Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G048900.1,Sobic.004G048900.2
Synonym ATMYOS1, Sb04g004170, ATM4, ATM2
Functional annotation myosin heavy chain, putative, expressed
UniProt A0A1Z5RL13 , A0A1Z5RL65
Pfam -
Panther DB PTHR13140 PTHR13140:SF384
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G54280 : P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein,myosin 2
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g06510.1 : myosin heavy chain, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a034854
Brachypodium PNT65929 , KQJ93430
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G249400 protein kinase family protein, putative, expressed -
2 Sobic.003G254200 ATROPGEF7/ROPGEF7, putative, expressed -
3 Sobic.010G074000 expressed protein -
4 Sobic.004G031900 phosphatidylinositol transfer, putative, expressed -
5 Sobic.009G176200 expressed protein -
6 Sobic.009G072600 expressed protein -
7 Sobic.003G208900 Sad1 / UNC-like C-terminal domain containing protein, putative, expressed -
8 Sobic.010G157900 - -
9 Sobic.005G192000 receptor kinase, putative, expressed -
10 Sobic.010G261900 methyltransferase, putative, expressed -
11 Sobic.002G323200 COBRA-like protein precursor, putative, expressed -
12 Sobic.003G066300 expressed protein -
13 Sobic.005G199800 expressed protein K04730: interleukin-1 receptor-associated kinase 1
14 Sobic.004G168150 - -
15 Sobic.010G187800 expressed protein -
16 Sobic.003G211000 - -
17 Sobic.002G210150 - -
18 Sobic.002G429000 pyruvate decarboxylase isozyme 2, putative, expressed K01568: PDC, pyruvate decarboxylase
19 Sobic.002G061732 - -
20 Sobic.004G060400 ANTH/ENTH domain containing protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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