Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G067800.1,Sobic.004G067800.2
Synonym Sb04g005680
Functional annotation zinc-binding protein, putative, expressed
UniProt A0A194YN73 , C5XWX4
Pfam PF04640
Panther DB PTHR31065 PTHR31065:SF11
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G12646 : PLATZ transcription factor family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g09070.1 : zinc-binding protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a019295
Brachypodium KQJ93697
Barley HORVU6Hr1G028520.1
Wheat TraesCS6D02G134200 , TraesCS6A02G145200 , TraesCS6B02G173400
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G064200 - -
2 Sobic.004G347833 - -
3 Sobic.007G187500 - -
4 Sobic.009G180900 disease resistance RPP13-like protein 1, putative, expressed -
5 Sobic.006G139900 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase domain containing protein, expressed -
6 Sobic.001G228500 - -
7 Sobic.006G054200 expressed high in CK60 (an inefficient nitrogen user)(PubMedID : 28697783)@multidrug resistance-associated protein 9("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@multidrug resistance-associated protein, putative, expressed -
8 Sobic.009G218450 - K05658: ABCB1, ATP-binding cassette, subfamily B (MDR/TAP), member 1
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10 Sobic.007G173400 - -
11 Sobic.008G147600 - -
12 Sobic.004G091500 receptor-like protein kinase precursor, putative, expressed -
13 Sobic.004G221100 uncharacterized protein PA4923, putative, expressed K06966: pyrimidine/purine-5'-nucleotide nucleosidase
14 Sobic.001G027200 - -
15 Sobic.002G219100 - -
16 Sobic.006G268100 UDP-glucoronosyl/UDP-glucosyl transferase, putative, expressed -
17 Sobic.004G089801 - -
18 Sobic.003G210500 leucine rich repeat protein, putative, expressed -
19 Sobic.001G084133 - -
20 Sobic.001G096700 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic004G067800 Sobic004G067800 Sobic008G064200 Sobic008G064200 Sobic004G067800--Sobic008G064200 Sobic004G347833 Sobic004G347833 Sobic004G067800--Sobic004G347833 Sobic007G187500 Sobic007G187500 Sobic004G067800--Sobic007G187500 Sobic009G180900 Sobic009G180900 Sobic004G067800--Sobic009G180900 Sobic006G139900 Sobic006G139900 Sobic004G067800--Sobic006G139900 Sobic001G228500 Sobic001G228500 Sobic004G067800--Sobic001G228500 Sobic006G054200 Sobic006G054200 Sobic004G067800--Sobic006G054200 Sobic009G218450 Sobic009G218450 Sobic004G067800--Sobic009G218450 Sobic004G074400 Sobic004G074400 Sobic004G067800--Sobic004G074400 Sobic008G064200--Sobic009G218450 Sobic008G064200--Sobic004G347833 Sobic005G083400 Sobic005G083400 Sobic008G064200--Sobic005G083400 Sobic006G027800 Sobic006G027800 Sobic008G064200--Sobic006G027800 Sobic006G075200 Sobic006G075200 Sobic008G064200--Sobic006G075200 Sobic008G064200--Sobic009G180900 Sobic001G074601 Sobic001G074601 Sobic008G064200--Sobic001G074601 Sobic007G149950 Sobic007G149950 Sobic008G064200--Sobic007G149950 Sobic001G195866 Sobic001G195866 Sobic008G064200--Sobic001G195866 Sobic007G173400 Sobic007G173400 Sobic004G347833--Sobic007G173400 Sobic004G347833--Sobic009G180900 Sobic004G347833--Sobic007G187500 Sobic004G347833--Sobic008G064200 Sobic004G272000 Sobic004G272000 Sobic004G347833--Sobic004G272000 Sobic004G347833--Sobic004G074400 Sobic002G219100 Sobic002G219100 Sobic004G347833--Sobic002G219100 Sobic004G347833--Sobic001G228500 Sobic001G234766 Sobic001G234766 Sobic004G347833--Sobic001G234766 Sobic002G160300 Sobic002G160300 Sobic007G187500--Sobic002G160300 Sobic007G187500--Sobic004G347833 Sobic007G187500--Sobic009G180900 Sobic007G187500--Sobic001G228500 Sobic002G215600 Sobic002G215600 Sobic007G187500--Sobic002G215600 Sobic007G187500--Sobic007G173400 Sobic009G181000 Sobic009G181000 Sobic007G187500--Sobic009G181000 Sobic007G187500--Sobic008G064200 Sobic010G210400 Sobic010G210400 Sobic007G187500--Sobic010G210400 Sobic009G180900--Sobic004G074400 Sobic009G180900--Sobic006G027800 Sobic009G180900--Sobic004G347833 Sobic008G147600 Sobic008G147600 Sobic009G180900--Sobic008G147600 Sobic004G279400 Sobic004G279400 Sobic009G180900--Sobic004G279400 Sobic009G180900--Sobic002G219100 Sobic005G150700 Sobic005G150700 Sobic009G180900--Sobic005G150700 Sobic009G180900--Sobic009G218450 Sobic010G175100 Sobic010G175100 Sobic009G180900--Sobic010G175100 Sobic006G139900--Sobic010G210400 Sobic010G000401 Sobic010G000401 Sobic006G139900--Sobic010G000401 Sobic001G005100 Sobic001G005100 Sobic006G139900--Sobic001G005100 Sobic002G365300 Sobic002G365300 Sobic006G139900--Sobic002G365300 Sobic006G139900--Sobic007G187500 Sobic004G089801 Sobic004G089801 Sobic006G139900--Sobic004G089801 Sobic006G220100 Sobic006G220100 Sobic006G139900--Sobic006G220100 Sobic004G045000 Sobic004G045000 Sobic006G139900--Sobic004G045000 Sobic006G139900--Sobic004G347833 Sobic001G228500--Sobic002G160300 Sobic010G187950 Sobic010G187950 Sobic001G228500--Sobic010G187950 Sobic004G068600 Sobic004G068600 Sobic001G228500--Sobic004G068600 Sobic009G183650 Sobic009G183650 Sobic001G228500--Sobic009G183650 Sobic002G043201 Sobic002G043201 Sobic001G228500--Sobic002G043201 Sobic010G019500 Sobic010G019500 Sobic001G228500--Sobic010G019500 Sobic010G042300 Sobic010G042300 Sobic001G228500--Sobic010G042300 Sobic006G268100 Sobic006G268100 Sobic001G228500--Sobic006G268100 Sobic001G228500--Sobic007G173400 Sobic002G375500 Sobic002G375500 Sobic006G054200--Sobic002G375500 Sobic010G274700 Sobic010G274700 Sobic006G054200--Sobic010G274700 Sobic006G145300 Sobic006G145300 Sobic006G054200--Sobic006G145300 Sobic010G174000 Sobic010G174000 Sobic006G054200--Sobic010G174000 Sobic004G209100 Sobic004G209100 Sobic006G054200--Sobic004G209100 Sobic003G210500 Sobic003G210500 Sobic006G054200--Sobic003G210500 Sobic002G297100 Sobic002G297100 Sobic006G054200--Sobic002G297100 Sobic003G358150 Sobic003G358150 Sobic006G054200--Sobic003G358150 Sobic006G223101 Sobic006G223101 Sobic006G054200--Sobic006G223101 Sobic009G218450--Sobic001G195866 Sobic009G218450--Sobic008G064200 Sobic009G218450--Sobic003G210500 Sobic009G218450--Sobic006G027800 Sobic009G218450--Sobic009G180900 Sobic009G218450--Sobic007G149950 Sobic007G175000 Sobic007G175000 Sobic009G218450--Sobic007G175000 Sobic001G187900 Sobic001G187900 Sobic009G218450--Sobic001G187900 Sobic009G218450--Sobic005G150700 Sobic004G074400--Sobic009G180900 Sobic004G074400--Sobic004G279400 Sobic003G068150 Sobic003G068150 Sobic004G074400--Sobic003G068150 Sobic002G208700 Sobic002G208700 Sobic004G074400--Sobic002G208700 Sobic002G099932 Sobic002G099932 Sobic004G074400--Sobic002G099932 Sobic004G074400--Sobic008G147600 Sobic009G037500 Sobic009G037500 Sobic004G074400--Sobic009G037500 Sobic007G149500 Sobic007G149500 Sobic004G074400--Sobic007G149500 Sobic004G074400--Sobic002G219100
Octagon: transcription factors


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