Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G212700.1
Synonym Sb03g027240, GEX3
Functional annotation expressed protein
UniProt C5XQB4
Pfam -
Panther DB PTHR37253
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G16020 : gamete-expressed 3
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g42060.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a028641
Brachypodium KQK08637
Barley HORVU3Hr1G052940.4
Wheat TraesCS3B02G246500 , TraesCS3A02G214800
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G015700 expressed protein -
2 Sobic.005G207200 OsFBX101 - F-box domain containing protein, expressed -
3 Sobic.006G067300 OsFBX103 - F-box domain containing protein, expressed -
4 Sobic.003G164300 cullin, putative, expressed K03347: CUL1, cullin 1
5 Sobic.007G083500 speckle-type POZ protein, putative, expressed K10523: speckle-type POZ protein
6 Sobic.006G124500 Regulator of chromosome condensation domain containing protein, expressed -
7 Sobic.009G067100 cytochrome P450, putative, expressed -
8 Sobic.005G125400 C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein, expressed -
9 Sobic.008G163900 OsFBX358 - F-box domain containing protein, expressed -
10 Sobic.007G219300 BURP domain containing protein, expressed -
11 Sobic.001G355300 aldose 1-epimerase, putative, expressed K01785: galM, aldose 1-epimerase
12 Sobic.003G180700 major facilitator superfamily antiporter, putative, expressed -
13 Sobic.002G007500 3-5 exonuclease domain-containing protein, putative, expressed -
14 Sobic.008G101850 - -
15 Sobic.010G261800 OsMADS16 - MADS-box family gene with MIKCc type-box, expressed K09264: MADS-box transcription factor, plant
16 Sobic.007G010350 - -
17 Sobic.002G298500 LTPL63 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, putative, expressed -
18 Sobic.010G043300 expressed protein -
19 Sobic.001G092650 - -
20 Sobic.002G121100 OsSCP56 - Putative Serine Carboxypeptidase homologue, expressed K16296: serine carboxypeptidase-like clade I


Gene co-expression network
sample Sobic003G212700 Sobic003G212700 Sobic006G015700 Sobic006G015700 Sobic003G212700--Sobic006G015700 Sobic005G207200 Sobic005G207200 Sobic003G212700--Sobic005G207200 Sobic006G067300 Sobic006G067300 Sobic003G212700--Sobic006G067300 Sobic003G164300 Sobic003G164300 Sobic003G212700--Sobic003G164300 Sobic007G083500 Sobic007G083500 Sobic003G212700--Sobic007G083500 Sobic006G124500 Sobic006G124500 Sobic003G212700--Sobic006G124500 Sobic009G067100 Sobic009G067100 Sobic003G212700--Sobic009G067100 Sobic005G125400 Sobic005G125400 Sobic003G212700--Sobic005G125400 Sobic008G163900 Sobic008G163900 Sobic003G212700--Sobic008G163900 Sobic006G015700--Sobic006G124500 Sobic006G015700--Sobic007G083500 Sobic006G015700--Sobic009G067100 Sobic006G018000 Sobic006G018000 Sobic006G015700--Sobic006G018000 Sobic002G298500 Sobic002G298500 Sobic006G015700--Sobic002G298500 Sobic002G123400 Sobic002G123400 Sobic006G015700--Sobic002G123400 Sobic003G180700 Sobic003G180700 Sobic006G015700--Sobic003G180700 Sobic001G355300 Sobic001G355300 Sobic006G015700--Sobic001G355300 Sobic003G354850 Sobic003G354850 Sobic006G015700--Sobic003G354850 Sobic005G070000 Sobic005G070000 Sobic005G207200--Sobic005G070000 Sobic005G207200--Sobic006G124500 Sobic005G207200--Sobic006G015700 Sobic005G207200--Sobic007G083500 Sobic005G207200--Sobic009G067100 Sobic001G332100 Sobic001G332100 Sobic005G207200--Sobic001G332100 Sobic002G096700 Sobic002G096700 Sobic005G207200--Sobic002G096700 Sobic004G174600 Sobic004G174600 Sobic005G207200--Sobic004G174600 Sobic005G207200--Sobic003G212700 Sobic005G006701 Sobic005G006701 Sobic006G067300--Sobic005G006701 Sobic006G067300--Sobic003G164300 Sobic004G089400 Sobic004G089400 Sobic006G067300--Sobic004G089400 Sobic010G043300 Sobic010G043300 Sobic006G067300--Sobic010G043300 Sobic009G180300 Sobic009G180300 Sobic006G067300--Sobic009G180300 Sobic004G149200 Sobic004G149200 Sobic006G067300--Sobic004G149200 Sobic007G010350 Sobic007G010350 Sobic006G067300--Sobic007G010350 Sobic008G057500 Sobic008G057500 Sobic006G067300--Sobic008G057500 Sobic001G092700 Sobic001G092700 Sobic006G067300--Sobic001G092700 Sobic003G164300--Sobic010G043300 Sobic003G164300--Sobic007G010350 Sobic007G219300 Sobic007G219300 Sobic003G164300--Sobic007G219300 Sobic003G164300--Sobic006G067300 Sobic003G164300--Sobic003G180700 Sobic003G164300--Sobic001G355300 Sobic001G092650 Sobic001G092650 Sobic003G164300--Sobic001G092650 Sobic003G164300--Sobic009G067100 Sobic003G164300--Sobic007G083500 Sobic007G083500--Sobic009G067100 Sobic007G083500--Sobic003G180700 Sobic007G083500--Sobic001G355300 Sobic007G083500--Sobic007G219300 Sobic007G083500--Sobic002G298500 Sobic007G083500--Sobic001G092650 Sobic007G083500--Sobic006G018000 Sobic007G083500--Sobic006G124500 Sobic007G083500--Sobic010G043300 Sobic006G124500--Sobic006G018000 Sobic006G124500--Sobic003G354850 Sobic005G212300 Sobic005G212300 Sobic006G124500--Sobic005G212300 Sobic002G100300 Sobic002G100300 Sobic006G124500--Sobic002G100300 Sobic003G090200 Sobic003G090200 Sobic006G124500--Sobic003G090200 Sobic006G124500--Sobic002G298500 Sobic006G124500--Sobic002G123400 Sobic006G124500--Sobic007G083500 Sobic006G124500--Sobic009G067100 Sobic009G067100--Sobic007G083500 Sobic009G067100--Sobic003G180700 Sobic009G067100--Sobic001G355300 Sobic009G067100--Sobic007G219300 Sobic009G067100--Sobic002G298500 Sobic009G067100--Sobic001G092650 Sobic009G067100--Sobic006G018000 Sobic009G067100--Sobic010G043300 Sobic009G067100--Sobic006G124500 Sobic005G125400--Sobic001G355300 Sobic005G125400--Sobic007G219300 Sobic005G125400--Sobic003G180700 Sobic005G125400--Sobic002G298500 Sobic005G125400--Sobic009G067100 Sobic005G125400--Sobic007G083500 Sobic005G125400--Sobic006G018000 Sobic005G125400--Sobic001G092650 Sobic005G125400--Sobic003G164300 Sobic004G017500 Sobic004G017500 Sobic008G163900--Sobic004G017500 Sobic002G007500 Sobic002G007500 Sobic008G163900--Sobic002G007500 Sobic008G163900--Sobic006G015700 Sobic008G163900--Sobic009G180300 Sobic010G090000 Sobic010G090000 Sobic008G163900--Sobic010G090000 Sobic010G261800 Sobic010G261800 Sobic008G163900--Sobic010G261800 Sobic008G163900--Sobic006G067300 Sobic002G121100 Sobic002G121100 Sobic008G163900--Sobic002G121100 Sobic008G163900--Sobic003G180700
Octagon: transcription factors


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