Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G158100.2,Sobic.004G158100.1
Synonym SRH1, Sb04g021100, COW1
Functional annotation phosphatidylinositol transfer, putative, expressed
UniProt C5XT83 , A0A1Z5RMT9
Pfam PF03765 PF00650
Panther DB PTHR23324 PTHR23324:SF77
NCBI CDD KOG1471; Phosphatidylinositol transfer protein SEC14 and related proteins
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G34580 : Sec14p-like phosphatidylinositol transfer family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g03400.2 : phosphatidylinositol transfer, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a020447
Brachypodium KQJ94543 , PNT66407
Barley HORVU2Hr1G082530.10 , HORVU2Hr1G082530.8 , HORVU2Hr1G082530.9 , HORVU2Hr1G082530.6 , HORVU2Hr1G082530.7 , HORVU2Hr1G082530.4 , HORVU2Hr1G082530.5 , HORVU2Hr1G082530.2 , HORVU2Hr1G082530.3 , HORVU2Hr1G082530.1
Wheat TraesCS2D02G335700 , TraesCS2D02G335700 , TraesCS2D02G335700 , TraesCS2A02G327200 , TraesCS2A02G327200 , TraesCS2A02G327200 , TraesCS2B02G354800 , TraesCS2B02G354800
Populus PNT41467 , PNT41466 , PNT41468 , PNT20925


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cDNA sequences
Sobic.004G158100


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.003G147700 invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G158100 Sobic004G158100 Sobic005G009700 Sobic005G009700 Sobic004G158100--Sobic005G009700 Sobic002G225800 Sobic002G225800 Sobic004G158100--Sobic002G225800 Sobic001G539820 Sobic001G539820 Sobic004G158100--Sobic001G539820 Sobic005G000200 Sobic005G000200 Sobic004G158100--Sobic005G000200 Sobic001G139400 Sobic001G139400 Sobic004G158100--Sobic001G139400 Sobic003G195400 Sobic003G195400 Sobic004G158100--Sobic003G195400 Sobic007G148233 Sobic007G148233 Sobic004G158100--Sobic007G148233 Sobic002G128700 Sobic002G128700 Sobic004G158100--Sobic002G128700 Sobic007G222700 Sobic007G222700 Sobic004G158100--Sobic007G222700 Sobic005G009700--Sobic001G539820 Sobic005G009700--Sobic005G000200 Sobic005G009700--Sobic002G128700 Sobic005G009700--Sobic002G225800 Sobic005G009700--Sobic001G139400 Sobic004G091000 Sobic004G091000 Sobic005G009700--Sobic004G091000 Sobic003G114800 Sobic003G114800 Sobic005G009700--Sobic003G114800 Sobic001G364700 Sobic001G364700 Sobic005G009700--Sobic001G364700 Sobic005G009700--Sobic004G158100 Sobic002G225800--Sobic007G148233 Sobic002G225800--Sobic003G195400 Sobic001G539880 Sobic001G539880 Sobic002G225800--Sobic001G539880 Sobic005G035250 Sobic005G035250 Sobic002G225800--Sobic005G035250 Sobic002G225800--Sobic005G009700 Sobic002G225800--Sobic001G539820 Sobic002G225800--Sobic002G128700 Sobic002G225800--Sobic007G222700 Sobic002G225800--Sobic004G158100 Sobic001G539820--Sobic005G009700 Sobic001G539820--Sobic005G000200 Sobic001G539820--Sobic002G128700 Sobic001G539820--Sobic001G364700 Sobic001G539820--Sobic002G225800 Sobic001G539820--Sobic004G091000 Sobic001G539820--Sobic001G139400 Sobic001G539820--Sobic004G158100 Sobic001G539820--Sobic007G148233 Sobic005G000200--Sobic005G009700 Sobic005G000200--Sobic003G114800 Sobic005G000200--Sobic004G091000 Sobic005G000200--Sobic001G539820 Sobic005G000200--Sobic001G364700 Sobic003G147700 Sobic003G147700 Sobic005G000200--Sobic003G147700 Sobic005G000200--Sobic001G139400 Sobic007G134260 Sobic007G134260 Sobic005G000200--Sobic007G134260 Sobic010G118800 Sobic010G118800 Sobic005G000200--Sobic010G118800 Sobic001G139400--Sobic005G009700 Sobic001G139400--Sobic005G000200 Sobic001G139400--Sobic001G539820 Sobic001G139400--Sobic002G225800 Sobic001G139400--Sobic004G158100 Sobic001G139400--Sobic002G128700 Sobic001G139400--Sobic004G091000 Sobic001G139400--Sobic003G114800 Sobic001G139400--Sobic007G148233 Sobic003G195400--Sobic007G148233 Sobic003G195400--Sobic002G225800 Sobic003G195400--Sobic001G539880 Sobic003G195400--Sobic005G035250 Sobic005G035200 Sobic005G035200 Sobic003G195400--Sobic005G035200 Sobic004G024800 Sobic004G024800 Sobic003G195400--Sobic004G024800 Sobic007G080100 Sobic007G080100 Sobic003G195400--Sobic007G080100 Sobic003G195400--Sobic004G158100 Sobic003G195400--Sobic005G009700 Sobic007G148233--Sobic002G225800 Sobic007G148233--Sobic003G195400 Sobic007G148233--Sobic001G539880 Sobic007G148233--Sobic005G035250 Sobic007G148233--Sobic004G024800 Sobic007G148233--Sobic005G035200 Sobic007G148233--Sobic002G128700 Sobic007G148233--Sobic005G009700 Sobic007G148233--Sobic001G539820 Sobic002G128700--Sobic001G539820 Sobic002G128700--Sobic005G009700 Sobic002G128700--Sobic005G000200 Sobic002G128700--Sobic002G225800 Sobic006G173400 Sobic006G173400 Sobic002G128700--Sobic006G173400 Sobic002G128700--Sobic007G148233 Sobic002G128700--Sobic001G139400 Sobic002G128700--Sobic001G364700 Sobic002G128700--Sobic001G539880 Sobic007G222700--Sobic010G118800 Sobic007G222700--Sobic001G364700 Sobic007G222700--Sobic002G225800 Sobic007G222700--Sobic005G000200 Sobic007G222700--Sobic007G148233 Sobic007G222700--Sobic005G009700 Sobic001G222800 Sobic001G222800 Sobic007G222700--Sobic001G222800 Sobic007G061800 Sobic007G061800 Sobic007G222700--Sobic007G061800 Sobic007G222700--Sobic001G539820
Octagon: transcription factors


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