Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G160300.1,Sobic.002G160300.2
Synonym Sb02g020400
Functional annotation SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence. (PubMedID : 27586543)
pyrophosphate--fructose 6-phosphate 1-phosphotransferase subunit alpha, putative, expressed
UniProt A0A1B6QBQ9 , C5X8X6
Pfam PF00365
Panther DB PTHR13697 PTHR13697:SF29
NCBI CDD KOG2440; Pyrophosphate-dependent phosphofructo-1-kinase
KEGG Orthology K00895; pfp, diphosphate-dependent phosphofructokinase
Gene Ontology GO:0006096; glycolytic process GO:00038726-phosphofructokinase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G76550 : Phosphofructokinase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g25720.1 : pyrophosphate--fructose 6-phosphate 1-phosphotransferase subunit alpha, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a046348 , Zm00025a006225
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS5D02G085500 , TraesCS5D02G085500 , TraesCS5D02G085500 , TraesCS5D02G085500 , TraesCS5D02G085500 , TraesCS5D02G085500 , TraesCS5B02G078300 , TraesCS5A02G072700 , TraesCS5A02G072700 , TraesCS5A02G072700 , TraesCS5A02G072700
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G228500 - -
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4 Sobic.004G074400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@disease resistance protein RPM1, putative, expressed K13457: RPM1, disease resistance protein RPM1
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15 Sobic.004G347833 - -
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17 Sobic.008G153300 RING-H2 finger protein ATL3J, putative, expressed K10663: E3 ubiquitin-protein ligase ATL4
18 Sobic.004G091300 receptor-like protein kinase precursor, putative, expressed -
19 Sobic.009G183650 - -
20 Sobic.010G042300 DTA2, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G160300 Sobic002G160300 Sobic001G228500 Sobic001G228500 Sobic002G160300--Sobic001G228500 Sobic007G187500 Sobic007G187500 Sobic002G160300--Sobic007G187500 Sobic002G099932 Sobic002G099932 Sobic002G160300--Sobic002G099932 Sobic004G074400 Sobic004G074400 Sobic002G160300--Sobic004G074400 Sobic004G068600 Sobic004G068600 Sobic002G160300--Sobic004G068600 Sobic009G181000 Sobic009G181000 Sobic002G160300--Sobic009G181000 Sobic009G180900 Sobic009G180900 Sobic002G160300--Sobic009G180900 Sobic002G321700 Sobic002G321700 Sobic002G160300--Sobic002G321700 Sobic008G147600 Sobic008G147600 Sobic002G160300--Sobic008G147600 Sobic001G228500--Sobic002G160300 Sobic010G187950 Sobic010G187950 Sobic001G228500--Sobic010G187950 Sobic001G228500--Sobic004G068600 Sobic009G183650 Sobic009G183650 Sobic001G228500--Sobic009G183650 Sobic002G043201 Sobic002G043201 Sobic001G228500--Sobic002G043201 Sobic010G019500 Sobic010G019500 Sobic001G228500--Sobic010G019500 Sobic010G042300 Sobic010G042300 Sobic001G228500--Sobic010G042300 Sobic006G268100 Sobic006G268100 Sobic001G228500--Sobic006G268100 Sobic007G173400 Sobic007G173400 Sobic001G228500--Sobic007G173400 Sobic007G187500--Sobic002G160300 Sobic004G347833 Sobic004G347833 Sobic007G187500--Sobic004G347833 Sobic007G187500--Sobic009G180900 Sobic007G187500--Sobic001G228500 Sobic002G215600 Sobic002G215600 Sobic007G187500--Sobic002G215600 Sobic007G187500--Sobic007G173400 Sobic007G187500--Sobic009G181000 Sobic008G064200 Sobic008G064200 Sobic007G187500--Sobic008G064200 Sobic010G210400 Sobic010G210400 Sobic007G187500--Sobic010G210400 Sobic002G099932--Sobic004G074400 Sobic002G099932--Sobic009G181000 Sobic002G099932--Sobic002G160300 Sobic002G099932--Sobic002G321700 Sobic009G037500 Sobic009G037500 Sobic002G099932--Sobic009G037500 Sobic001G182100 Sobic001G182100 Sobic002G099932--Sobic001G182100 Sobic002G099932--Sobic004G347833 Sobic001G496000 Sobic001G496000 Sobic002G099932--Sobic001G496000 Sobic002G099932--Sobic009G180900 Sobic004G074400--Sobic009G180900 Sobic004G279400 Sobic004G279400 Sobic004G074400--Sobic004G279400 Sobic003G068150 Sobic003G068150 Sobic004G074400--Sobic003G068150 Sobic002G208700 Sobic002G208700 Sobic004G074400--Sobic002G208700 Sobic004G074400--Sobic002G099932 Sobic004G074400--Sobic008G147600 Sobic004G074400--Sobic009G037500 Sobic007G149500 Sobic007G149500 Sobic004G074400--Sobic007G149500 Sobic002G219100 Sobic002G219100 Sobic004G074400--Sobic002G219100 Sobic004G068600--Sobic010G019500 Sobic004G267400 Sobic004G267400 Sobic004G068600--Sobic004G267400 Sobic007G183600 Sobic007G183600 Sobic004G068600--Sobic007G183600 Sobic004G315400 Sobic004G315400 Sobic004G068600--Sobic004G315400 Sobic004G072201 Sobic004G072201 Sobic004G068600--Sobic004G072201 Sobic002G374000 Sobic002G374000 Sobic004G068600--Sobic002G374000 Sobic008G103400 Sobic008G103400 Sobic004G068600--Sobic008G103400 Sobic001G383200 Sobic001G383200 Sobic004G068600--Sobic001G383200 Sobic001G424650 Sobic001G424650 Sobic004G068600--Sobic001G424650 Sobic009G181000--Sobic002G321700 Sobic009G181000--Sobic002G099932 Sobic009G181000--Sobic009G180900 Sobic009G181000--Sobic010G042300 Sobic009G181000--Sobic007G187500 Sobic002G086900 Sobic002G086900 Sobic009G181000--Sobic002G086900 Sobic009G181000--Sobic002G160300 Sobic004G091300 Sobic004G091300 Sobic009G181000--Sobic004G091300 Sobic009G181000--Sobic004G279400 Sobic009G180900--Sobic004G074400 Sobic006G027800 Sobic006G027800 Sobic009G180900--Sobic006G027800 Sobic009G180900--Sobic004G347833 Sobic009G180900--Sobic008G147600 Sobic009G180900--Sobic004G279400 Sobic009G180900--Sobic002G219100 Sobic005G150700 Sobic005G150700 Sobic009G180900--Sobic005G150700 Sobic009G218450 Sobic009G218450 Sobic009G180900--Sobic009G218450 Sobic010G175100 Sobic010G175100 Sobic009G180900--Sobic010G175100 Sobic002G321700--Sobic004G091300 Sobic002G321700--Sobic009G181000 Sobic002G321700--Sobic010G042300 Sobic002G321700--Sobic002G099932 Sobic002G321700--Sobic002G086900 Sobic002G321700--Sobic004G074400 Sobic006G279100 Sobic006G279100 Sobic002G321700--Sobic006G279100 Sobic002G321700--Sobic004G279400 Sobic002G321700--Sobic002G160300 Sobic008G147600--Sobic002G219100 Sobic008G147600--Sobic004G074400 Sobic008G147600--Sobic009G180900 Sobic008G147600--Sobic005G150700 Sobic006G165200 Sobic006G165200 Sobic008G147600--Sobic006G165200 Sobic008G147600--Sobic009G037500 Sobic010G025600 Sobic010G025600 Sobic008G147600--Sobic010G025600 Sobic009G020600 Sobic009G020600 Sobic008G147600--Sobic009G020600 Sobic008G147600--Sobic002G099932
Octagon: transcription factors


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