Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G128700.2
Synonym Sb02g011100
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1W0W3R6
Pfam PF01086
Panther DB PTHR10639 PTHR10639:SF9
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016192; vesicle-mediated transport GO:0006886intracellular protein transport GO:0005198structural molecule activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G20760 : Clathrin light chain protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g27750.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a045872
Brachypodium KQK16387
Barley HORVU2Hr1G012100.2 , HORVU2Hr1G012100.1
Wheat TraesCS2B02G073000 , TraesCS2A02G058000
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G539820 - -
2 Sobic.005G009700 expressed protein -
3 Sobic.005G000200 lipase, putative, expressed -
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11 Sobic.007G222700 - -
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13 Sobic.003G195400 - -
14 Sobic.010G118800 - -
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18 Sobic.005G035250 - -
19 Sobic.007G134260 - -
20 Sobic.005G065300 methyltransferase, putative, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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