Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G182100.1
Synonym Sb01g015830
Functional annotation expressed protein
UniProt C5WU81
Pfam PF04484
Panther DB PTHR31807 PTHR31807:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G20815 : Family of unknown function (DUF566)
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g38480.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a007104
Brachypodium KQK14338
Barley HORVU1Hr1G005270.1
Wheat TraesCS1D02G035900 , TraesCS1B02G050500 , TraesCS1A02G034500
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G099932 - -
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10 Sobic.007G173400 - -
11 Sobic.004G074400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@disease resistance protein RPM1, putative, expressed K13457: RPM1, disease resistance protein RPM1
12 Sobic.005G185000 - -
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14 Sobic.004G347833 - -
15 Sobic.001G208166 - -
16 Sobic.002G123750 - -
17 Sobic.002G160300 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pyrophosphate--fructose 6-phosphate 1-phosphotransferase subunit alpha, putative, expressed K00895: pfp, diphosphate-dependent phosphofructokinase
18 Sobic.003G142500 glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative, expressed K13508: glycerol-3-phosphate acyltransferase
19 Sobic.006G265500 - -
20 Sobic.009G056950 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G182100 Sobic001G182100 Sobic002G099932 Sobic002G099932 Sobic001G182100--Sobic002G099932 Sobic001G234766 Sobic001G234766 Sobic001G182100--Sobic001G234766 Sobic001G496000 Sobic001G496000 Sobic001G182100--Sobic001G496000 Sobic006G147101 Sobic006G147101 Sobic001G182100--Sobic006G147101 Sobic009G074000 Sobic009G074000 Sobic001G182100--Sobic009G074000 Sobic005G108500 Sobic005G108500 Sobic001G182100--Sobic005G108500 Sobic008G109650 Sobic008G109650 Sobic001G182100--Sobic008G109650 Sobic001G387400 Sobic001G387400 Sobic001G182100--Sobic001G387400 Sobic009G181000 Sobic009G181000 Sobic001G182100--Sobic009G181000 Sobic004G074400 Sobic004G074400 Sobic002G099932--Sobic004G074400 Sobic002G099932--Sobic009G181000 Sobic002G160300 Sobic002G160300 Sobic002G099932--Sobic002G160300 Sobic002G321700 Sobic002G321700 Sobic002G099932--Sobic002G321700 Sobic009G037500 Sobic009G037500 Sobic002G099932--Sobic009G037500 Sobic002G099932--Sobic001G182100 Sobic004G347833 Sobic004G347833 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Octagon: transcription factors


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