Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G024700.1
Synonym Sb01g002360, PCR2
Functional annotation uncharacterized Cys-rich domain containing protein, putative, expressed
UniProt C5WU02
Pfam PF04749
Panther DB PTHR15907 PTHR15907:SF59
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G14870 : PLANT CADMIUM RESISTANCE 2
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g61470.1 : uncharacterized Cys-rich domain containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a016383
Brachypodium -
Barley HORVU5Hr1G115870.1
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G009700 expressed protein -
2 Sobic.005G000200 lipase, putative, expressed -
3 Sobic.004G158100 phosphatidylinositol transfer, putative, expressed -
4 Sobic.004G091000 pectate lyase precursor, putative, expressed K01728: pectate lyase
5 Sobic.001G539820 - -
6 Sobic.003G114800 invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed -
7 Sobic.007G134260 - -
8 Sobic.007G103000 FGGY family of carbohydrate kinases, putative, expressed K00864: glpK, glycerol kinase
9 Sobic.001G139400 - -
10 Sobic.003G147700 invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed -
11 Sobic.002G225800 paramyosin, putative, expressed -
12 Sobic.007G222700 - -
13 Sobic.002G128700 expressed protein -
14 Sobic.008G102850 - -
15 Sobic.005G065300 methyltransferase, putative, expressed -
16 Sobic.008G079200 OsCML28 - Calmodulin-related calcium sensor protein, expressed K13448: calcium-binding protein CML
17 Sobic.003G183400 - -
18 Sobic.001G364700 glycosyl transferase 8 domain containing protein, putative, expressed -
19 Sobic.003G232100 - -
20 Sobic.007G148233 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G024700 Sobic001G024700 Sobic005G009700 Sobic005G009700 Sobic001G024700--Sobic005G009700 Sobic005G000200 Sobic005G000200 Sobic001G024700--Sobic005G000200 Sobic004G158100 Sobic004G158100 Sobic001G024700--Sobic004G158100 Sobic004G091000 Sobic004G091000 Sobic001G024700--Sobic004G091000 Sobic001G539820 Sobic001G539820 Sobic001G024700--Sobic001G539820 Sobic003G114800 Sobic003G114800 Sobic001G024700--Sobic003G114800 Sobic007G134260 Sobic007G134260 Sobic001G024700--Sobic007G134260 Sobic007G103000 Sobic007G103000 Sobic001G024700--Sobic007G103000 Sobic001G139400 Sobic001G139400 Sobic001G024700--Sobic001G139400 Sobic005G009700--Sobic001G539820 Sobic005G009700--Sobic005G000200 Sobic002G128700 Sobic002G128700 Sobic005G009700--Sobic002G128700 Sobic002G225800 Sobic002G225800 Sobic005G009700--Sobic002G225800 Sobic005G009700--Sobic001G139400 Sobic005G009700--Sobic004G091000 Sobic005G009700--Sobic003G114800 Sobic001G364700 Sobic001G364700 Sobic005G009700--Sobic001G364700 Sobic005G009700--Sobic004G158100 Sobic005G000200--Sobic005G009700 Sobic005G000200--Sobic003G114800 Sobic005G000200--Sobic004G091000 Sobic005G000200--Sobic001G539820 Sobic005G000200--Sobic001G364700 Sobic003G147700 Sobic003G147700 Sobic005G000200--Sobic003G147700 Sobic005G000200--Sobic001G139400 Sobic005G000200--Sobic007G134260 Sobic010G118800 Sobic010G118800 Sobic005G000200--Sobic010G118800 Sobic004G158100--Sobic005G009700 Sobic004G158100--Sobic002G225800 Sobic004G158100--Sobic001G539820 Sobic004G158100--Sobic005G000200 Sobic004G158100--Sobic001G139400 Sobic003G195400 Sobic003G195400 Sobic004G158100--Sobic003G195400 Sobic007G148233 Sobic007G148233 Sobic004G158100--Sobic007G148233 Sobic004G158100--Sobic002G128700 Sobic007G222700 Sobic007G222700 Sobic004G158100--Sobic007G222700 Sobic004G091000--Sobic003G114800 Sobic004G091000--Sobic007G134260 Sobic004G091000--Sobic007G103000 Sobic003G232100 Sobic003G232100 Sobic004G091000--Sobic003G232100 Sobic004G091000--Sobic003G147700 Sobic004G091000--Sobic005G000200 Sobic006G270800 Sobic006G270800 Sobic004G091000--Sobic006G270800 Sobic005G122100 Sobic005G122100 Sobic004G091000--Sobic005G122100 Sobic004G091000--Sobic005G009700 Sobic001G539820--Sobic005G009700 Sobic001G539820--Sobic005G000200 Sobic001G539820--Sobic002G128700 Sobic001G539820--Sobic001G364700 Sobic001G539820--Sobic002G225800 Sobic001G539820--Sobic004G091000 Sobic001G539820--Sobic001G139400 Sobic001G539820--Sobic004G158100 Sobic001G539820--Sobic007G148233 Sobic003G114800--Sobic004G091000 Sobic003G114800--Sobic003G147700 Sobic003G114800--Sobic007G134260 Sobic003G114800--Sobic005G000200 Sobic003G114800--Sobic007G103000 Sobic003G114800--Sobic003G232100 Sobic003G114800--Sobic006G270800 Sobic008G079200 Sobic008G079200 Sobic003G114800--Sobic008G079200 Sobic003G114800--Sobic005G122100 Sobic007G134260--Sobic007G103000 Sobic007G134260--Sobic005G122100 Sobic007G134260--Sobic004G091000 Sobic007G134260--Sobic003G232100 Sobic007G134260--Sobic003G114800 Sobic007G134260--Sobic003G147700 Sobic007G134260--Sobic006G270800 Sobic008G102850 Sobic008G102850 Sobic007G134260--Sobic008G102850 Sobic009G090400 Sobic009G090400 Sobic007G134260--Sobic009G090400 Sobic007G103000--Sobic007G134260 Sobic007G103000--Sobic005G122100 Sobic007G103000--Sobic004G091000 Sobic007G103000--Sobic003G232100 Sobic007G103000--Sobic003G147700 Sobic007G103000--Sobic003G114800 Sobic007G103000--Sobic008G102850 Sobic007G103000--Sobic006G270800 Sobic007G103000--Sobic009G090400 Sobic001G139400--Sobic005G009700 Sobic001G139400--Sobic005G000200 Sobic001G139400--Sobic001G539820 Sobic001G139400--Sobic002G225800 Sobic001G139400--Sobic004G158100 Sobic001G139400--Sobic002G128700 Sobic001G139400--Sobic004G091000 Sobic001G139400--Sobic003G114800 Sobic001G139400--Sobic007G148233
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.