Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G343000.1
Synonym
Functional annotation DEFL4 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed
UniProt A0A1B6Q6V8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g61360.1 : DEFL4 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G305500 expressed protein -
2 Sobic.008G134600 - -
3 Sobic.008G124301 - -
4 Sobic.003G343300 - -
5 Sobic.006G059100 POEI20 - Pollen Ole e I allergen and extensin family protein precursor, expressed -
6 Sobic.001G392650 - -
7 Sobic.003G445600 KIP1, putative, expressed -
8 Sobic.006G062100 potassium transporter, putative, expressed K03549: KUP system potassium uptake protein
9 Sobic.003G160600 uncharacterized protein At4g06744 precursor, putative, expressed -
10 Sobic.007G139300 exostosin family domain containing protein, expressed -
11 Sobic.004G294200 ZOS2-13 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
12 Sobic.006G176200 OsSub43 - Putative Subtilisin homologue, expressed -
13 Sobic.002G049700 potassium channel AKT1, putative, expressed -
14 Sobic.009G260900 expressed protein -
15 Sobic.001G473700 OsSCP11 - Putative Serine Carboxypeptidase homologue, expressed K16297: serine carboxypeptidase-like clade II
16 Sobic.009G177300 monocopper oxidase, putative, expressed -
17 Sobic.002G066100 - -
18 Sobic.003G164700 C2 domain containing protein, putative, expressed -
19 Sobic.006G018701 - -
20 Sobic.002G303500 actin-depolymerizing factor, putative, expressed K05765: cofilin


Gene co-expression network
sample Sobic003G343000 Sobic003G343000 Sobic003G305500 Sobic003G305500 Sobic003G343000--Sobic003G305500 Sobic008G134600 Sobic008G134600 Sobic003G343000--Sobic008G134600 Sobic008G124301 Sobic008G124301 Sobic003G343000--Sobic008G124301 Sobic003G343300 Sobic003G343300 Sobic003G343000--Sobic003G343300 Sobic006G059100 Sobic006G059100 Sobic003G343000--Sobic006G059100 Sobic001G392650 Sobic001G392650 Sobic003G343000--Sobic001G392650 Sobic003G445600 Sobic003G445600 Sobic003G343000--Sobic003G445600 Sobic006G062100 Sobic006G062100 Sobic003G343000--Sobic006G062100 Sobic003G160600 Sobic003G160600 Sobic003G343000--Sobic003G160600 Sobic003G305500--Sobic003G343000 Sobic003G208900 Sobic003G208900 Sobic003G305500--Sobic003G208900 Sobic003G305500--Sobic003G343300 Sobic003G305500--Sobic006G059100 Sobic003G305500--Sobic008G134600 Sobic009G062600 Sobic009G062600 Sobic003G305500--Sobic009G062600 Sobic003G305500--Sobic008G124301 Sobic003G305500--Sobic003G445600 Sobic003G305500--Sobic006G062100 Sobic008G134600--Sobic008G124301 Sobic003G317600 Sobic003G317600 Sobic008G134600--Sobic003G317600 Sobic007G175800 Sobic007G175800 Sobic008G134600--Sobic007G175800 Sobic004G294200 Sobic004G294200 Sobic008G134600--Sobic004G294200 Sobic003G164700 Sobic003G164700 Sobic008G134600--Sobic003G164700 Sobic002G197900 Sobic002G197900 Sobic008G134600--Sobic002G197900 Sobic004G134000 Sobic004G134000 Sobic008G134600--Sobic004G134000 Sobic008G043300 Sobic008G043300 Sobic008G134600--Sobic008G043300 Sobic001G097000 Sobic001G097000 Sobic008G134600--Sobic001G097000 Sobic008G124301--Sobic004G294200 Sobic008G124301--Sobic008G134600 Sobic008G124301--Sobic003G164700 Sobic008G124301--Sobic002G197900 Sobic002G066100 Sobic002G066100 Sobic008G124301--Sobic002G066100 Sobic008G124301--Sobic003G317600 Sobic008G124301--Sobic007G175800 Sobic008G119501 Sobic008G119501 Sobic008G124301--Sobic008G119501 Sobic006G237700 Sobic006G237700 Sobic008G124301--Sobic006G237700 Sobic007G195000 Sobic007G195000 Sobic003G343300--Sobic007G195000 Sobic003G343300--Sobic006G062100 Sobic003G343300--Sobic003G343000 Sobic003G343300--Sobic008G134600 Sobic007G139300 Sobic007G139300 Sobic003G343300--Sobic007G139300 Sobic003G343300--Sobic003G305500 Sobic003G343300--Sobic008G124301 Sobic003G343300--Sobic001G392650 Sobic003G343300--Sobic003G160600 Sobic006G059100--Sobic004G294200 Sobic006G059100--Sobic008G124301 Sobic006G059100--Sobic002G066100 Sobic009G177300 Sobic009G177300 Sobic006G059100--Sobic009G177300 Sobic006G059100--Sobic008G134600 Sobic006G071096 Sobic006G071096 Sobic006G059100--Sobic006G071096 Sobic006G059100--Sobic002G197900 Sobic006G059100--Sobic003G343000 Sobic001G473700 Sobic001G473700 Sobic006G059100--Sobic001G473700 Sobic002G049700 Sobic002G049700 Sobic001G392650--Sobic002G049700 Sobic001G392650--Sobic008G134600 Sobic002G330200 Sobic002G330200 Sobic001G392650--Sobic002G330200 Sobic009G158300 Sobic009G158300 Sobic001G392650--Sobic009G158300 Sobic001G392650--Sobic003G343000 Sobic001G392650--Sobic008G124301 Sobic001G109900 Sobic001G109900 Sobic001G392650--Sobic001G109900 Sobic009G060000 Sobic009G060000 Sobic001G392650--Sobic009G060000 Sobic001G392650--Sobic007G139300 Sobic002G303500 Sobic002G303500 Sobic003G445600--Sobic002G303500 Sobic009G016900 Sobic009G016900 Sobic003G445600--Sobic009G016900 Sobic006G282000 Sobic006G282000 Sobic003G445600--Sobic006G282000 Sobic003G445600--Sobic001G097000 Sobic010G229801 Sobic010G229801 Sobic003G445600--Sobic010G229801 Sobic003G445600--Sobic003G317600 Sobic004G242600 Sobic004G242600 Sobic003G445600--Sobic004G242600 Sobic003G445600--Sobic007G175800 Sobic004G134600 Sobic004G134600 Sobic003G445600--Sobic004G134600 Sobic001G037066 Sobic001G037066 Sobic006G062100--Sobic001G037066 Sobic009G260900 Sobic009G260900 Sobic006G062100--Sobic009G260900 Sobic006G062100--Sobic003G343300 Sobic006G176200 Sobic006G176200 Sobic006G062100--Sobic006G176200 Sobic006G062100--Sobic007G139300 Sobic009G216400 Sobic009G216400 Sobic006G062100--Sobic009G216400 Sobic003G127200 Sobic003G127200 Sobic006G062100--Sobic003G127200 Sobic007G100800 Sobic007G100800 Sobic006G062100--Sobic007G100800 Sobic002G351500 Sobic002G351500 Sobic006G062100--Sobic002G351500 Sobic003G160600--Sobic003G445600 Sobic003G160600--Sobic009G158300 Sobic003G160600--Sobic008G134600 Sobic003G160600--Sobic009G016900 Sobic001G409000 Sobic001G409000 Sobic003G160600--Sobic001G409000 Sobic003G160600--Sobic009G060000 Sobic006G018701 Sobic006G018701 Sobic003G160600--Sobic006G018701 Sobic003G160600--Sobic008G124301 Sobic003G160600--Sobic002G049700
Octagon: transcription factors


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