Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G048700.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6P6J4
Pfam -
Panther DB PTHR35504
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G11530 : embryonic flower 1 (EMF1)
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g12890.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a055379 , Zm00025a038114
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G008000 transcription factor Dp, putative, expressed -
2 Sobic.001G417700 polyadenylate-binding protein, putative, expressed K13126: polyadenylate-binding protein
3 Sobic.008G155700 ankyrin repeat domain-containing protein 44, putative, expressed -
4 Sobic.009G145000 early-responsive to dehydration protein-related, putative, expressed -
5 Sobic.007G094700 - -
6 Sobic.006G199500 ara54-like RING finger protein, putative, expressed K11971: RNF14, E3 ubiquitin-protein ligase RNF14
7 Sobic.004G203150 - -
8 Sobic.002G418300 vacuolar-sorting receptor precursor, putative, expressed -
9 Sobic.007G219601 - -
10 Sobic.008G056600 OsFBX237 - F-box domain containing protein, expressed -
11 Sobic.002G243400 transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 family, putative, expressed K14724: SLC9A8, solute carrier family 9 (sodium/hydrogen exchanger), member 8
12 Sobic.007G128000 cytochrome P450, putative, expressed -
13 Sobic.001G136000 PINHEAD, putative, expressed K11593: ELF2C, eukaryotic translation initiation factor 2C
14 Sobic.002G189500 expressed protein -
15 Sobic.010G061600 - -
16 Sobic.003G133600 major facilitator superfamily antiporter, putative, expressed -
17 Sobic.006G266400 B3 DNA binding domain containing protein, expressed -
18 Sobic.004G020200 expressed protein -
19 Sobic.001G029300 anthranilate synthase component I-1, chloroplast precursor, putative, expressed K01657: anthranilate synthase component I
20 Sobic.007G109301 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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