Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G094332.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RIR3
Pfam PF00069
Panther DB PTHR24361 PTHR24361:SF319
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006468; protein phosphorylation GO:0005524ATP binding GO:0004672protein kinase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G51660 : mitogen-activated protein kinase kinase 4
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g09180.1 : OsMKK5 - putative MAPKK based on amino acid sequence homology, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a049717 , Zm00025a022399
Brachypodium KQK01065 , KQK19193
Barley HORVU7Hr1G031720.2 , HORVU7Hr1G031720.3 , HORVU0Hr1G038850.2 , HORVU0Hr1G038850.3 , HORVU5Hr1G067100.1 , HORVU5Hr1G067100.3 , HORVU5Hr1G067100.2
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G141700 FAR1 family protein, expressed -
2 Sobic.003G408700 expressed protein -
3 Sobic.004G254200 sphingolipid C4-hydroxylase SUR2, putative, expressed K04713: sphinganine C4-monooxygenase
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6 Sobic.003G242500 expressed protein -
7 Sobic.005G094266 - -
8 Sobic.001G436850 - -
9 Sobic.003G389601 - -
10 Sobic.001G236950 - -
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14 Sobic.004G075301 - -
15 Sobic.006G089200 expressed protein -
16 Sobic.002G430601 - -
17 Sobic.002G218350 - -
18 Sobic.003G178101 - K09490: HSPA5, endoplasmic reticulum chaperone BiP
19 Sobic.001G146450 - -
20 Sobic.003G384650 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G094332 Sobic005G094332 Sobic010G141700 Sobic010G141700 Sobic005G094332--Sobic010G141700 Sobic003G408700 Sobic003G408700 Sobic005G094332--Sobic003G408700 Sobic004G254200 Sobic004G254200 Sobic005G094332--Sobic004G254200 Sobic001G507933 Sobic001G507933 Sobic005G094332--Sobic001G507933 Sobic008G177700 Sobic008G177700 Sobic005G094332--Sobic008G177700 Sobic003G242500 Sobic003G242500 Sobic005G094332--Sobic003G242500 Sobic005G094266 Sobic005G094266 Sobic005G094332--Sobic005G094266 Sobic001G436850 Sobic001G436850 Sobic005G094332--Sobic001G436850 Sobic003G389601 Sobic003G389601 Sobic005G094332--Sobic003G389601 Sobic010G141700--Sobic003G408700 Sobic010G141700--Sobic004G254200 Sobic010G141700--Sobic001G507933 Sobic010G141700--Sobic008G177700 Sobic010G141700--Sobic003G242500 Sobic002G430601 Sobic002G430601 Sobic010G141700--Sobic002G430601 Sobic001G018700 Sobic001G018700 Sobic010G141700--Sobic001G018700 Sobic003G408700--Sobic004G254200 Sobic003G408700--Sobic010G141700 Sobic003G408700--Sobic001G507933 Sobic003G408700--Sobic008G177700 Sobic003G408700--Sobic003G242500 Sobic003G408700--Sobic002G430601 Sobic003G408700--Sobic001G018700 Sobic004G254200--Sobic003G408700 Sobic004G254200--Sobic010G141700 Sobic004G254200--Sobic001G507933 Sobic004G254200--Sobic008G177700 Sobic004G254200--Sobic003G242500 Sobic004G254200--Sobic002G430601 Sobic004G254200--Sobic001G018700 Sobic001G507933--Sobic004G254200 Sobic001G507933--Sobic003G408700 Sobic001G507933--Sobic010G141700 Sobic001G507933--Sobic008G177700 Sobic001G507933--Sobic003G242500 Sobic001G507933--Sobic002G430601 Sobic001G507933--Sobic001G018700 Sobic008G177700--Sobic003G242500 Sobic008G177700--Sobic001G507933 Sobic008G177700--Sobic004G254200 Sobic008G177700--Sobic003G408700 Sobic008G177700--Sobic010G141700 Sobic001G030800 Sobic001G030800 Sobic008G177700--Sobic001G030800 Sobic008G177700--Sobic001G018700 Sobic003G242500--Sobic008G177700 Sobic003G242500--Sobic001G507933 Sobic003G242500--Sobic001G030800 Sobic003G242500--Sobic001G018700 Sobic005G094266--Sobic001G436850 Sobic005G094266--Sobic003G389601 Sobic001G236950 Sobic001G236950 Sobic005G094266--Sobic001G236950 Sobic007G146800 Sobic007G146800 Sobic005G094266--Sobic007G146800 Sobic003G072100 Sobic003G072100 Sobic005G094266--Sobic003G072100 Sobic010G090550 Sobic010G090550 Sobic005G094266--Sobic010G090550 Sobic005G094266--Sobic001G030800 Sobic006G089200 Sobic006G089200 Sobic005G094266--Sobic006G089200 Sobic001G338200 Sobic001G338200 Sobic005G094266--Sobic001G338200 Sobic001G436850--Sobic006G089200 Sobic008G082450 Sobic008G082450 Sobic001G436850--Sobic008G082450 Sobic001G436850--Sobic003G072100 Sobic010G140300 Sobic010G140300 Sobic001G436850--Sobic010G140300 Sobic001G436850--Sobic007G146800 Sobic001G436850--Sobic001G018700 Sobic001G040900 Sobic001G040900 Sobic003G389601--Sobic001G040900 Sobic003G389601--Sobic001G436850 Sobic003G389601--Sobic010G140300 Sobic003G389601--Sobic008G082450 Sobic003G389601--Sobic007G146800 Sobic007G023650 Sobic007G023650 Sobic003G389601--Sobic007G023650 Sobic003G389601--Sobic006G089200 Sobic003G389601--Sobic003G072100 Sobic003G389601--Sobic001G018700
Octagon: transcription factors


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