Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G118800.1
Synonym Sb10g010490
Functional annotation -
UniProt C5Z8M8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a050495
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.010G118800


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G364700 glycosyl transferase 8 domain containing protein, putative, expressed -
2 Sobic.007G222700 - -
3 Sobic.007G061800 transporter family protein, putative, expressed -
4 Sobic.001G222800 expressed protein -
5 Sobic.005G000200 lipase, putative, expressed -
6 Sobic.008G075800 - -
7 Sobic.010G177600 glucan endo-1,3-beta-glucosidase precursor, putative, expressed -
8 Sobic.005G009700 expressed protein -
9 Sobic.001G539820 - -
10 Sobic.002G225800 paramyosin, putative, expressed -
11 Sobic.001G139400 - -
12 Sobic.003G114800 invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed -
13 Sobic.002G128700 expressed protein -
14 Sobic.008G079200 OsCML28 - Calmodulin-related calcium sensor protein, expressed K13448: calcium-binding protein CML
15 Sobic.007G148233 - -
16 Sobic.006G173400 actin-depolymerizing factor, putative, expressed K05765: cofilin
17 Sobic.004G091000 pectate lyase precursor, putative, expressed K01728: pectate lyase
18 Sobic.004G158100 phosphatidylinositol transfer, putative, expressed -
19 Sobic.003G195400 - -
20 Sobic.006G234400 DUF617 domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic010G118800 Sobic010G118800 Sobic001G364700 Sobic001G364700 Sobic010G118800--Sobic001G364700 Sobic007G222700 Sobic007G222700 Sobic010G118800--Sobic007G222700 Sobic007G061800 Sobic007G061800 Sobic010G118800--Sobic007G061800 Sobic001G222800 Sobic001G222800 Sobic010G118800--Sobic001G222800 Sobic005G000200 Sobic005G000200 Sobic010G118800--Sobic005G000200 Sobic008G075800 Sobic008G075800 Sobic010G118800--Sobic008G075800 Sobic010G177600 Sobic010G177600 Sobic010G118800--Sobic010G177600 Sobic005G009700 Sobic005G009700 Sobic010G118800--Sobic005G009700 Sobic001G539820 Sobic001G539820 Sobic010G118800--Sobic001G539820 Sobic001G364700--Sobic010G118800 Sobic001G364700--Sobic005G000200 Sobic001G364700--Sobic001G539820 Sobic001G364700--Sobic005G009700 Sobic001G364700--Sobic007G222700 Sobic001G364700--Sobic007G061800 Sobic002G128700 Sobic002G128700 Sobic001G364700--Sobic002G128700 Sobic003G114800 Sobic003G114800 Sobic001G364700--Sobic003G114800 Sobic002G225800 Sobic002G225800 Sobic001G364700--Sobic002G225800 Sobic007G222700--Sobic010G118800 Sobic007G222700--Sobic001G364700 Sobic007G222700--Sobic002G225800 Sobic007G222700--Sobic005G000200 Sobic007G148233 Sobic007G148233 Sobic007G222700--Sobic007G148233 Sobic007G222700--Sobic005G009700 Sobic007G222700--Sobic001G222800 Sobic007G222700--Sobic007G061800 Sobic007G222700--Sobic001G539820 Sobic007G061800--Sobic008G075800 Sobic007G061800--Sobic010G118800 Sobic007G061800--Sobic001G222800 Sobic007G061800--Sobic010G177600 Sobic007G061800--Sobic001G364700 Sobic007G061800--Sobic007G222700 Sobic006G234400 Sobic006G234400 Sobic007G061800--Sobic006G234400 Sobic009G227500 Sobic009G227500 Sobic007G061800--Sobic009G227500 Sobic010G034200 Sobic010G034200 Sobic007G061800--Sobic010G034200 Sobic001G222800--Sobic008G075800 Sobic001G222800--Sobic007G061800 Sobic001G222800--Sobic010G118800 Sobic001G222800--Sobic010G177600 Sobic004G287200 Sobic004G287200 Sobic001G222800--Sobic004G287200 Sobic001G222800--Sobic007G222700 Sobic001G222800--Sobic001G364700 Sobic004G331500 Sobic004G331500 Sobic001G222800--Sobic004G331500 Sobic001G222800--Sobic006G234400 Sobic005G000200--Sobic005G009700 Sobic005G000200--Sobic003G114800 Sobic004G091000 Sobic004G091000 Sobic005G000200--Sobic004G091000 Sobic005G000200--Sobic001G539820 Sobic005G000200--Sobic001G364700 Sobic003G147700 Sobic003G147700 Sobic005G000200--Sobic003G147700 Sobic001G139400 Sobic001G139400 Sobic005G000200--Sobic001G139400 Sobic007G134260 Sobic007G134260 Sobic005G000200--Sobic007G134260 Sobic005G000200--Sobic010G118800 Sobic008G075800--Sobic007G061800 Sobic008G075800--Sobic001G222800 Sobic008G075800--Sobic010G118800 Sobic008G075800--Sobic010G177600 Sobic008G075800--Sobic004G331500 Sobic009G166000 Sobic009G166000 Sobic008G075800--Sobic009G166000 Sobic008G075800--Sobic004G287200 Sobic008G075800--Sobic007G222700 Sobic008G075800--Sobic010G034200 Sobic010G177600--Sobic007G061800 Sobic010G177600--Sobic008G075800 Sobic010G177600--Sobic001G222800 Sobic010G177600--Sobic010G118800 Sobic010G177600--Sobic009G166000 Sobic010G177600--Sobic004G331500 Sobic010G177600--Sobic006G234400 Sobic010G177600--Sobic009G227500 Sobic010G177600--Sobic007G222700 Sobic005G009700--Sobic001G539820 Sobic005G009700--Sobic005G000200 Sobic005G009700--Sobic002G128700 Sobic005G009700--Sobic002G225800 Sobic005G009700--Sobic001G139400 Sobic005G009700--Sobic004G091000 Sobic005G009700--Sobic003G114800 Sobic005G009700--Sobic001G364700 Sobic004G158100 Sobic004G158100 Sobic005G009700--Sobic004G158100 Sobic001G539820--Sobic005G009700 Sobic001G539820--Sobic005G000200 Sobic001G539820--Sobic002G128700 Sobic001G539820--Sobic001G364700 Sobic001G539820--Sobic002G225800 Sobic001G539820--Sobic004G091000 Sobic001G539820--Sobic001G139400 Sobic001G539820--Sobic004G158100 Sobic001G539820--Sobic007G148233
Octagon: transcription factors


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