Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G517000.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt C5WZU0
Pfam -
Panther DB PTHR34573 PTHR34573:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G094332 - -
2 Sobic.010G141700 FAR1 family protein, expressed -
3 Sobic.003G408700 expressed protein -
4 Sobic.004G254200 sphingolipid C4-hydroxylase SUR2, putative, expressed K04713: sphinganine C4-monooxygenase
5 Sobic.001G507933 - -
6 Sobic.008G177700 strictosidine synthase, putative, expressed -
7 Sobic.002G039301 - -
8 Sobic.007G044000 - -
9 Sobic.003G242500 expressed protein -
10 Sobic.004G075301 - -
11 Sobic.004G179100 protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1, putative, expressed K10956: protein transport protein SEC61 subunit alpha
12 Sobic.002G430601 - -
13 Sobic.001G120700 - -
14 Sobic.010G207325 - -
15 Sobic.009G072066 - -
16 Sobic.002G397001 - -
17 Sobic.002G218350 - -
18 Sobic.007G146800 late embryogenesis abundant protein, putative, expressed -
19 Sobic.001G436850 - -
20 Sobic.010G158300 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G517000 Sobic001G517000 Sobic005G094332 Sobic005G094332 Sobic001G517000--Sobic005G094332 Sobic010G141700 Sobic010G141700 Sobic001G517000--Sobic010G141700 Sobic003G408700 Sobic003G408700 Sobic001G517000--Sobic003G408700 Sobic004G254200 Sobic004G254200 Sobic001G517000--Sobic004G254200 Sobic001G507933 Sobic001G507933 Sobic001G517000--Sobic001G507933 Sobic008G177700 Sobic008G177700 Sobic001G517000--Sobic008G177700 Sobic002G039301 Sobic002G039301 Sobic001G517000--Sobic002G039301 Sobic007G044000 Sobic007G044000 Sobic001G517000--Sobic007G044000 Sobic003G242500 Sobic003G242500 Sobic001G517000--Sobic003G242500 Sobic005G094332--Sobic010G141700 Sobic005G094332--Sobic003G408700 Sobic005G094332--Sobic004G254200 Sobic005G094332--Sobic001G507933 Sobic005G094332--Sobic008G177700 Sobic005G094332--Sobic003G242500 Sobic005G094266 Sobic005G094266 Sobic005G094332--Sobic005G094266 Sobic001G436850 Sobic001G436850 Sobic005G094332--Sobic001G436850 Sobic003G389601 Sobic003G389601 Sobic005G094332--Sobic003G389601 Sobic010G141700--Sobic003G408700 Sobic010G141700--Sobic004G254200 Sobic010G141700--Sobic001G507933 Sobic010G141700--Sobic008G177700 Sobic010G141700--Sobic003G242500 Sobic002G430601 Sobic002G430601 Sobic010G141700--Sobic002G430601 Sobic001G018700 Sobic001G018700 Sobic010G141700--Sobic001G018700 Sobic003G408700--Sobic004G254200 Sobic003G408700--Sobic010G141700 Sobic003G408700--Sobic001G507933 Sobic003G408700--Sobic008G177700 Sobic003G408700--Sobic003G242500 Sobic003G408700--Sobic002G430601 Sobic003G408700--Sobic001G018700 Sobic004G254200--Sobic003G408700 Sobic004G254200--Sobic010G141700 Sobic004G254200--Sobic001G507933 Sobic004G254200--Sobic008G177700 Sobic004G254200--Sobic003G242500 Sobic004G254200--Sobic002G430601 Sobic004G254200--Sobic001G018700 Sobic001G507933--Sobic004G254200 Sobic001G507933--Sobic003G408700 Sobic001G507933--Sobic010G141700 Sobic001G507933--Sobic008G177700 Sobic001G507933--Sobic003G242500 Sobic001G507933--Sobic002G430601 Sobic001G507933--Sobic001G018700 Sobic008G177700--Sobic003G242500 Sobic008G177700--Sobic001G507933 Sobic008G177700--Sobic004G254200 Sobic008G177700--Sobic003G408700 Sobic008G177700--Sobic010G141700 Sobic001G030800 Sobic001G030800 Sobic008G177700--Sobic001G030800 Sobic008G177700--Sobic001G018700 Sobic002G039301--Sobic001G507933 Sobic002G039301--Sobic004G254200 Sobic002G039301--Sobic003G408700 Sobic002G039301--Sobic010G141700 Sobic002G039301--Sobic008G177700 Sobic002G039301--Sobic003G242500 Sobic001G236950 Sobic001G236950 Sobic002G039301--Sobic001G236950 Sobic007G146800 Sobic007G146800 Sobic002G039301--Sobic007G146800 Sobic002G397001 Sobic002G397001 Sobic002G039301--Sobic002G397001 Sobic007G044000--Sobic010G141700 Sobic007G044000--Sobic003G408700 Sobic007G044000--Sobic004G254200 Sobic007G044000--Sobic001G507933 Sobic002G071700 Sobic002G071700 Sobic007G044000--Sobic002G071700 Sobic007G044000--Sobic008G177700 Sobic010G048933 Sobic010G048933 Sobic007G044000--Sobic010G048933 Sobic007G044000--Sobic003G242500 Sobic007G044000--Sobic002G039301 Sobic003G242500--Sobic008G177700 Sobic003G242500--Sobic001G507933 Sobic003G242500--Sobic001G030800 Sobic003G242500--Sobic001G018700
Octagon: transcription factors


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