Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G349500.1
Synonym Sb04g037620
Functional annotation membrane associated DUF588 domain containing protein, putative, expressed
UniProt A0A194YT21
Pfam PF04535
Panther DB PTHR36488 PTHR36488:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g42970.1 : membrane associated DUF588 domain containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G096566 - -
2 Sobic.001G005400 - -
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8 Sobic.004G251701 - -
9 Sobic.002G105501 - -
10 Sobic.010G082300 xyloglucan fucosyltransferase, putative, expressed K13681: xyloglucan fucosyltransferase
11 Sobic.007G220066 - -
12 Sobic.002G381800 - -
13 Sobic.005G151000 protein kinase domain containing protein, expressed -
14 Sobic.009G021000 exocyst complex component 6, putative, expressed -
15 Sobic.009G125100 pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, putative, expressed K12813: pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16
16 Sobic.009G042800 expressed protein -
17 Sobic.006G066050 - -
18 Sobic.001G293550 - -
19 Sobic.009G170900 ATCHX15, putative, expressed -
20 Sobic.002G015200 OsFBO11 - F-box and other domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G349500 Sobic004G349500 Sobic009G096566 Sobic009G096566 Sobic004G349500--Sobic009G096566 Sobic001G005400 Sobic001G005400 Sobic004G349500--Sobic001G005400 Sobic004G351932 Sobic004G351932 Sobic004G349500--Sobic004G351932 Sobic001G522800 Sobic001G522800 Sobic004G349500--Sobic001G522800 Sobic004G051500 Sobic004G051500 Sobic004G349500--Sobic004G051500 Sobic004G252850 Sobic004G252850 Sobic004G349500--Sobic004G252850 Sobic003G307500 Sobic003G307500 Sobic004G349500--Sobic003G307500 Sobic004G251701 Sobic004G251701 Sobic004G349500--Sobic004G251701 Sobic002G105501 Sobic002G105501 Sobic004G349500--Sobic002G105501 Sobic009G096566--Sobic004G349500 Sobic009G096566--Sobic001G005400 Sobic009G096566--Sobic004G351932 Sobic009G096566--Sobic002G105501 Sobic007G220066 Sobic007G220066 Sobic009G096566--Sobic007G220066 Sobic009G096566--Sobic004G051500 Sobic009G096566--Sobic001G522800 Sobic009G096566--Sobic004G252850 Sobic005G151000 Sobic005G151000 Sobic009G096566--Sobic005G151000 Sobic001G005400--Sobic004G349500 Sobic001G005400--Sobic009G096566 Sobic001G005400--Sobic004G351932 Sobic001G005400--Sobic004G252850 Sobic001G005400--Sobic001G522800 Sobic001G005400--Sobic004G051500 Sobic002G381800 Sobic002G381800 Sobic001G005400--Sobic002G381800 Sobic010G082300 Sobic010G082300 Sobic001G005400--Sobic010G082300 Sobic001G005400--Sobic003G307500 Sobic004G351932--Sobic004G349500 Sobic004G351932--Sobic009G096566 Sobic004G351932--Sobic001G005400 Sobic004G351932--Sobic001G522800 Sobic004G351932--Sobic004G051500 Sobic004G351932--Sobic004G252850 Sobic004G351932--Sobic003G307500 Sobic004G351932--Sobic010G082300 Sobic004G351932--Sobic004G251701 Sobic001G522800--Sobic003G307500 Sobic001G522800--Sobic004G051500 Sobic001G522800--Sobic004G252850 Sobic009G021000 Sobic009G021000 Sobic001G522800--Sobic009G021000 Sobic009G125100 Sobic009G125100 Sobic001G522800--Sobic009G125100 Sobic009G042800 Sobic009G042800 Sobic001G522800--Sobic009G042800 Sobic002G015200 Sobic002G015200 Sobic001G522800--Sobic002G015200 Sobic006G066050 Sobic006G066050 Sobic001G522800--Sobic006G066050 Sobic001G522800--Sobic004G351932 Sobic004G051500--Sobic001G522800 Sobic004G051500--Sobic004G252850 Sobic004G051500--Sobic003G307500 Sobic004G051500--Sobic004G349500 Sobic004G051500--Sobic004G351932 Sobic004G051500--Sobic001G005400 Sobic004G051500--Sobic009G021000 Sobic004G051500--Sobic006G066050 Sobic004G051500--Sobic010G082300 Sobic004G252850--Sobic010G082300 Sobic004G252850--Sobic001G522800 Sobic001G251000 Sobic001G251000 Sobic004G252850--Sobic001G251000 Sobic003G302532 Sobic003G302532 Sobic004G252850--Sobic003G302532 Sobic004G348000 Sobic004G348000 Sobic004G252850--Sobic004G348000 Sobic004G252850--Sobic009G125100 Sobic009G170900 Sobic009G170900 Sobic004G252850--Sobic009G170900 Sobic004G252850--Sobic003G307500 Sobic004G252850--Sobic004G051500 Sobic003G307500--Sobic001G522800 Sobic003G307500--Sobic009G021000 Sobic003G307500--Sobic002G015200 Sobic003G307500--Sobic009G042800 Sobic003G307500--Sobic009G125100 Sobic003G307500--Sobic006G066050 Sobic002G087600 Sobic002G087600 Sobic003G307500--Sobic002G087600 Sobic003G307500--Sobic010G082300 Sobic003G054800 Sobic003G054800 Sobic003G307500--Sobic003G054800 Sobic004G251701--Sobic001G522800 Sobic004G251701--Sobic003G307500 Sobic004G251701--Sobic009G042800 Sobic004G251701--Sobic004G051500 Sobic004G251701--Sobic004G252850 Sobic010G276500 Sobic010G276500 Sobic004G251701--Sobic010G276500 Sobic004G251701--Sobic009G021000 Sobic004G251701--Sobic006G066050 Sobic004G251701--Sobic009G125100 Sobic002G105501--Sobic007G220066 Sobic009G066000 Sobic009G066000 Sobic002G105501--Sobic009G066000 Sobic007G139950 Sobic007G139950 Sobic002G105501--Sobic007G139950 Sobic002G105501--Sobic009G096566 Sobic006G115400 Sobic006G115400 Sobic002G105501--Sobic006G115400 Sobic003G386350 Sobic003G386350 Sobic002G105501--Sobic003G386350 Sobic002G105501--Sobic004G349500 Sobic003G331550 Sobic003G331550 Sobic002G105501--Sobic003G331550 Sobic010G046200 Sobic010G046200 Sobic002G105501--Sobic010G046200
Octagon: transcription factors


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