobic002G189500 Sobic007G109301--Sobic005G220250 Sobic007G109301--Sobic009G145000 Sobic007G109301--Sobic002G035733 Sobic001G029300 Sobic001G029300 Sobic007G109301--Sobic001G029300 Sobic007G109301--Sobic004G203150 Sobic001G163666 Sobic001G163666 Sobic007G109301--Sobic001G163666
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.