Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G096700.1
Synonym Sb01g008655
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6QI49
Pfam PF03018
Panther DB PTHR21495 PTHR21495:SF79
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G42655 : Disease resistance-responsive (dirigent-like protein) family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g52920.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a008066
Brachypodium -
Barley HORVU5Hr1G094030.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G228500 - -
2 Sobic.001G070900 expressed protein -
3 Sobic.001G208166 - -
4 Sobic.007G187500 - -
5 Sobic.002G180200 - -
6 Sobic.004G347833 - -
7 Sobic.007G146001 - -
8 Sobic.004G067800 zinc-binding protein, putative, expressed -
9 Sobic.007G173400 - -
10 Sobic.006G147101 - -
11 Sobic.010G019500 cytochrome P450 86A1, putative, expressed -
12 Sobic.002G160300 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pyrophosphate--fructose 6-phosphate 1-phosphotransferase subunit alpha, putative, expressed K00895: pfp, diphosphate-dependent phosphofructokinase
13 Sobic.002G043201 - -
14 Sobic.002G162601 - -
15 Sobic.002G123750 - -
16 Sobic.009G183650 - -
17 Sobic.009G181000 - -
18 Sobic.006G118850 - -
19 Sobic.002G347750 - -
20 Sobic.005G110553 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G096700 Sobic001G096700 Sobic001G228500 Sobic001G228500 Sobic001G096700--Sobic001G228500 Sobic001G070900 Sobic001G070900 Sobic001G096700--Sobic001G070900 Sobic001G208166 Sobic001G208166 Sobic001G096700--Sobic001G208166 Sobic007G187500 Sobic007G187500 Sobic001G096700--Sobic007G187500 Sobic002G180200 Sobic002G180200 Sobic001G096700--Sobic002G180200 Sobic004G347833 Sobic004G347833 Sobic001G096700--Sobic004G347833 Sobic007G146001 Sobic007G146001 Sobic001G096700--Sobic007G146001 Sobic004G067800 Sobic004G067800 Sobic001G096700--Sobic004G067800 Sobic007G173400 Sobic007G173400 Sobic001G096700--Sobic007G173400 Sobic002G160300 Sobic002G160300 Sobic001G228500--Sobic002G160300 Sobic010G187950 Sobic010G187950 Sobic001G228500--Sobic010G187950 Sobic004G068600 Sobic004G068600 Sobic001G228500--Sobic004G068600 Sobic009G183650 Sobic009G183650 Sobic001G228500--Sobic009G183650 Sobic002G043201 Sobic002G043201 Sobic001G228500--Sobic002G043201 Sobic010G019500 Sobic010G019500 Sobic001G228500--Sobic010G019500 Sobic010G042300 Sobic010G042300 Sobic001G228500--Sobic010G042300 Sobic006G268100 Sobic006G268100 Sobic001G228500--Sobic006G268100 Sobic001G228500--Sobic007G173400 Sobic001G070900--Sobic002G180200 Sobic010G210400 Sobic010G210400 Sobic001G070900--Sobic010G210400 Sobic003G390000 Sobic003G390000 Sobic001G070900--Sobic003G390000 Sobic004G343733 Sobic004G343733 Sobic001G070900--Sobic004G343733 Sobic001G070900--Sobic001G208166 Sobic002G162601 Sobic002G162601 Sobic001G070900--Sobic002G162601 Sobic002G070500 Sobic002G070500 Sobic001G070900--Sobic002G070500 Sobic003G108401 Sobic003G108401 Sobic001G070900--Sobic003G108401 Sobic009G163000 Sobic009G163000 Sobic001G070900--Sobic009G163000 Sobic006G147101 Sobic006G147101 Sobic001G208166--Sobic006G147101 Sobic001G208166--Sobic002G043201 Sobic001G208166--Sobic002G162601 Sobic008G109650 Sobic008G109650 Sobic001G208166--Sobic008G109650 Sobic004G080901 Sobic004G080901 Sobic001G208166--Sobic004G080901 Sobic001G209550 Sobic001G209550 Sobic001G208166--Sobic001G209550 Sobic002G059700 Sobic002G059700 Sobic001G208166--Sobic002G059700 Sobic001G208166--Sobic001G070900 Sobic001G208166--Sobic007G173400 Sobic007G187500--Sobic002G160300 Sobic007G187500--Sobic004G347833 Sobic009G180900 Sobic009G180900 Sobic007G187500--Sobic009G180900 Sobic007G187500--Sobic001G228500 Sobic002G215600 Sobic002G215600 Sobic007G187500--Sobic002G215600 Sobic007G187500--Sobic007G173400 Sobic009G181000 Sobic009G181000 Sobic007G187500--Sobic009G181000 Sobic008G064200 Sobic008G064200 Sobic007G187500--Sobic008G064200 Sobic007G187500--Sobic010G210400 Sobic006G128450 Sobic006G128450 Sobic002G180200--Sobic006G128450 Sobic006G118850 Sobic006G118850 Sobic002G180200--Sobic006G118850 Sobic002G180200--Sobic003G108401 Sobic002G180200--Sobic004G343733 Sobic002G180200--Sobic001G070900 Sobic002G180200--Sobic009G163000 Sobic001G311400 Sobic001G311400 Sobic002G180200--Sobic001G311400 Sobic002G076450 Sobic002G076450 Sobic002G180200--Sobic002G076450 Sobic002G180200--Sobic001G208166 Sobic004G347833--Sobic007G173400 Sobic004G347833--Sobic009G180900 Sobic004G347833--Sobic007G187500 Sobic004G347833--Sobic008G064200 Sobic004G272000 Sobic004G272000 Sobic004G347833--Sobic004G272000 Sobic004G074400 Sobic004G074400 Sobic004G347833--Sobic004G074400 Sobic002G219100 Sobic002G219100 Sobic004G347833--Sobic002G219100 Sobic004G347833--Sobic001G228500 Sobic001G234766 Sobic001G234766 Sobic004G347833--Sobic001G234766 Sobic007G146001--Sobic002G162601 Sobic007G146001--Sobic001G070900 Sobic007G146001--Sobic001G096700 Sobic007G146001--Sobic001G208166 Sobic007G146001--Sobic006G147101 Sobic005G120101 Sobic005G120101 Sobic007G146001--Sobic005G120101 Sobic004G273550 Sobic004G273550 Sobic007G146001--Sobic004G273550 Sobic007G146001--Sobic001G228500 Sobic007G146001--Sobic009G183650 Sobic004G067800--Sobic008G064200 Sobic004G067800--Sobic004G347833 Sobic004G067800--Sobic007G187500 Sobic004G067800--Sobic009G180900 Sobic006G139900 Sobic006G139900 Sobic004G067800--Sobic006G139900 Sobic004G067800--Sobic001G228500 Sobic006G054200 Sobic006G054200 Sobic004G067800--Sobic006G054200 Sobic009G218450 Sobic009G218450 Sobic004G067800--Sobic009G218450 Sobic004G067800--Sobic004G074400 Sobic007G173400--Sobic004G347833 Sobic007G173400--Sobic001G234766 Sobic007G173400--Sobic004G272000 Sobic010G160850 Sobic010G160850 Sobic007G173400--Sobic010G160850 Sobic007G173400--Sobic001G228500 Sobic007G173400--Sobic001G208166 Sobic007G173400--Sobic008G064200 Sobic007G173400--Sobic007G187500 Sobic004G089801 Sobic004G089801 Sobic007G173400--Sobic004G089801
Octagon: transcription factors


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