Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G195000.1
Synonym Sb07g026350
Functional annotation cystathionin beta synthase protein, putative, expressed
UniProt C5YI34
Pfam PF00571
Panther DB PTHR13780 PTHR13780:SF46
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G65320 : Cystathionine beta-synthase (CBS) family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g41740.1 : cystathionin beta synthase protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a005248
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G343300 - -
2 Sobic.006G062100 potassium transporter, putative, expressed K03549: KUP system potassium uptake protein
3 Sobic.003G160600 uncharacterized protein At4g06744 precursor, putative, expressed -
4 Sobic.005G039000 bifunctional monodehydroascorbate reductase and carbonic anhydrasenectarin-3 precursor, putative, expressed K01674: carbonic anhydrase
5 Sobic.003G343000 DEFL4 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
6 Sobic.003G305500 expressed protein -
7 Sobic.004G327000 STE_PAK_Ste20_STLK.2 - STE kinases include homologs to sterile 7, sterile 11 and sterile 20 from yeast, expressed K08835: OXSR1, serine/threonine-protein kinase OSR1/STK39
8 Sobic.007G139300 exostosin family domain containing protein, expressed -
9 Sobic.008G134600 - -
10 Sobic.006G018701 - -
11 Sobic.001G037066 - -
12 Sobic.001G392650 - -
13 Sobic.008G124301 - -
14 Sobic.003G208900 Sad1 / UNC-like C-terminal domain containing protein, putative, expressed -
15 Sobic.009G158300 - -
16 Sobic.003G445600 KIP1, putative, expressed -
17 Sobic.001G188100 expressed protein K15191: La-related protein 7
18 Sobic.002G049700 potassium channel AKT1, putative, expressed -
19 Sobic.010G229801 - -
20 Sobic.004G160000 potassium transporter, putative, expressed K03549: KUP system potassium uptake protein


Gene co-expression network
sample Sobic007G195000 Sobic007G195000 Sobic003G343300 Sobic003G343300 Sobic007G195000--Sobic003G343300 Sobic006G062100 Sobic006G062100 Sobic007G195000--Sobic006G062100 Sobic003G160600 Sobic003G160600 Sobic007G195000--Sobic003G160600 Sobic005G039000 Sobic005G039000 Sobic007G195000--Sobic005G039000 Sobic003G343000 Sobic003G343000 Sobic007G195000--Sobic003G343000 Sobic003G305500 Sobic003G305500 Sobic007G195000--Sobic003G305500 Sobic004G327000 Sobic004G327000 Sobic007G195000--Sobic004G327000 Sobic007G139300 Sobic007G139300 Sobic007G195000--Sobic007G139300 Sobic008G134600 Sobic008G134600 Sobic007G195000--Sobic008G134600 Sobic003G343300--Sobic007G195000 Sobic003G343300--Sobic006G062100 Sobic003G343300--Sobic003G343000 Sobic003G343300--Sobic008G134600 Sobic003G343300--Sobic007G139300 Sobic003G343300--Sobic003G305500 Sobic008G124301 Sobic008G124301 Sobic003G343300--Sobic008G124301 Sobic001G392650 Sobic001G392650 Sobic003G343300--Sobic001G392650 Sobic003G343300--Sobic003G160600 Sobic001G037066 Sobic001G037066 Sobic006G062100--Sobic001G037066 Sobic009G260900 Sobic009G260900 Sobic006G062100--Sobic009G260900 Sobic006G062100--Sobic003G343300 Sobic006G176200 Sobic006G176200 Sobic006G062100--Sobic006G176200 Sobic006G062100--Sobic007G139300 Sobic009G216400 Sobic009G216400 Sobic006G062100--Sobic009G216400 Sobic003G127200 Sobic003G127200 Sobic006G062100--Sobic003G127200 Sobic007G100800 Sobic007G100800 Sobic006G062100--Sobic007G100800 Sobic002G351500 Sobic002G351500 Sobic006G062100--Sobic002G351500 Sobic003G445600 Sobic003G445600 Sobic003G160600--Sobic003G445600 Sobic009G158300 Sobic009G158300 Sobic003G160600--Sobic009G158300 Sobic003G160600--Sobic008G134600 Sobic009G016900 Sobic009G016900 Sobic003G160600--Sobic009G016900 Sobic001G409000 Sobic001G409000 Sobic003G160600--Sobic001G409000 Sobic009G060000 Sobic009G060000 Sobic003G160600--Sobic009G060000 Sobic006G018701 Sobic006G018701 Sobic003G160600--Sobic006G018701 Sobic003G160600--Sobic008G124301 Sobic002G049700 Sobic002G049700 Sobic003G160600--Sobic002G049700 Sobic005G039000--Sobic003G343300 Sobic003G208900 Sobic003G208900 Sobic005G039000--Sobic003G208900 Sobic005G039000--Sobic007G195000 Sobic005G039000--Sobic003G343000 Sobic005G039000--Sobic007G139300 Sobic007G185801 Sobic007G185801 Sobic005G039000--Sobic007G185801 Sobic005G039000--Sobic006G062100 Sobic005G039000--Sobic006G018701 Sobic005G039000--Sobic004G327000 Sobic003G343000--Sobic003G305500 Sobic003G343000--Sobic008G134600 Sobic003G343000--Sobic008G124301 Sobic003G343000--Sobic003G343300 Sobic006G059100 Sobic006G059100 Sobic003G343000--Sobic006G059100 Sobic003G343000--Sobic001G392650 Sobic003G343000--Sobic003G445600 Sobic003G343000--Sobic006G062100 Sobic003G343000--Sobic003G160600 Sobic003G305500--Sobic003G343000 Sobic003G305500--Sobic003G208900 Sobic003G305500--Sobic003G343300 Sobic003G305500--Sobic006G059100 Sobic003G305500--Sobic008G134600 Sobic009G062600 Sobic009G062600 Sobic003G305500--Sobic009G062600 Sobic003G305500--Sobic008G124301 Sobic003G305500--Sobic003G445600 Sobic003G305500--Sobic006G062100 Sobic004G327000--Sobic006G018701 Sobic007G161100 Sobic007G161100 Sobic004G327000--Sobic007G161100 Sobic004G160000 Sobic004G160000 Sobic004G327000--Sobic004G160000 Sobic004G327000--Sobic007G195000 Sobic004G327000--Sobic003G160600 Sobic004G327000--Sobic003G343300 Sobic010G026200 Sobic010G026200 Sobic004G327000--Sobic010G026200 Sobic004G327000--Sobic009G158300 Sobic001G188100 Sobic001G188100 Sobic004G327000--Sobic001G188100 Sobic003G405800 Sobic003G405800 Sobic007G139300--Sobic003G405800 Sobic007G139300--Sobic006G062100 Sobic007G139300--Sobic006G176200 Sobic001G366700 Sobic001G366700 Sobic007G139300--Sobic001G366700 Sobic001G529800 Sobic001G529800 Sobic007G139300--Sobic001G529800 Sobic009G087200 Sobic009G087200 Sobic007G139300--Sobic009G087200 Sobic001G220800 Sobic001G220800 Sobic007G139300--Sobic001G220800 Sobic003G313200 Sobic003G313200 Sobic007G139300--Sobic003G313200 Sobic009G158400 Sobic009G158400 Sobic007G139300--Sobic009G158400 Sobic008G134600--Sobic008G124301 Sobic003G317600 Sobic003G317600 Sobic008G134600--Sobic003G317600 Sobic007G175800 Sobic007G175800 Sobic008G134600--Sobic007G175800 Sobic004G294200 Sobic004G294200 Sobic008G134600--Sobic004G294200 Sobic003G164700 Sobic003G164700 Sobic008G134600--Sobic003G164700 Sobic002G197900 Sobic002G197900 Sobic008G134600--Sobic002G197900 Sobic004G134000 Sobic004G134000 Sobic008G134600--Sobic004G134000 Sobic008G043300 Sobic008G043300 Sobic008G134600--Sobic008G043300 Sobic001G097000 Sobic001G097000 Sobic008G134600--Sobic001G097000
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.