Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G496000.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QQD6
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G272001 - -
2 Sobic.002G099932 - -
3 Sobic.001G182100 expressed protein -
4 Sobic.002G160300 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pyrophosphate--fructose 6-phosphate 1-phosphotransferase subunit alpha, putative, expressed K00895: pfp, diphosphate-dependent phosphofructokinase
5 Sobic.001G534132 - -
6 Sobic.003G067900 - -
7 Sobic.005G185000 - -
8 Sobic.004G074400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@disease resistance protein RPM1, putative, expressed K13457: RPM1, disease resistance protein RPM1
9 Sobic.002G375000 - -
10 Sobic.001G326500 OsFBX157 - F-box domain containing protein, expressed -
11 Sobic.009G181000 - -
12 Sobic.002G123750 - -
13 Sobic.003G071800 - -
14 Sobic.003G068100 receptor kinase, putative, expressed -
15 Sobic.008G147600 - -
16 Sobic.001G432750 - -
17 Sobic.001G279800 lecithin cholesterol acyltransferase, putative, expressed -
18 Sobic.001G228500 - -
19 Sobic.006G095550 - -
20 Sobic.010G226201 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G496000 Sobic001G496000 Sobic003G272001 Sobic003G272001 Sobic001G496000--Sobic003G272001 Sobic002G099932 Sobic002G099932 Sobic001G496000--Sobic002G099932 Sobic001G182100 Sobic001G182100 Sobic001G496000--Sobic001G182100 Sobic002G160300 Sobic002G160300 Sobic001G496000--Sobic002G160300 Sobic001G534132 Sobic001G534132 Sobic001G496000--Sobic001G534132 Sobic003G067900 Sobic003G067900 Sobic001G496000--Sobic003G067900 Sobic005G185000 Sobic005G185000 Sobic001G496000--Sobic005G185000 Sobic004G074400 Sobic004G074400 Sobic001G496000--Sobic004G074400 Sobic002G375000 Sobic002G375000 Sobic001G496000--Sobic002G375000 Sobic003G272001--Sobic003G067900 Sobic003G272001--Sobic001G534132 Sobic003G272001--Sobic001G496000 Sobic001G326500 Sobic001G326500 Sobic003G272001--Sobic001G326500 Sobic003G272001--Sobic002G099932 Sobic003G068100 Sobic003G068100 Sobic003G272001--Sobic003G068100 Sobic003G272001--Sobic002G160300 Sobic005G116800 Sobic005G116800 Sobic003G272001--Sobic005G116800 Sobic008G142500 Sobic008G142500 Sobic003G272001--Sobic008G142500 Sobic002G099932--Sobic004G074400 Sobic009G181000 Sobic009G181000 Sobic002G099932--Sobic009G181000 Sobic002G099932--Sobic002G160300 Sobic002G321700 Sobic002G321700 Sobic002G099932--Sobic002G321700 Sobic009G037500 Sobic009G037500 Sobic002G099932--Sobic009G037500 Sobic002G099932--Sobic001G182100 Sobic004G347833 Sobic004G347833 Sobic002G099932--Sobic004G347833 Sobic002G099932--Sobic001G496000 Sobic009G180900 Sobic009G180900 Sobic002G099932--Sobic009G180900 Sobic001G182100--Sobic002G099932 Sobic001G234766 Sobic001G234766 Sobic001G182100--Sobic001G234766 Sobic001G182100--Sobic001G496000 Sobic006G147101 Sobic006G147101 Sobic001G182100--Sobic006G147101 Sobic009G074000 Sobic009G074000 Sobic001G182100--Sobic009G074000 Sobic005G108500 Sobic005G108500 Sobic001G182100--Sobic005G108500 Sobic008G109650 Sobic008G109650 Sobic001G182100--Sobic008G109650 Sobic001G387400 Sobic001G387400 Sobic001G182100--Sobic001G387400 Sobic001G182100--Sobic009G181000 Sobic001G228500 Sobic001G228500 Sobic002G160300--Sobic001G228500 Sobic007G187500 Sobic007G187500 Sobic002G160300--Sobic007G187500 Sobic002G160300--Sobic002G099932 Sobic002G160300--Sobic004G074400 Sobic004G068600 Sobic004G068600 Sobic002G160300--Sobic004G068600 Sobic002G160300--Sobic009G181000 Sobic002G160300--Sobic009G180900 Sobic002G160300--Sobic002G321700 Sobic008G147600 Sobic008G147600 Sobic002G160300--Sobic008G147600 Sobic001G534132--Sobic003G067900 Sobic001G534132--Sobic003G068100 Sobic001G534132--Sobic003G272001 Sobic006G159500 Sobic006G159500 Sobic001G534132--Sobic006G159500 Sobic001G534132--Sobic005G185000 Sobic003G267150 Sobic003G267150 Sobic001G534132--Sobic003G267150 Sobic002G160500 Sobic002G160500 Sobic001G534132--Sobic002G160500 Sobic003G067900--Sobic001G534132 Sobic003G067900--Sobic003G068100 Sobic003G067900--Sobic003G272001 Sobic003G067900--Sobic005G116800 Sobic006G083050 Sobic006G083050 Sobic003G067900--Sobic006G083050 Sobic003G067900--Sobic006G159500 Sobic003G067900--Sobic008G142500 Sobic004G264900 Sobic004G264900 Sobic003G067900--Sobic004G264900 Sobic009G115800 Sobic009G115800 Sobic003G067900--Sobic009G115800 Sobic005G185000--Sobic001G534132 Sobic005G185000--Sobic003G067900 Sobic005G185000--Sobic003G068100 Sobic005G185000--Sobic001G496000 Sobic005G185000--Sobic001G182100 Sobic005G185000--Sobic003G272001 Sobic002G421100 Sobic002G421100 Sobic005G185000--Sobic002G421100 Sobic001G334800 Sobic001G334800 Sobic005G185000--Sobic001G334800 Sobic005G185000--Sobic001G326500 Sobic004G074400--Sobic009G180900 Sobic004G279400 Sobic004G279400 Sobic004G074400--Sobic004G279400 Sobic003G068150 Sobic003G068150 Sobic004G074400--Sobic003G068150 Sobic002G208700 Sobic002G208700 Sobic004G074400--Sobic002G208700 Sobic004G074400--Sobic002G099932 Sobic004G074400--Sobic008G147600 Sobic004G074400--Sobic009G037500 Sobic007G149500 Sobic007G149500 Sobic004G074400--Sobic007G149500 Sobic002G219100 Sobic002G219100 Sobic004G074400--Sobic002G219100 Sobic001G432750 Sobic001G432750 Sobic002G375000--Sobic001G432750 Sobic010G226201 Sobic010G226201 Sobic002G375000--Sobic010G226201 Sobic003G071800 Sobic003G071800 Sobic002G375000--Sobic003G071800 Sobic002G347750 Sobic002G347750 Sobic002G375000--Sobic002G347750 Sobic002G114200 Sobic002G114200 Sobic002G375000--Sobic002G114200 Sobic004G071850 Sobic004G071850 Sobic002G375000--Sobic004G071850 Sobic009G019400 Sobic009G019400 Sobic002G375000--Sobic009G019400 Sobic002G191450 Sobic002G191450 Sobic002G375000--Sobic002G191450 Sobic001G064400 Sobic001G064400 Sobic002G375000--Sobic001G064400
Octagon: transcription factors


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