Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G099932.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W361
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g03450.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
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Wheat -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G074400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@disease resistance protein RPM1, putative, expressed K13457: RPM1, disease resistance protein RPM1
2 Sobic.009G181000 - -
3 Sobic.002G160300 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pyrophosphate--fructose 6-phosphate 1-phosphotransferase subunit alpha, putative, expressed K00895: pfp, diphosphate-dependent phosphofructokinase
4 Sobic.002G321700 - -
5 Sobic.009G037500 expressed protein -
6 Sobic.001G182100 expressed protein -
7 Sobic.004G347833 - -
8 Sobic.001G496000 - -
9 Sobic.009G180900 disease resistance RPP13-like protein 1, putative, expressed -
10 Sobic.008G147600 - -
11 Sobic.001G228500 - -
12 Sobic.007G149500 expressed protein -
13 Sobic.001G279800 lecithin cholesterol acyltransferase, putative, expressed -
14 Sobic.003G142500 glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative, expressed K13508: glycerol-3-phosphate acyltransferase
15 Sobic.003G272001 - -
16 Sobic.007G187500 - -
17 Sobic.004G279400 ZR1 protein, putative, expressed -
18 Sobic.002G219100 - -
19 Sobic.003G068150 - -
20 Sobic.001G145550 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G099932 Sobic002G099932 Sobic004G074400 Sobic004G074400 Sobic002G099932--Sobic004G074400 Sobic009G181000 Sobic009G181000 Sobic002G099932--Sobic009G181000 Sobic002G160300 Sobic002G160300 Sobic002G099932--Sobic002G160300 Sobic002G321700 Sobic002G321700 Sobic002G099932--Sobic002G321700 Sobic009G037500 Sobic009G037500 Sobic002G099932--Sobic009G037500 Sobic001G182100 Sobic001G182100 Sobic002G099932--Sobic001G182100 Sobic004G347833 Sobic004G347833 Sobic002G099932--Sobic004G347833 Sobic001G496000 Sobic001G496000 Sobic002G099932--Sobic001G496000 Sobic009G180900 Sobic009G180900 Sobic002G099932--Sobic009G180900 Sobic004G074400--Sobic009G180900 Sobic004G279400 Sobic004G279400 Sobic004G074400--Sobic004G279400 Sobic003G068150 Sobic003G068150 Sobic004G074400--Sobic003G068150 Sobic002G208700 Sobic002G208700 Sobic004G074400--Sobic002G208700 Sobic004G074400--Sobic002G099932 Sobic008G147600 Sobic008G147600 Sobic004G074400--Sobic008G147600 Sobic004G074400--Sobic009G037500 Sobic007G149500 Sobic007G149500 Sobic004G074400--Sobic007G149500 Sobic002G219100 Sobic002G219100 Sobic004G074400--Sobic002G219100 Sobic009G181000--Sobic002G321700 Sobic009G181000--Sobic002G099932 Sobic009G181000--Sobic009G180900 Sobic010G042300 Sobic010G042300 Sobic009G181000--Sobic010G042300 Sobic007G187500 Sobic007G187500 Sobic009G181000--Sobic007G187500 Sobic002G086900 Sobic002G086900 Sobic009G181000--Sobic002G086900 Sobic009G181000--Sobic002G160300 Sobic004G091300 Sobic004G091300 Sobic009G181000--Sobic004G091300 Sobic009G181000--Sobic004G279400 Sobic001G228500 Sobic001G228500 Sobic002G160300--Sobic001G228500 Sobic002G160300--Sobic007G187500 Sobic002G160300--Sobic002G099932 Sobic002G160300--Sobic004G074400 Sobic004G068600 Sobic004G068600 Sobic002G160300--Sobic004G068600 Sobic002G160300--Sobic009G181000 Sobic002G160300--Sobic009G180900 Sobic002G160300--Sobic002G321700 Sobic002G160300--Sobic008G147600 Sobic002G321700--Sobic004G091300 Sobic002G321700--Sobic009G181000 Sobic002G321700--Sobic010G042300 Sobic002G321700--Sobic002G099932 Sobic002G321700--Sobic002G086900 Sobic002G321700--Sobic004G074400 Sobic006G279100 Sobic006G279100 Sobic002G321700--Sobic006G279100 Sobic002G321700--Sobic004G279400 Sobic002G321700--Sobic002G160300 Sobic001G145550 Sobic001G145550 Sobic009G037500--Sobic001G145550 Sobic001G422001 Sobic001G422001 Sobic009G037500--Sobic001G422001 Sobic005G150700 Sobic005G150700 Sobic009G037500--Sobic005G150700 Sobic009G020600 Sobic009G020600 Sobic009G037500--Sobic009G020600 Sobic009G037500--Sobic007G149500 Sobic001G279800 Sobic001G279800 Sobic009G037500--Sobic001G279800 Sobic009G037500--Sobic002G219100 Sobic006G094900 Sobic006G094900 Sobic009G037500--Sobic006G094900 Sobic007G175000 Sobic007G175000 Sobic009G037500--Sobic007G175000 Sobic001G182100--Sobic002G099932 Sobic001G234766 Sobic001G234766 Sobic001G182100--Sobic001G234766 Sobic001G182100--Sobic001G496000 Sobic006G147101 Sobic006G147101 Sobic001G182100--Sobic006G147101 Sobic009G074000 Sobic009G074000 Sobic001G182100--Sobic009G074000 Sobic005G108500 Sobic005G108500 Sobic001G182100--Sobic005G108500 Sobic008G109650 Sobic008G109650 Sobic001G182100--Sobic008G109650 Sobic001G387400 Sobic001G387400 Sobic001G182100--Sobic001G387400 Sobic001G182100--Sobic009G181000 Sobic007G173400 Sobic007G173400 Sobic004G347833--Sobic007G173400 Sobic004G347833--Sobic009G180900 Sobic004G347833--Sobic007G187500 Sobic008G064200 Sobic008G064200 Sobic004G347833--Sobic008G064200 Sobic004G272000 Sobic004G272000 Sobic004G347833--Sobic004G272000 Sobic004G347833--Sobic004G074400 Sobic004G347833--Sobic002G219100 Sobic004G347833--Sobic001G228500 Sobic004G347833--Sobic001G234766 Sobic003G272001 Sobic003G272001 Sobic001G496000--Sobic003G272001 Sobic001G496000--Sobic002G099932 Sobic001G496000--Sobic001G182100 Sobic001G496000--Sobic002G160300 Sobic001G534132 Sobic001G534132 Sobic001G496000--Sobic001G534132 Sobic003G067900 Sobic003G067900 Sobic001G496000--Sobic003G067900 Sobic005G185000 Sobic005G185000 Sobic001G496000--Sobic005G185000 Sobic001G496000--Sobic004G074400 Sobic002G375000 Sobic002G375000 Sobic001G496000--Sobic002G375000 Sobic009G180900--Sobic004G074400 Sobic006G027800 Sobic006G027800 Sobic009G180900--Sobic006G027800 Sobic009G180900--Sobic004G347833 Sobic009G180900--Sobic008G147600 Sobic009G180900--Sobic004G279400 Sobic009G180900--Sobic002G219100 Sobic009G180900--Sobic005G150700 Sobic009G218450 Sobic009G218450 Sobic009G180900--Sobic009G218450 Sobic010G175100 Sobic010G175100 Sobic009G180900--Sobic010G175100
Octagon: transcription factors


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