Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G009700.1
Synonym Sb05g000910
Functional annotation expressed protein
UniProt -
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g08680.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G539820 - -
2 Sobic.005G000200 lipase, putative, expressed -
3 Sobic.002G128700 expressed protein -
4 Sobic.002G225800 paramyosin, putative, expressed -
5 Sobic.001G139400 - -
6 Sobic.004G091000 pectate lyase precursor, putative, expressed K01728: pectate lyase
7 Sobic.003G114800 invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed -
8 Sobic.001G364700 glycosyl transferase 8 domain containing protein, putative, expressed -
9 Sobic.004G158100 phosphatidylinositol transfer, putative, expressed -
10 Sobic.007G134260 - -
11 Sobic.007G148233 - -
12 Sobic.007G103000 FGGY family of carbohydrate kinases, putative, expressed K00864: glpK, glycerol kinase
13 Sobic.007G222700 - -
14 Sobic.010G118800 - -
15 Sobic.003G195400 - -
16 Sobic.006G173400 actin-depolymerizing factor, putative, expressed K05765: cofilin
17 Sobic.003G147700 invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed -
18 Sobic.003G232100 - -
19 Sobic.009G089200 NAD dependent epimerase/dehydratase family domain containing protein, expressed K12450: UDP-glucose 4,6-dehydratase
20 Sobic.008G079200 OsCML28 - Calmodulin-related calcium sensor protein, expressed K13448: calcium-binding protein CML


Gene co-expression network
sample Sobic005G009700 Sobic005G009700 Sobic001G539820 Sobic001G539820 Sobic005G009700--Sobic001G539820 Sobic005G000200 Sobic005G000200 Sobic005G009700--Sobic005G000200 Sobic002G128700 Sobic002G128700 Sobic005G009700--Sobic002G128700 Sobic002G225800 Sobic002G225800 Sobic005G009700--Sobic002G225800 Sobic001G139400 Sobic001G139400 Sobic005G009700--Sobic001G139400 Sobic004G091000 Sobic004G091000 Sobic005G009700--Sobic004G091000 Sobic003G114800 Sobic003G114800 Sobic005G009700--Sobic003G114800 Sobic001G364700 Sobic001G364700 Sobic005G009700--Sobic001G364700 Sobic004G158100 Sobic004G158100 Sobic005G009700--Sobic004G158100 Sobic001G539820--Sobic005G009700 Sobic001G539820--Sobic005G000200 Sobic001G539820--Sobic002G128700 Sobic001G539820--Sobic001G364700 Sobic001G539820--Sobic002G225800 Sobic001G539820--Sobic004G091000 Sobic001G539820--Sobic001G139400 Sobic001G539820--Sobic004G158100 Sobic007G148233 Sobic007G148233 Sobic001G539820--Sobic007G148233 Sobic005G000200--Sobic005G009700 Sobic005G000200--Sobic003G114800 Sobic005G000200--Sobic004G091000 Sobic005G000200--Sobic001G539820 Sobic005G000200--Sobic001G364700 Sobic003G147700 Sobic003G147700 Sobic005G000200--Sobic003G147700 Sobic005G000200--Sobic001G139400 Sobic007G134260 Sobic007G134260 Sobic005G000200--Sobic007G134260 Sobic010G118800 Sobic010G118800 Sobic005G000200--Sobic010G118800 Sobic002G128700--Sobic001G539820 Sobic002G128700--Sobic005G009700 Sobic002G128700--Sobic005G000200 Sobic002G128700--Sobic002G225800 Sobic006G173400 Sobic006G173400 Sobic002G128700--Sobic006G173400 Sobic002G128700--Sobic007G148233 Sobic002G128700--Sobic001G139400 Sobic002G128700--Sobic001G364700 Sobic001G539880 Sobic001G539880 Sobic002G128700--Sobic001G539880 Sobic002G225800--Sobic007G148233 Sobic003G195400 Sobic003G195400 Sobic002G225800--Sobic003G195400 Sobic002G225800--Sobic001G539880 Sobic005G035250 Sobic005G035250 Sobic002G225800--Sobic005G035250 Sobic002G225800--Sobic005G009700 Sobic002G225800--Sobic001G539820 Sobic002G225800--Sobic002G128700 Sobic007G222700 Sobic007G222700 Sobic002G225800--Sobic007G222700 Sobic002G225800--Sobic004G158100 Sobic001G139400--Sobic005G009700 Sobic001G139400--Sobic005G000200 Sobic001G139400--Sobic001G539820 Sobic001G139400--Sobic002G225800 Sobic001G139400--Sobic004G158100 Sobic001G139400--Sobic002G128700 Sobic001G139400--Sobic004G091000 Sobic001G139400--Sobic003G114800 Sobic001G139400--Sobic007G148233 Sobic004G091000--Sobic003G114800 Sobic004G091000--Sobic007G134260 Sobic007G103000 Sobic007G103000 Sobic004G091000--Sobic007G103000 Sobic003G232100 Sobic003G232100 Sobic004G091000--Sobic003G232100 Sobic004G091000--Sobic003G147700 Sobic004G091000--Sobic005G000200 Sobic006G270800 Sobic006G270800 Sobic004G091000--Sobic006G270800 Sobic005G122100 Sobic005G122100 Sobic004G091000--Sobic005G122100 Sobic004G091000--Sobic005G009700 Sobic003G114800--Sobic004G091000 Sobic003G114800--Sobic003G147700 Sobic003G114800--Sobic007G134260 Sobic003G114800--Sobic005G000200 Sobic003G114800--Sobic007G103000 Sobic003G114800--Sobic003G232100 Sobic003G114800--Sobic006G270800 Sobic008G079200 Sobic008G079200 Sobic003G114800--Sobic008G079200 Sobic003G114800--Sobic005G122100 Sobic001G364700--Sobic010G118800 Sobic001G364700--Sobic005G000200 Sobic001G364700--Sobic001G539820 Sobic001G364700--Sobic005G009700 Sobic001G364700--Sobic007G222700 Sobic007G061800 Sobic007G061800 Sobic001G364700--Sobic007G061800 Sobic001G364700--Sobic002G128700 Sobic001G364700--Sobic003G114800 Sobic001G364700--Sobic002G225800 Sobic004G158100--Sobic005G009700 Sobic004G158100--Sobic002G225800 Sobic004G158100--Sobic001G539820 Sobic004G158100--Sobic005G000200 Sobic004G158100--Sobic001G139400 Sobic004G158100--Sobic003G195400 Sobic004G158100--Sobic007G148233 Sobic004G158100--Sobic002G128700 Sobic004G158100--Sobic007G222700
Octagon: transcription factors


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