Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G252850.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RQ14
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G082300 xyloglucan fucosyltransferase, putative, expressed K13681: xyloglucan fucosyltransferase
2 Sobic.001G522800 - -
3 Sobic.001G251000 - -
4 Sobic.003G302532 - -
5 Sobic.004G348000 white-brown complex homolog protein, putative, expressed -
6 Sobic.009G125100 pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, putative, expressed K12813: pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16
7 Sobic.009G170900 ATCHX15, putative, expressed -
8 Sobic.003G307500 zinc finger A20 and AN1 domain-containing stress-associated protein, putative, expressed -
9 Sobic.004G051500 OsMADS80 - MADS-box family gene with M-alpha type-box, expressed -
10 Sobic.001G005400 - -
11 Sobic.005G200100 - -
12 Sobic.009G021000 exocyst complex component 6, putative, expressed -
13 Sobic.001G252151 - -
14 Sobic.009G042800 expressed protein -
15 Sobic.006G066050 - -
16 Sobic.002G381800 - -
17 Sobic.004G351932 - -
18 Sobic.004G059200 inactive receptor kinase At2g26730 precursor, putative, expressed -
19 Sobic.004G349500 membrane associated DUF588 domain containing protein, putative, expressed -
20 Sobic.001G272100 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic004G252850 Sobic004G252850 Sobic010G082300 Sobic010G082300 Sobic004G252850--Sobic010G082300 Sobic001G522800 Sobic001G522800 Sobic004G252850--Sobic001G522800 Sobic001G251000 Sobic001G251000 Sobic004G252850--Sobic001G251000 Sobic003G302532 Sobic003G302532 Sobic004G252850--Sobic003G302532 Sobic004G348000 Sobic004G348000 Sobic004G252850--Sobic004G348000 Sobic009G125100 Sobic009G125100 Sobic004G252850--Sobic009G125100 Sobic009G170900 Sobic009G170900 Sobic004G252850--Sobic009G170900 Sobic003G307500 Sobic003G307500 Sobic004G252850--Sobic003G307500 Sobic004G051500 Sobic004G051500 Sobic004G252850--Sobic004G051500 Sobic002G381800 Sobic002G381800 Sobic010G082300--Sobic002G381800 Sobic010G082300--Sobic004G348000 Sobic010G082300--Sobic004G252850 Sobic009G176200 Sobic009G176200 Sobic010G082300--Sobic009G176200 Sobic010G082300--Sobic003G307500 Sobic010G082300--Sobic009G125100 Sobic010G082300--Sobic001G251000 Sobic004G031900 Sobic004G031900 Sobic010G082300--Sobic004G031900 Sobic003G054800 Sobic003G054800 Sobic010G082300--Sobic003G054800 Sobic001G522800--Sobic003G307500 Sobic001G522800--Sobic004G051500 Sobic001G522800--Sobic004G252850 Sobic009G021000 Sobic009G021000 Sobic001G522800--Sobic009G021000 Sobic001G522800--Sobic009G125100 Sobic009G042800 Sobic009G042800 Sobic001G522800--Sobic009G042800 Sobic002G015200 Sobic002G015200 Sobic001G522800--Sobic002G015200 Sobic006G066050 Sobic006G066050 Sobic001G522800--Sobic006G066050 Sobic004G351932 Sobic004G351932 Sobic001G522800--Sobic004G351932 Sobic005G200100 Sobic005G200100 Sobic001G251000--Sobic005G200100 Sobic001G251000--Sobic004G348000 Sobic001G251000--Sobic003G302532 Sobic001G252151 Sobic001G252151 Sobic001G251000--Sobic001G252151 Sobic004G059200 Sobic004G059200 Sobic001G251000--Sobic004G059200 Sobic001G251000--Sobic009G125100 Sobic001G251000--Sobic004G252850 Sobic010G026200 Sobic010G026200 Sobic001G251000--Sobic010G026200 Sobic003G406060 Sobic003G406060 Sobic001G251000--Sobic003G406060 Sobic003G302532--Sobic001G251000 Sobic003G302532--Sobic005G200100 Sobic003G302532--Sobic004G348000 Sobic003G302532--Sobic009G125100 Sobic003G302532--Sobic004G059200 Sobic003G302532--Sobic001G252151 Sobic003G302532--Sobic004G252850 Sobic010G217700 Sobic010G217700 Sobic003G302532--Sobic010G217700 Sobic001G272100 Sobic001G272100 Sobic003G302532--Sobic001G272100 Sobic004G348000--Sobic004G059200 Sobic004G348000--Sobic001G251000 Sobic004G348000--Sobic009G125100 Sobic004G060400 Sobic004G060400 Sobic004G348000--Sobic004G060400 Sobic007G161100 Sobic007G161100 Sobic004G348000--Sobic007G161100 Sobic004G348000--Sobic009G176200 Sobic004G348000--Sobic005G200100 Sobic005G039000 Sobic005G039000 Sobic004G348000--Sobic005G039000 Sobic001G196400 Sobic001G196400 Sobic004G348000--Sobic001G196400 Sobic009G125100--Sobic009G042800 Sobic009G125100--Sobic004G059200 Sobic009G125100--Sobic009G021000 Sobic009G125100--Sobic004G348000 Sobic009G125100--Sobic006G066050 Sobic002G087600 Sobic002G087600 Sobic009G125100--Sobic002G087600 Sobic009G125100--Sobic007G161100 Sobic009G125100--Sobic001G272100 Sobic009G125100--Sobic002G015200 Sobic005G160801 Sobic005G160801 Sobic009G170900--Sobic005G160801 Sobic007G136000 Sobic007G136000 Sobic009G170900--Sobic007G136000 Sobic009G170900--Sobic004G252850 Sobic004G200100 Sobic004G200100 Sobic009G170900--Sobic004G200100 Sobic009G170900--Sobic001G251000 Sobic009G170900--Sobic003G406060 Sobic009G170900--Sobic010G082300 Sobic009G170900--Sobic005G200100 Sobic009G170900--Sobic002G381800 Sobic003G307500--Sobic001G522800 Sobic003G307500--Sobic009G021000 Sobic003G307500--Sobic002G015200 Sobic003G307500--Sobic009G042800 Sobic003G307500--Sobic009G125100 Sobic003G307500--Sobic006G066050 Sobic003G307500--Sobic002G087600 Sobic003G307500--Sobic010G082300 Sobic003G307500--Sobic003G054800 Sobic004G051500--Sobic001G522800 Sobic004G051500--Sobic004G252850 Sobic004G051500--Sobic003G307500 Sobic004G349500 Sobic004G349500 Sobic004G051500--Sobic004G349500 Sobic004G051500--Sobic004G351932 Sobic001G005400 Sobic001G005400 Sobic004G051500--Sobic001G005400 Sobic004G051500--Sobic009G021000 Sobic004G051500--Sobic006G066050 Sobic004G051500--Sobic010G082300
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.