Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G343300.1
Synonym YSL7, Sb03g038730
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W075
Pfam PF03169
Panther DB PTHR31645 PTHR31645:SF14
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G65730 : YELLOW STRIPE like 7
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g61390.1 : transposon protein, putative, unclassified, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a057370 , Zm00025a035063 , Zm00025a035062 , Zm00025a039733
Brachypodium KQK00557 , KQK00555 , KQJ83669 , PNT69110 , KQJ85264 , KQK10363 , KQK10407
Barley HORVU2Hr1G120250.1 , HORVU2Hr1G120250.2 , HORVU6Hr1G009010.2 , HORVU7Hr1G082790.1 , HORVU6Hr1G008970.1 , HORVU6Hr1G008970.2 , HORVU6Hr1G008970.3 , HORVU3Hr1G087790.4 , HORVU3Hr1G087790.1 , HORVU3Hr1G087790.2 , HORVU3Hr1G087790.3
Wheat TraesCS3B02G382100 , TraesCS2D02G554800 , TraesCS3A02G349500 , TraesCS2A02G553300 , TraesCS6B02G059100 , TraesCS6A02G043100 , TraesCS3D02G343500 , TraesCS6D02G049900
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.003G343300


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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19 Sobic.002G066100 - -
20 Sobic.009G260900 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic003G343300 Sobic003G343300 Sobic007G195000 Sobic007G195000 Sobic003G343300--Sobic007G195000 Sobic006G062100 Sobic006G062100 Sobic003G343300--Sobic006G062100 Sobic003G343000 Sobic003G343000 Sobic003G343300--Sobic003G343000 Sobic008G134600 Sobic008G134600 Sobic003G343300--Sobic008G134600 Sobic007G139300 Sobic007G139300 Sobic003G343300--Sobic007G139300 Sobic003G305500 Sobic003G305500 Sobic003G343300--Sobic003G305500 Sobic008G124301 Sobic008G124301 Sobic003G343300--Sobic008G124301 Sobic001G392650 Sobic001G392650 Sobic003G343300--Sobic001G392650 Sobic003G160600 Sobic003G160600 Sobic003G343300--Sobic003G160600 Sobic007G195000--Sobic003G343300 Sobic007G195000--Sobic006G062100 Sobic007G195000--Sobic003G160600 Sobic005G039000 Sobic005G039000 Sobic007G195000--Sobic005G039000 Sobic007G195000--Sobic003G343000 Sobic007G195000--Sobic003G305500 Sobic004G327000 Sobic004G327000 Sobic007G195000--Sobic004G327000 Sobic007G195000--Sobic007G139300 Sobic007G195000--Sobic008G134600 Sobic001G037066 Sobic001G037066 Sobic006G062100--Sobic001G037066 Sobic009G260900 Sobic009G260900 Sobic006G062100--Sobic009G260900 Sobic006G062100--Sobic003G343300 Sobic006G176200 Sobic006G176200 Sobic006G062100--Sobic006G176200 Sobic006G062100--Sobic007G139300 Sobic009G216400 Sobic009G216400 Sobic006G062100--Sobic009G216400 Sobic003G127200 Sobic003G127200 Sobic006G062100--Sobic003G127200 Sobic007G100800 Sobic007G100800 Sobic006G062100--Sobic007G100800 Sobic002G351500 Sobic002G351500 Sobic006G062100--Sobic002G351500 Sobic003G343000--Sobic003G305500 Sobic003G343000--Sobic008G134600 Sobic003G343000--Sobic008G124301 Sobic003G343000--Sobic003G343300 Sobic006G059100 Sobic006G059100 Sobic003G343000--Sobic006G059100 Sobic003G343000--Sobic001G392650 Sobic003G445600 Sobic003G445600 Sobic003G343000--Sobic003G445600 Sobic003G343000--Sobic006G062100 Sobic003G343000--Sobic003G160600 Sobic008G134600--Sobic008G124301 Sobic003G317600 Sobic003G317600 Sobic008G134600--Sobic003G317600 Sobic007G175800 Sobic007G175800 Sobic008G134600--Sobic007G175800 Sobic004G294200 Sobic004G294200 Sobic008G134600--Sobic004G294200 Sobic003G164700 Sobic003G164700 Sobic008G134600--Sobic003G164700 Sobic002G197900 Sobic002G197900 Sobic008G134600--Sobic002G197900 Sobic004G134000 Sobic004G134000 Sobic008G134600--Sobic004G134000 Sobic008G043300 Sobic008G043300 Sobic008G134600--Sobic008G043300 Sobic001G097000 Sobic001G097000 Sobic008G134600--Sobic001G097000 Sobic003G405800 Sobic003G405800 Sobic007G139300--Sobic003G405800 Sobic007G139300--Sobic006G062100 Sobic007G139300--Sobic006G176200 Sobic001G366700 Sobic001G366700 Sobic007G139300--Sobic001G366700 Sobic001G529800 Sobic001G529800 Sobic007G139300--Sobic001G529800 Sobic009G087200 Sobic009G087200 Sobic007G139300--Sobic009G087200 Sobic001G220800 Sobic001G220800 Sobic007G139300--Sobic001G220800 Sobic003G313200 Sobic003G313200 Sobic007G139300--Sobic003G313200 Sobic009G158400 Sobic009G158400 Sobic007G139300--Sobic009G158400 Sobic003G305500--Sobic003G343000 Sobic003G208900 Sobic003G208900 Sobic003G305500--Sobic003G208900 Sobic003G305500--Sobic003G343300 Sobic003G305500--Sobic006G059100 Sobic003G305500--Sobic008G134600 Sobic009G062600 Sobic009G062600 Sobic003G305500--Sobic009G062600 Sobic003G305500--Sobic008G124301 Sobic003G305500--Sobic003G445600 Sobic003G305500--Sobic006G062100 Sobic008G124301--Sobic004G294200 Sobic008G124301--Sobic008G134600 Sobic008G124301--Sobic003G164700 Sobic008G124301--Sobic002G197900 Sobic002G066100 Sobic002G066100 Sobic008G124301--Sobic002G066100 Sobic008G124301--Sobic003G317600 Sobic008G124301--Sobic007G175800 Sobic008G119501 Sobic008G119501 Sobic008G124301--Sobic008G119501 Sobic006G237700 Sobic006G237700 Sobic008G124301--Sobic006G237700 Sobic002G049700 Sobic002G049700 Sobic001G392650--Sobic002G049700 Sobic001G392650--Sobic008G134600 Sobic002G330200 Sobic002G330200 Sobic001G392650--Sobic002G330200 Sobic009G158300 Sobic009G158300 Sobic001G392650--Sobic009G158300 Sobic001G392650--Sobic003G343000 Sobic001G392650--Sobic008G124301 Sobic001G109900 Sobic001G109900 Sobic001G392650--Sobic001G109900 Sobic009G060000 Sobic009G060000 Sobic001G392650--Sobic009G060000 Sobic001G392650--Sobic007G139300 Sobic003G160600--Sobic003G445600 Sobic003G160600--Sobic009G158300 Sobic003G160600--Sobic008G134600 Sobic009G016900 Sobic009G016900 Sobic003G160600--Sobic009G016900 Sobic001G409000 Sobic001G409000 Sobic003G160600--Sobic001G409000 Sobic003G160600--Sobic009G060000 Sobic006G018701 Sobic006G018701 Sobic003G160600--Sobic006G018701 Sobic003G160600--Sobic008G124301 Sobic003G160600--Sobic002G049700
Octagon: transcription factors


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