Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G364700.2
Synonym Sb01g034770, GATL4
Functional annotation glycosyl transferase 8 domain containing protein, putative, expressed
UniProt A0A1Z5S9Q8
Pfam PF01501
Panther DB PTHR13778 PTHR13778:SF13
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016757; transferase activity, transferring glycosyl groups


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G06260 : galacturonosyltransferase-like 4
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g24510.1 : glycosyl transferase 8 domain containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a049392 , Zm00025a002567 , Zm00025a048973 , Zm00025a052611 , Zm00025a056572 , Zm00025a007479 , Zm00025a010455
Brachypodium KQK21598 , KQK02001 , KQJ83757
Barley HORVU4Hr1G003590.1 , HORVU7Hr1G040590.1 , HORVU4Hr1G054790.2 , HORVU4Hr1G054790.1 , HORVU7Hr1G040620.2 , HORVU4Hr1G042240.2 , HORVU4Hr1G042240.1 , HORVU7Hr1G040620.5 , HORVU7Hr1G040620.4 , HORVU7Hr1G040620.1 , HORVU7Hr1G040620.3 , HORVU2Hr1G024740.1 , HORVU2Hr1G024740.2
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.003G147700 invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G364700 Sobic001G364700 Sobic010G118800 Sobic010G118800 Sobic001G364700--Sobic010G118800 Sobic005G000200 Sobic005G000200 Sobic001G364700--Sobic005G000200 Sobic001G539820 Sobic001G539820 Sobic001G364700--Sobic001G539820 Sobic005G009700 Sobic005G009700 Sobic001G364700--Sobic005G009700 Sobic007G222700 Sobic007G222700 Sobic001G364700--Sobic007G222700 Sobic007G061800 Sobic007G061800 Sobic001G364700--Sobic007G061800 Sobic002G128700 Sobic002G128700 Sobic001G364700--Sobic002G128700 Sobic003G114800 Sobic003G114800 Sobic001G364700--Sobic003G114800 Sobic002G225800 Sobic002G225800 Sobic001G364700--Sobic002G225800 Sobic010G118800--Sobic001G364700 Sobic010G118800--Sobic007G222700 Sobic010G118800--Sobic007G061800 Sobic001G222800 Sobic001G222800 Sobic010G118800--Sobic001G222800 Sobic010G118800--Sobic005G000200 Sobic008G075800 Sobic008G075800 Sobic010G118800--Sobic008G075800 Sobic010G177600 Sobic010G177600 Sobic010G118800--Sobic010G177600 Sobic010G118800--Sobic005G009700 Sobic010G118800--Sobic001G539820 Sobic005G000200--Sobic005G009700 Sobic005G000200--Sobic003G114800 Sobic004G091000 Sobic004G091000 Sobic005G000200--Sobic004G091000 Sobic005G000200--Sobic001G539820 Sobic005G000200--Sobic001G364700 Sobic003G147700 Sobic003G147700 Sobic005G000200--Sobic003G147700 Sobic001G139400 Sobic001G139400 Sobic005G000200--Sobic001G139400 Sobic007G134260 Sobic007G134260 Sobic005G000200--Sobic007G134260 Sobic005G000200--Sobic010G118800 Sobic001G539820--Sobic005G009700 Sobic001G539820--Sobic005G000200 Sobic001G539820--Sobic002G128700 Sobic001G539820--Sobic001G364700 Sobic001G539820--Sobic002G225800 Sobic001G539820--Sobic004G091000 Sobic001G539820--Sobic001G139400 Sobic004G158100 Sobic004G158100 Sobic001G539820--Sobic004G158100 Sobic007G148233 Sobic007G148233 Sobic001G539820--Sobic007G148233 Sobic005G009700--Sobic001G539820 Sobic005G009700--Sobic005G000200 Sobic005G009700--Sobic002G128700 Sobic005G009700--Sobic002G225800 Sobic005G009700--Sobic001G139400 Sobic005G009700--Sobic004G091000 Sobic005G009700--Sobic003G114800 Sobic005G009700--Sobic001G364700 Sobic005G009700--Sobic004G158100 Sobic007G222700--Sobic010G118800 Sobic007G222700--Sobic001G364700 Sobic007G222700--Sobic002G225800 Sobic007G222700--Sobic005G000200 Sobic007G222700--Sobic007G148233 Sobic007G222700--Sobic005G009700 Sobic007G222700--Sobic001G222800 Sobic007G222700--Sobic007G061800 Sobic007G222700--Sobic001G539820 Sobic007G061800--Sobic008G075800 Sobic007G061800--Sobic010G118800 Sobic007G061800--Sobic001G222800 Sobic007G061800--Sobic010G177600 Sobic007G061800--Sobic001G364700 Sobic007G061800--Sobic007G222700 Sobic006G234400 Sobic006G234400 Sobic007G061800--Sobic006G234400 Sobic009G227500 Sobic009G227500 Sobic007G061800--Sobic009G227500 Sobic010G034200 Sobic010G034200 Sobic007G061800--Sobic010G034200 Sobic002G128700--Sobic001G539820 Sobic002G128700--Sobic005G009700 Sobic002G128700--Sobic005G000200 Sobic002G128700--Sobic002G225800 Sobic006G173400 Sobic006G173400 Sobic002G128700--Sobic006G173400 Sobic002G128700--Sobic007G148233 Sobic002G128700--Sobic001G139400 Sobic002G128700--Sobic001G364700 Sobic001G539880 Sobic001G539880 Sobic002G128700--Sobic001G539880 Sobic003G114800--Sobic004G091000 Sobic003G114800--Sobic003G147700 Sobic003G114800--Sobic007G134260 Sobic003G114800--Sobic005G000200 Sobic007G103000 Sobic007G103000 Sobic003G114800--Sobic007G103000 Sobic003G232100 Sobic003G232100 Sobic003G114800--Sobic003G232100 Sobic006G270800 Sobic006G270800 Sobic003G114800--Sobic006G270800 Sobic008G079200 Sobic008G079200 Sobic003G114800--Sobic008G079200 Sobic005G122100 Sobic005G122100 Sobic003G114800--Sobic005G122100 Sobic002G225800--Sobic007G148233 Sobic003G195400 Sobic003G195400 Sobic002G225800--Sobic003G195400 Sobic002G225800--Sobic001G539880 Sobic005G035250 Sobic005G035250 Sobic002G225800--Sobic005G035250 Sobic002G225800--Sobic005G009700 Sobic002G225800--Sobic001G539820 Sobic002G225800--Sobic002G128700 Sobic002G225800--Sobic007G222700 Sobic002G225800--Sobic004G158100
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