Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G102850.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R6U3
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g07450.2 : WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G103000 FGGY family of carbohydrate kinases, putative, expressed K00864: glpK, glycerol kinase
2 Sobic.007G134260 - -
3 Sobic.005G214700 - -
4 Sobic.005G122100 expressed protein -
5 Sobic.005G065300 methyltransferase, putative, expressed -
6 Sobic.003G147700 invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed -
7 Sobic.004G091000 pectate lyase precursor, putative, expressed K01728: pectate lyase
8 Sobic.003G114800 invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed -
9 Sobic.003G232100 - -
10 Sobic.009G090400 - -
11 Sobic.006G270800 EF hand family protein, putative, expressed -
12 Sobic.010G190500 - -
13 Sobic.006G173400 actin-depolymerizing factor, putative, expressed K05765: cofilin
14 Sobic.010G271600 exo70 exocyst complex subunit family protein, putative, expressed -
15 Sobic.009G089200 NAD dependent epimerase/dehydratase family domain containing protein, expressed K12450: UDP-glucose 4,6-dehydratase
16 Sobic.002G427500 pectinesterase, putative, expressed K01051: pectinesterase
17 Sobic.006G127800 armadillo/beta-catenin repeat family protein, putative, expressed -
18 Sobic.007G222200 - -
19 Sobic.002G157900 - -
20 Sobic.005G000200 lipase, putative, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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