Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G209500.1
Synonym Sb01g018510
Functional annotation RIPER9 - Ripening-related family protein precursor, putative, expressed
UniProt C5WXE1
Pfam -
Panther DB PTHR33191 PTHR33191:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g34902.1 : RIPER9 - Ripening-related family protein precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a009514 , Zm00025a057224 , Zm00025a009513 , Zm00025a017510
Brachypodium PNT67620
Barley HORVU1Hr1G044260.1 , HORVU4Hr1G072390.1
Wheat TraesCS6A02G018800
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G101850 - -
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20 Sobic.006G059400 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G209500 Sobic001G209500 Sobic008G101850 Sobic008G101850 Sobic001G209500--Sobic008G101850 Sobic005G208600 Sobic005G208600 Sobic001G209500--Sobic005G208600 Sobic005G207200 Sobic005G207200 Sobic001G209500--Sobic005G207200 Sobic002G402100 Sobic002G402100 Sobic001G209500--Sobic002G402100 Sobic001G215201 Sobic001G215201 Sobic001G209500--Sobic001G215201 Sobic001G246800 Sobic001G246800 Sobic001G209500--Sobic001G246800 Sobic004G294000 Sobic004G294000 Sobic001G209500--Sobic004G294000 Sobic004G289200 Sobic004G289200 Sobic001G209500--Sobic004G289200 Sobic006G067300 Sobic006G067300 Sobic001G209500--Sobic006G067300 Sobic008G101850--Sobic001G215201 Sobic004G089400 Sobic004G089400 Sobic008G101850--Sobic004G089400 Sobic005G006701 Sobic005G006701 Sobic008G101850--Sobic005G006701 Sobic002G260100 Sobic002G260100 Sobic008G101850--Sobic002G260100 Sobic008G101850--Sobic001G209500 Sobic004G149200 Sobic004G149200 Sobic008G101850--Sobic004G149200 Sobic008G101850--Sobic006G067300 Sobic003G062900 Sobic003G062900 Sobic008G101850--Sobic003G062900 Sobic006G059400 Sobic006G059400 Sobic008G101850--Sobic006G059400 Sobic005G208600--Sobic001G209500 Sobic005G208600--Sobic004G294000 Sobic005G208600--Sobic008G101850 Sobic005G208801 Sobic005G208801 Sobic005G208600--Sobic005G208801 Sobic005G208600--Sobic004G289200 Sobic010G048933 Sobic010G048933 Sobic005G208600--Sobic010G048933 Sobic005G208600--Sobic001G215201 Sobic001G303750 Sobic001G303750 Sobic005G208600--Sobic001G303750 Sobic001G116300 Sobic001G116300 Sobic005G208600--Sobic001G116300 Sobic005G070000 Sobic005G070000 Sobic005G207200--Sobic005G070000 Sobic006G124500 Sobic006G124500 Sobic005G207200--Sobic006G124500 Sobic006G015700 Sobic006G015700 Sobic005G207200--Sobic006G015700 Sobic007G083500 Sobic007G083500 Sobic005G207200--Sobic007G083500 Sobic009G067100 Sobic009G067100 Sobic005G207200--Sobic009G067100 Sobic001G332100 Sobic001G332100 Sobic005G207200--Sobic001G332100 Sobic002G096700 Sobic002G096700 Sobic005G207200--Sobic002G096700 Sobic004G174600 Sobic004G174600 Sobic005G207200--Sobic004G174600 Sobic003G212700 Sobic003G212700 Sobic005G207200--Sobic003G212700 Sobic002G402100--Sobic005G207200 Sobic002G402100--Sobic001G209500 Sobic002G402100--Sobic001G246800 Sobic002G402100--Sobic005G070000 Sobic007G133766 Sobic007G133766 Sobic002G402100--Sobic007G133766 Sobic002G402100--Sobic008G101850 Sobic002G402100--Sobic004G174600 Sobic010G252550 Sobic010G252550 Sobic002G402100--Sobic010G252550 Sobic005G198600 Sobic005G198600 Sobic002G402100--Sobic005G198600 Sobic001G215201--Sobic004G089400 Sobic001G215201--Sobic008G101850 Sobic001G215201--Sobic002G260100 Sobic001G215201--Sobic006G059400 Sobic001G215201--Sobic004G149200 Sobic001G215201--Sobic003G062900 Sobic003G070200 Sobic003G070200 Sobic001G215201--Sobic003G070200 Sobic001G359100 Sobic001G359100 Sobic001G215201--Sobic001G359100 Sobic001G153800 Sobic001G153800 Sobic001G215201--Sobic001G153800 Sobic008G084000 Sobic008G084000 Sobic001G246800--Sobic008G084000 Sobic001G246800--Sobic005G070000 Sobic007G139850 Sobic007G139850 Sobic001G246800--Sobic007G139850 Sobic009G021050 Sobic009G021050 Sobic001G246800--Sobic009G021050 Sobic004G150901 Sobic004G150901 Sobic001G246800--Sobic004G150901 Sobic010G138600 Sobic010G138600 Sobic001G246800--Sobic010G138600 Sobic009G253600 Sobic009G253600 Sobic001G246800--Sobic009G253600 Sobic005G152550 Sobic005G152550 Sobic001G246800--Sobic005G152550 Sobic001G135650 Sobic001G135650 Sobic001G246800--Sobic001G135650 Sobic004G294000--Sobic010G048933 Sobic004G294000--Sobic005G208801 Sobic004G294000--Sobic001G303750 Sobic004G294000--Sobic001G116300 Sobic004G294000--Sobic001G209500 Sobic004G294000--Sobic005G208600 Sobic004G294000--Sobic004G289200 Sobic007G044000 Sobic007G044000 Sobic004G294000--Sobic007G044000 Sobic002G071700 Sobic002G071700 Sobic004G294000--Sobic002G071700 Sobic004G289200--Sobic001G116300 Sobic002G007400 Sobic002G007400 Sobic004G289200--Sobic002G007400 Sobic004G289200--Sobic001G303750 Sobic002G129500 Sobic002G129500 Sobic004G289200--Sobic002G129500 Sobic004G289200--Sobic005G208801 Sobic006G251301 Sobic006G251301 Sobic004G289200--Sobic006G251301 Sobic004G289200--Sobic008G101850 Sobic003G162500 Sobic003G162500 Sobic004G289200--Sobic003G162500 Sobic003G206100 Sobic003G206100 Sobic004G289200--Sobic003G206100 Sobic006G067300--Sobic005G006701 Sobic003G164300 Sobic003G164300 Sobic006G067300--Sobic003G164300 Sobic006G067300--Sobic004G089400 Sobic010G043300 Sobic010G043300 Sobic006G067300--Sobic010G043300 Sobic009G180300 Sobic009G180300 Sobic006G067300--Sobic009G180300 Sobic006G067300--Sobic004G149200 Sobic007G010350 Sobic007G010350 Sobic006G067300--Sobic007G010350 Sobic008G057500 Sobic008G057500 Sobic006G067300--Sobic008G057500 Sobic001G092700 Sobic001G092700 Sobic006G067300--Sobic001G092700
Octagon: transcription factors


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