Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G166000.4,Sobic.009G166000.3
Synonym iqd2, Sb09g022790
Functional annotation IQ calmodulin-binding motif domain containing protein, expressed
UniProt A0A1Z5R2Y8
Pfam PF00612
Panther DB PTHR32295 PTHR32295:SF19
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G03040 : IQ-domain 2
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g61720.1,LOC_Os01g61720.3 : IQ calmodulin-binding motif domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a043918
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G331500 similar to Cation-transporting ATPase(PubMedID : 29862293)@ATPase 8, plasma membrane-type, putative, expressed K01535: PMA1, H+-transporting ATPase
2 Sobic.008G075800 - -
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4 Sobic.004G287200 OsSub26 - Putative Subtilisin homologue, expressed -
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6 Sobic.001G222800 expressed protein -
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8 Sobic.010G034200 pectate lyase precursor, putative, expressed K01728: pectate lyase
9 Sobic.009G167201 - -
10 Sobic.009G227500 aspartyl protease family protein, putative, expressed -
11 Sobic.010G118800 - -
12 Sobic.001G202900 expressed protein -
13 Sobic.006G234400 DUF617 domain containing protein, expressed -
14 Sobic.001G400400 pectinesterase, putative, expressed K01051: pectinesterase
15 Sobic.004G336401 - -
16 Sobic.010G254100 protein kinase APK1B, chloroplast precursor, putative, expressed -
17 Sobic.007G222700 - -
18 Sobic.002G405300 START domain containing protein, expressed -
19 Sobic.001G364700 glycosyl transferase 8 domain containing protein, putative, expressed -
20 Sobic.010G034300 pectate lyase precursor, putative, expressed K01728: pectate lyase


Gene co-expression network
sample Sobic009G166000 Sobic009G166000 Sobic004G331500 Sobic004G331500 Sobic009G166000--Sobic004G331500 Sobic008G075800 Sobic008G075800 Sobic009G166000--Sobic008G075800 Sobic010G177600 Sobic010G177600 Sobic009G166000--Sobic010G177600 Sobic004G287200 Sobic004G287200 Sobic009G166000--Sobic004G287200 Sobic007G061800 Sobic007G061800 Sobic009G166000--Sobic007G061800 Sobic001G222800 Sobic001G222800 Sobic009G166000--Sobic001G222800 Sobic009G165900 Sobic009G165900 Sobic009G166000--Sobic009G165900 Sobic010G034200 Sobic010G034200 Sobic009G166000--Sobic010G034200 Sobic009G167201 Sobic009G167201 Sobic009G166000--Sobic009G167201 Sobic004G331500--Sobic009G166000 Sobic004G331500--Sobic008G075800 Sobic004G331500--Sobic004G287200 Sobic004G331500--Sobic009G165900 Sobic004G331500--Sobic001G222800 Sobic004G331500--Sobic007G061800 Sobic004G331500--Sobic010G177600 Sobic004G336401 Sobic004G336401 Sobic004G331500--Sobic004G336401 Sobic001G202900 Sobic001G202900 Sobic004G331500--Sobic001G202900 Sobic008G075800--Sobic007G061800 Sobic008G075800--Sobic001G222800 Sobic010G118800 Sobic010G118800 Sobic008G075800--Sobic010G118800 Sobic008G075800--Sobic010G177600 Sobic008G075800--Sobic004G331500 Sobic008G075800--Sobic009G166000 Sobic008G075800--Sobic004G287200 Sobic007G222700 Sobic007G222700 Sobic008G075800--Sobic007G222700 Sobic008G075800--Sobic010G034200 Sobic010G177600--Sobic007G061800 Sobic010G177600--Sobic008G075800 Sobic010G177600--Sobic001G222800 Sobic010G177600--Sobic010G118800 Sobic010G177600--Sobic009G166000 Sobic010G177600--Sobic004G331500 Sobic006G234400 Sobic006G234400 Sobic010G177600--Sobic006G234400 Sobic009G227500 Sobic009G227500 Sobic010G177600--Sobic009G227500 Sobic010G177600--Sobic007G222700 Sobic004G287200--Sobic001G222800 Sobic004G287200--Sobic004G331500 Sobic004G287200--Sobic008G075800 Sobic004G287200--Sobic009G166000 Sobic004G287200--Sobic007G061800 Sobic004G287200--Sobic010G177600 Sobic004G287200--Sobic009G165900 Sobic004G287200--Sobic010G118800 Sobic004G287200--Sobic009G227500 Sobic007G061800--Sobic008G075800 Sobic007G061800--Sobic010G118800 Sobic007G061800--Sobic001G222800 Sobic007G061800--Sobic010G177600 Sobic001G364700 Sobic001G364700 Sobic007G061800--Sobic001G364700 Sobic007G061800--Sobic007G222700 Sobic007G061800--Sobic006G234400 Sobic007G061800--Sobic009G227500 Sobic007G061800--Sobic010G034200 Sobic001G222800--Sobic008G075800 Sobic001G222800--Sobic007G061800 Sobic001G222800--Sobic010G118800 Sobic001G222800--Sobic010G177600 Sobic001G222800--Sobic004G287200 Sobic001G222800--Sobic007G222700 Sobic001G222800--Sobic001G364700 Sobic001G222800--Sobic004G331500 Sobic001G222800--Sobic006G234400 Sobic009G165900--Sobic004G331500 Sobic009G165900--Sobic004G336401 Sobic010G254100 Sobic010G254100 Sobic009G165900--Sobic010G254100 Sobic009G165900--Sobic008G075800 Sobic009G165900--Sobic001G202900 Sobic009G165900--Sobic009G166000 Sobic008G097800 Sobic008G097800 Sobic009G165900--Sobic008G097800 Sobic010G034300 Sobic010G034300 Sobic009G165900--Sobic010G034300 Sobic009G165900--Sobic004G287200 Sobic001G400400 Sobic001G400400 Sobic010G034200--Sobic001G400400 Sobic010G034200--Sobic009G227500 Sobic002G395100 Sobic002G395100 Sobic010G034200--Sobic002G395100 Sobic006G219700 Sobic006G219700 Sobic010G034200--Sobic006G219700 Sobic010G034200--Sobic007G061800 Sobic010G034200--Sobic008G075800 Sobic010G034200--Sobic006G234400 Sobic009G259600 Sobic009G259600 Sobic010G034200--Sobic009G259600 Sobic010G034200--Sobic001G222800 Sobic009G167201--Sobic009G166000 Sobic009G167201--Sobic010G177600 Sobic009G167201--Sobic004G331500 Sobic009G167201--Sobic008G075800 Sobic009G167201--Sobic007G061800 Sobic009G167201--Sobic001G222800 Sobic009G167201--Sobic009G165900 Sobic009G167201--Sobic004G287200 Sobic009G167201--Sobic010G118800
Octagon: transcription factors


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