Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G539820.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5SC46
Pfam PF03330 PF01357
Panther DB PTHR31692 PTHR31692:SF21
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G65680 : expansin B2
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g01650.1 : expansin precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a051980 , Zm00025a021677 , Zm00025a021679 , Zm00025a021678 , Zm00025a003332 , Zm00025a003331 , Zm00025a024285 , Zm00025a021682 , Zm00025a021683 , Zm00025a021680 , Zm00025a021681
Brachypodium KQK07389
Barley HORVU0Hr1G005490.2 , HORVU0Hr1G005490.1
Wheat TraesCS2D02G459300 , TraesCS2B02G480700 , TraesCS2A02G458900
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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3 Sobic.002G128700 expressed protein -
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19 Sobic.001G539880 - -
20 Sobic.005G065300 methyltransferase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G539820 Sobic001G539820 Sobic005G009700 Sobic005G009700 Sobic001G539820--Sobic005G009700 Sobic005G000200 Sobic005G000200 Sobic001G539820--Sobic005G000200 Sobic002G128700 Sobic002G128700 Sobic001G539820--Sobic002G128700 Sobic001G364700 Sobic001G364700 Sobic001G539820--Sobic001G364700 Sobic002G225800 Sobic002G225800 Sobic001G539820--Sobic002G225800 Sobic004G091000 Sobic004G091000 Sobic001G539820--Sobic004G091000 Sobic001G139400 Sobic001G139400 Sobic001G539820--Sobic001G139400 Sobic004G158100 Sobic004G158100 Sobic001G539820--Sobic004G158100 Sobic007G148233 Sobic007G148233 Sobic001G539820--Sobic007G148233 Sobic005G009700--Sobic001G539820 Sobic005G009700--Sobic005G000200 Sobic005G009700--Sobic002G128700 Sobic005G009700--Sobic002G225800 Sobic005G009700--Sobic001G139400 Sobic005G009700--Sobic004G091000 Sobic003G114800 Sobic003G114800 Sobic005G009700--Sobic003G114800 Sobic005G009700--Sobic001G364700 Sobic005G009700--Sobic004G158100 Sobic005G000200--Sobic005G009700 Sobic005G000200--Sobic003G114800 Sobic005G000200--Sobic004G091000 Sobic005G000200--Sobic001G539820 Sobic005G000200--Sobic001G364700 Sobic003G147700 Sobic003G147700 Sobic005G000200--Sobic003G147700 Sobic005G000200--Sobic001G139400 Sobic007G134260 Sobic007G134260 Sobic005G000200--Sobic007G134260 Sobic010G118800 Sobic010G118800 Sobic005G000200--Sobic010G118800 Sobic002G128700--Sobic001G539820 Sobic002G128700--Sobic005G009700 Sobic002G128700--Sobic005G000200 Sobic002G128700--Sobic002G225800 Sobic006G173400 Sobic006G173400 Sobic002G128700--Sobic006G173400 Sobic002G128700--Sobic007G148233 Sobic002G128700--Sobic001G139400 Sobic002G128700--Sobic001G364700 Sobic001G539880 Sobic001G539880 Sobic002G128700--Sobic001G539880 Sobic001G364700--Sobic010G118800 Sobic001G364700--Sobic005G000200 Sobic001G364700--Sobic001G539820 Sobic001G364700--Sobic005G009700 Sobic007G222700 Sobic007G222700 Sobic001G364700--Sobic007G222700 Sobic007G061800 Sobic007G061800 Sobic001G364700--Sobic007G061800 Sobic001G364700--Sobic002G128700 Sobic001G364700--Sobic003G114800 Sobic001G364700--Sobic002G225800 Sobic002G225800--Sobic007G148233 Sobic003G195400 Sobic003G195400 Sobic002G225800--Sobic003G195400 Sobic002G225800--Sobic001G539880 Sobic005G035250 Sobic005G035250 Sobic002G225800--Sobic005G035250 Sobic002G225800--Sobic005G009700 Sobic002G225800--Sobic001G539820 Sobic002G225800--Sobic002G128700 Sobic002G225800--Sobic007G222700 Sobic002G225800--Sobic004G158100 Sobic004G091000--Sobic003G114800 Sobic004G091000--Sobic007G134260 Sobic007G103000 Sobic007G103000 Sobic004G091000--Sobic007G103000 Sobic003G232100 Sobic003G232100 Sobic004G091000--Sobic003G232100 Sobic004G091000--Sobic003G147700 Sobic004G091000--Sobic005G000200 Sobic006G270800 Sobic006G270800 Sobic004G091000--Sobic006G270800 Sobic005G122100 Sobic005G122100 Sobic004G091000--Sobic005G122100 Sobic004G091000--Sobic005G009700 Sobic001G139400--Sobic005G009700 Sobic001G139400--Sobic005G000200 Sobic001G139400--Sobic001G539820 Sobic001G139400--Sobic002G225800 Sobic001G139400--Sobic004G158100 Sobic001G139400--Sobic002G128700 Sobic001G139400--Sobic004G091000 Sobic001G139400--Sobic003G114800 Sobic001G139400--Sobic007G148233 Sobic004G158100--Sobic005G009700 Sobic004G158100--Sobic002G225800 Sobic004G158100--Sobic001G539820 Sobic004G158100--Sobic005G000200 Sobic004G158100--Sobic001G139400 Sobic004G158100--Sobic003G195400 Sobic004G158100--Sobic007G148233 Sobic004G158100--Sobic002G128700 Sobic004G158100--Sobic007G222700 Sobic007G148233--Sobic002G225800 Sobic007G148233--Sobic003G195400 Sobic007G148233--Sobic001G539880 Sobic007G148233--Sobic005G035250 Sobic004G024800 Sobic004G024800 Sobic007G148233--Sobic004G024800 Sobic005G035200 Sobic005G035200 Sobic007G148233--Sobic005G035200 Sobic007G148233--Sobic002G128700 Sobic007G148233--Sobic005G009700 Sobic007G148233--Sobic001G539820
Octagon: transcription factors


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