Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G181500.1
Synonym Sb05g024000
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PTC6
Pfam -
Panther DB PTHR35166:SF1 PTHR35166
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g10480.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G167201 - -
2 Sobic.009G166000 IQ calmodulin-binding motif domain containing protein, expressed -
3 Sobic.004G331500 similar to Cation-transporting ATPase(PubMedID : 29862293)@ATPase 8, plasma membrane-type, putative, expressed K01535: PMA1, H+-transporting ATPase
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15 Sobic.009G227500 aspartyl protease family protein, putative, expressed -
16 Sobic.008G075800 - -
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18 Sobic.002G323200 COBRA-like protein precursor, putative, expressed -
19 Sobic.002G210150 - -
20 Sobic.001G222800 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic005G181500 Sobic005G181500 Sobic009G167201 Sobic009G167201 Sobic005G181500--Sobic009G167201 Sobic009G166000 Sobic009G166000 Sobic005G181500--Sobic009G166000 Sobic004G331500 Sobic004G331500 Sobic005G181500--Sobic004G331500 Sobic006G044800 Sobic006G044800 Sobic005G181500--Sobic006G044800 Sobic001G202900 Sobic001G202900 Sobic005G181500--Sobic001G202900 Sobic005G209300 Sobic005G209300 Sobic005G181500--Sobic005G209300 Sobic010G034200 Sobic010G034200 Sobic005G181500--Sobic010G034200 Sobic005G192000 Sobic005G192000 Sobic005G181500--Sobic005G192000 Sobic004G287200 Sobic004G287200 Sobic005G181500--Sobic004G287200 Sobic009G167201--Sobic009G166000 Sobic010G177600 Sobic010G177600 Sobic009G167201--Sobic010G177600 Sobic009G167201--Sobic004G331500 Sobic008G075800 Sobic008G075800 Sobic009G167201--Sobic008G075800 Sobic007G061800 Sobic007G061800 Sobic009G167201--Sobic007G061800 Sobic001G222800 Sobic001G222800 Sobic009G167201--Sobic001G222800 Sobic009G165900 Sobic009G165900 Sobic009G167201--Sobic009G165900 Sobic009G167201--Sobic004G287200 Sobic010G118800 Sobic010G118800 Sobic009G167201--Sobic010G118800 Sobic009G166000--Sobic004G331500 Sobic009G166000--Sobic008G075800 Sobic009G166000--Sobic010G177600 Sobic009G166000--Sobic004G287200 Sobic009G166000--Sobic007G061800 Sobic009G166000--Sobic001G222800 Sobic009G166000--Sobic009G165900 Sobic009G166000--Sobic010G034200 Sobic009G166000--Sobic009G167201 Sobic004G331500--Sobic009G166000 Sobic004G331500--Sobic008G075800 Sobic004G331500--Sobic004G287200 Sobic004G331500--Sobic009G165900 Sobic004G331500--Sobic001G222800 Sobic004G331500--Sobic007G061800 Sobic004G331500--Sobic010G177600 Sobic004G336401 Sobic004G336401 Sobic004G331500--Sobic004G336401 Sobic004G331500--Sobic001G202900 Sobic004G041800 Sobic004G041800 Sobic006G044800--Sobic004G041800 Sobic005G185750 Sobic005G185750 Sobic006G044800--Sobic005G185750 Sobic006G044800--Sobic005G209300 Sobic006G044800--Sobic001G202900 Sobic004G289900 Sobic004G289900 Sobic006G044800--Sobic004G289900 Sobic006G044800--Sobic005G181500 Sobic001G513400 Sobic001G513400 Sobic006G044800--Sobic001G513400 Sobic008G168932 Sobic008G168932 Sobic006G044800--Sobic008G168932 Sobic001G466100 Sobic001G466100 Sobic006G044800--Sobic001G466100 Sobic001G202900--Sobic009G165900 Sobic001G202900--Sobic004G331500 Sobic010G034300 Sobic010G034300 Sobic001G202900--Sobic010G034300 Sobic001G202900--Sobic004G336401 Sobic010G254100 Sobic010G254100 Sobic001G202900--Sobic010G254100 Sobic008G097800 Sobic008G097800 Sobic001G202900--Sobic008G097800 Sobic001G202900--Sobic009G166000 Sobic001G202900--Sobic008G075800 Sobic001G202900--Sobic004G287200 Sobic005G209300--Sobic004G041800 Sobic004G080000 Sobic004G080000 Sobic005G209300--Sobic004G080000 Sobic005G209300--Sobic004G331500 Sobic005G209300--Sobic001G466100 Sobic007G146300 Sobic007G146300 Sobic005G209300--Sobic007G146300 Sobic005G209300--Sobic010G034300 Sobic005G209300--Sobic009G165900 Sobic005G209300--Sobic009G166000 Sobic005G209300--Sobic010G254100 Sobic001G400400 Sobic001G400400 Sobic010G034200--Sobic001G400400 Sobic009G227500 Sobic009G227500 Sobic010G034200--Sobic009G227500 Sobic002G395100 Sobic002G395100 Sobic010G034200--Sobic002G395100 Sobic006G219700 Sobic006G219700 Sobic010G034200--Sobic006G219700 Sobic010G034200--Sobic007G061800 Sobic010G034200--Sobic008G075800 Sobic006G234400 Sobic006G234400 Sobic010G034200--Sobic006G234400 Sobic009G259600 Sobic009G259600 Sobic010G034200--Sobic009G259600 Sobic010G034200--Sobic001G222800 Sobic002G210150 Sobic002G210150 Sobic005G192000--Sobic002G210150 Sobic002G323200 Sobic002G323200 Sobic005G192000--Sobic002G323200 Sobic005G192000--Sobic010G034200 Sobic002G429000 Sobic002G429000 Sobic005G192000--Sobic002G429000 Sobic005G192000--Sobic009G166000 Sobic005G192000--Sobic009G227500 Sobic005G192000--Sobic004G331500 Sobic005G192000--Sobic001G400400 Sobic005G192000--Sobic005G209300 Sobic004G287200--Sobic001G222800 Sobic004G287200--Sobic004G331500 Sobic004G287200--Sobic008G075800 Sobic004G287200--Sobic009G166000 Sobic004G287200--Sobic007G061800 Sobic004G287200--Sobic010G177600 Sobic004G287200--Sobic009G165900 Sobic004G287200--Sobic010G118800 Sobic004G287200--Sobic009G227500
Octagon: transcription factors


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