Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G160801.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RIU7
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G170900 ATCHX15, putative, expressed -
2 Sobic.007G136000 - -
3 Sobic.004G200100 leucine-rich repeat family protein, putative, expressed -
4 Sobic.002G381800 - -
5 Sobic.004G252850 - -
6 Sobic.010G082300 xyloglucan fucosyltransferase, putative, expressed K13681: xyloglucan fucosyltransferase
7 Sobic.001G005400 - -
8 Sobic.005G067200 expressed protein -
9 Sobic.003G394000 - -
10 Sobic.003G406060 - -
11 Sobic.001G251000 - -
12 Sobic.006G189600 - -
13 Sobic.005G200100 - -
14 Sobic.007G125200 cell division cycle protein 48, putative, expressed K13525: VCP, transitional endoplasmic reticulum ATPase
15 Sobic.004G348000 white-brown complex homolog protein, putative, expressed -
16 Sobic.003G270900 expressed protein -
17 Sobic.003G302532 - -
18 Sobic.003G078000 - -
19 Sobic.005G198600 OsFBX422 - F-box domain containing protein, expressed -
20 Sobic.003G302600 Interacting factor of CBLs(PubMedID : 19860013)@CAMK_KIN1/SNF1/Nim1_like.1 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed K07198: PRKAA, 5'-AMP-activated protein kinase, catalytic alpha subunit


Gene co-expression network
sample Sobic005G160801 Sobic005G160801 Sobic009G170900 Sobic009G170900 Sobic005G160801--Sobic009G170900 Sobic007G136000 Sobic007G136000 Sobic005G160801--Sobic007G136000 Sobic004G200100 Sobic004G200100 Sobic005G160801--Sobic004G200100 Sobic002G381800 Sobic002G381800 Sobic005G160801--Sobic002G381800 Sobic004G252850 Sobic004G252850 Sobic005G160801--Sobic004G252850 Sobic010G082300 Sobic010G082300 Sobic005G160801--Sobic010G082300 Sobic001G005400 Sobic001G005400 Sobic005G160801--Sobic001G005400 Sobic005G067200 Sobic005G067200 Sobic005G160801--Sobic005G067200 Sobic003G394000 Sobic003G394000 Sobic005G160801--Sobic003G394000 Sobic009G170900--Sobic005G160801 Sobic009G170900--Sobic007G136000 Sobic009G170900--Sobic004G252850 Sobic009G170900--Sobic004G200100 Sobic001G251000 Sobic001G251000 Sobic009G170900--Sobic001G251000 Sobic003G406060 Sobic003G406060 Sobic009G170900--Sobic003G406060 Sobic009G170900--Sobic010G082300 Sobic005G200100 Sobic005G200100 Sobic009G170900--Sobic005G200100 Sobic009G170900--Sobic002G381800 Sobic007G136000--Sobic009G170900 Sobic007G136000--Sobic005G160801 Sobic007G136000--Sobic004G200100 Sobic007G136000--Sobic005G067200 Sobic003G078000 Sobic003G078000 Sobic007G136000--Sobic003G078000 Sobic006G189600 Sobic006G189600 Sobic007G136000--Sobic006G189600 Sobic007G136000--Sobic003G406060 Sobic005G198600 Sobic005G198600 Sobic007G136000--Sobic005G198600 Sobic007G136000--Sobic003G394000 Sobic004G200100--Sobic003G394000 Sobic004G200100--Sobic009G170900 Sobic004G200100--Sobic007G136000 Sobic004G234000 Sobic004G234000 Sobic004G200100--Sobic004G234000 Sobic004G200100--Sobic002G381800 Sobic004G200100--Sobic005G160801 Sobic004G200100--Sobic010G082300 Sobic004G060400 Sobic004G060400 Sobic004G200100--Sobic004G060400 Sobic004G348000 Sobic004G348000 Sobic004G200100--Sobic004G348000 Sobic002G381800--Sobic010G082300 Sobic003G302600 Sobic003G302600 Sobic002G381800--Sobic003G302600 Sobic009G176200 Sobic009G176200 Sobic002G381800--Sobic009G176200 Sobic002G381800--Sobic001G005400 Sobic003G061600 Sobic003G061600 Sobic002G381800--Sobic003G061600 Sobic002G381800--Sobic004G252850 Sobic002G381800--Sobic004G348000 Sobic003G211000 Sobic003G211000 Sobic002G381800--Sobic003G211000 Sobic002G381800--Sobic009G170900 Sobic004G252850--Sobic010G082300 Sobic001G522800 Sobic001G522800 Sobic004G252850--Sobic001G522800 Sobic004G252850--Sobic001G251000 Sobic003G302532 Sobic003G302532 Sobic004G252850--Sobic003G302532 Sobic004G252850--Sobic004G348000 Sobic009G125100 Sobic009G125100 Sobic004G252850--Sobic009G125100 Sobic004G252850--Sobic009G170900 Sobic003G307500 Sobic003G307500 Sobic004G252850--Sobic003G307500 Sobic004G051500 Sobic004G051500 Sobic004G252850--Sobic004G051500 Sobic010G082300--Sobic002G381800 Sobic010G082300--Sobic004G348000 Sobic010G082300--Sobic004G252850 Sobic010G082300--Sobic009G176200 Sobic010G082300--Sobic003G307500 Sobic010G082300--Sobic009G125100 Sobic010G082300--Sobic001G251000 Sobic004G031900 Sobic004G031900 Sobic010G082300--Sobic004G031900 Sobic003G054800 Sobic003G054800 Sobic010G082300--Sobic003G054800 Sobic004G349500 Sobic004G349500 Sobic001G005400--Sobic004G349500 Sobic009G096566 Sobic009G096566 Sobic001G005400--Sobic009G096566 Sobic004G351932 Sobic004G351932 Sobic001G005400--Sobic004G351932 Sobic001G005400--Sobic004G252850 Sobic001G005400--Sobic001G522800 Sobic001G005400--Sobic004G051500 Sobic001G005400--Sobic002G381800 Sobic001G005400--Sobic010G082300 Sobic001G005400--Sobic003G307500 Sobic003G403000 Sobic003G403000 Sobic005G067200--Sobic003G403000 Sobic005G067200--Sobic007G136000 Sobic002G068701 Sobic002G068701 Sobic005G067200--Sobic002G068701 Sobic009G044200 Sobic009G044200 Sobic005G067200--Sobic009G044200 Sobic004G218200 Sobic004G218200 Sobic005G067200--Sobic004G218200 Sobic004G281500 Sobic004G281500 Sobic005G067200--Sobic004G281500 Sobic001G407300 Sobic001G407300 Sobic005G067200--Sobic001G407300 Sobic010G279600 Sobic010G279600 Sobic005G067200--Sobic010G279600 Sobic005G067200--Sobic004G200100 Sobic003G394000--Sobic004G200100 Sobic003G394000--Sobic003G406060 Sobic003G394000--Sobic005G200100 Sobic003G394000--Sobic001G251000 Sobic010G074000 Sobic010G074000 Sobic003G394000--Sobic010G074000 Sobic003G394000--Sobic004G060400 Sobic002G027901 Sobic002G027901 Sobic003G394000--Sobic002G027901 Sobic003G394000--Sobic004G348000 Sobic003G254200 Sobic003G254200 Sobic003G394000--Sobic003G254200
Octagon: transcription factors


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