Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G037066.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S4J1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g51900.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G303700 OsPLIM2a - LIM domain protein, putative actin-binding protein and transcription factor, expressed K09377: cysteine and glycine-rich protein
2 Sobic.003G127200 phosphatidylinositol kinase, putative, expressed -
3 Sobic.007G100800 CSLD3 - cellulose synthase-like family D, expressed -
4 Sobic.009G260900 expressed protein -
5 Sobic.002G002600 la domain containing protein, expressed -
6 Sobic.008G028300 pollen allergen, putative, expressed -
7 Sobic.001G002200 myosin, putative, expressed K10357: myosin V
8 Sobic.003G061700 - -
9 Sobic.002G140500 POEI23 - Pollen Ole e I allergen and extensin family protein precursor, expressed -
10 Sobic.009G096700 Interacting factor of CBLs(PubMedID : 19860013)@CAMK_KIN1/SNF1/Nim1_like.20 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed -
11 Sobic.010G161400 polygalacturonase, putative, expressed K01213: galacturan 1,4-alpha-galacturonidase
12 Sobic.009G089532 - -
13 Sobic.001G539700 expansin precursor, putative, expressed -
14 Sobic.010G093600 myosin, putative, expressed K10357: myosin V
15 Sobic.008G186900 SCP-like extracellular protein, expressed -
16 Sobic.008G028100 pollen allergen, putative, expressed -
17 Sobic.010G229801 - -
18 Sobic.004G166100 pollen allergen Cyn d 23, putative, expressed -
19 Sobic.008G027800 pollen allergen, putative, expressed -
20 Sobic.009G098900 rho GDP-dissociation inhibitor 1, putative, expressed K12462: ARHGDI, Rho GDP-dissociation inhibitor


Gene co-expression network
sample Sobic001G037066 Sobic001G037066 Sobic004G303700 Sobic004G303700 Sobic001G037066--Sobic004G303700 Sobic003G127200 Sobic003G127200 Sobic001G037066--Sobic003G127200 Sobic007G100800 Sobic007G100800 Sobic001G037066--Sobic007G100800 Sobic009G260900 Sobic009G260900 Sobic001G037066--Sobic009G260900 Sobic002G002600 Sobic002G002600 Sobic001G037066--Sobic002G002600 Sobic008G028300 Sobic008G028300 Sobic001G037066--Sobic008G028300 Sobic001G002200 Sobic001G002200 Sobic001G037066--Sobic001G002200 Sobic003G061700 Sobic003G061700 Sobic001G037066--Sobic003G061700 Sobic002G140500 Sobic002G140500 Sobic001G037066--Sobic002G140500 Sobic010G161400 Sobic010G161400 Sobic004G303700--Sobic010G161400 Sobic004G303700--Sobic002G002600 Sobic009G098900 Sobic009G098900 Sobic004G303700--Sobic009G098900 Sobic009G089532 Sobic009G089532 Sobic004G303700--Sobic009G089532 Sobic004G303700--Sobic007G100800 Sobic003G173800 Sobic003G173800 Sobic004G303700--Sobic003G173800 Sobic005G010000 Sobic005G010000 Sobic004G303700--Sobic005G010000 Sobic008G186900 Sobic008G186900 Sobic004G303700--Sobic008G186900 Sobic004G303700--Sobic003G061700 Sobic003G127200--Sobic002G002600 Sobic003G127200--Sobic007G100800 Sobic003G127200--Sobic008G028300 Sobic003G127200--Sobic009G260900 Sobic003G127200--Sobic008G186900 Sobic003G127200--Sobic010G161400 Sobic003G127200--Sobic003G061700 Sobic003G127200--Sobic001G002200 Sobic001G539700 Sobic001G539700 Sobic003G127200--Sobic001G539700 Sobic007G100800--Sobic003G061700 Sobic007G100800--Sobic008G186900 Sobic007G100800--Sobic005G010000 Sobic007G100800--Sobic010G161400 Sobic007G100800--Sobic003G127200 Sobic007G100800--Sobic003G173800 Sobic007G100800--Sobic002G002600 Sobic007G100800--Sobic009G098900 Sobic007G100800--Sobic008G028300 Sobic009G260900--Sobic003G127200 Sobic009G260900--Sobic007G100800 Sobic009G260900--Sobic008G028300 Sobic009G260900--Sobic002G002600 Sobic009G260900--Sobic010G161400 Sobic009G260900--Sobic008G186900 Sobic009G260900--Sobic001G002200 Sobic008G028100 Sobic008G028100 Sobic009G260900--Sobic008G028100 Sobic009G260900--Sobic001G539700 Sobic002G002600--Sobic008G028300 Sobic002G002600--Sobic001G539700 Sobic002G002600--Sobic008G028100 Sobic002G002600--Sobic009G089532 Sobic002G002600--Sobic010G161400 Sobic009G016700 Sobic009G016700 Sobic002G002600--Sobic009G016700 Sobic010G093600 Sobic010G093600 Sobic002G002600--Sobic010G093600 Sobic009G096700 Sobic009G096700 Sobic002G002600--Sobic009G096700 Sobic002G002600--Sobic003G127200 Sobic008G028300--Sobic002G002600 Sobic008G028300--Sobic008G028100 Sobic008G028300--Sobic001G539700 Sobic008G028300--Sobic001G002200 Sobic008G028300--Sobic010G161400 Sobic008G028300--Sobic009G016700 Sobic008G028300--Sobic010G093600 Sobic008G028300--Sobic003G127200 Sobic004G166100 Sobic004G166100 Sobic008G028300--Sobic004G166100 Sobic008G027800 Sobic008G027800 Sobic001G002200--Sobic008G027800 Sobic001G002200--Sobic010G093600 Sobic001G002200--Sobic008G028300 Sobic001G002200--Sobic002G140500 Sobic001G228000 Sobic001G228000 Sobic001G002200--Sobic001G228000 Sobic001G002200--Sobic002G002600 Sobic001G002200--Sobic009G096700 Sobic001G002200--Sobic009G016700 Sobic008G028200 Sobic008G028200 Sobic001G002200--Sobic008G028200 Sobic003G061700--Sobic007G100800 Sobic003G061700--Sobic008G186900 Sobic003G061700--Sobic005G010000 Sobic003G061700--Sobic010G161400 Sobic003G061700--Sobic003G173800 Sobic003G061700--Sobic003G127200 Sobic003G061700--Sobic002G002600 Sobic002G351500 Sobic002G351500 Sobic003G061700--Sobic002G351500 Sobic003G061700--Sobic009G098900 Sobic002G140500--Sobic001G002200 Sobic002G140500--Sobic008G027800 Sobic002G140500--Sobic008G028200 Sobic002G140500--Sobic010G093600 Sobic001G348600 Sobic001G348600 Sobic002G140500--Sobic001G348600 Sobic002G140500--Sobic008G028300 Sobic002G140500--Sobic009G016700 Sobic006G171500 Sobic006G171500 Sobic002G140500--Sobic006G171500 Sobic002G140500--Sobic001G228000
Octagon: transcription factors


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