Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G091500.1
Synonym Sb04g007490
Functional annotation receptor-like protein kinase precursor, putative, expressed
UniProt C5XY16
Pfam PF08263 PF00560 PF13855 PF07714
Panther DB PTHR27000 PTHR27000:SF74
NCBI CDD KOG1187; Serine/threonine protein kinase
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding GO:0006468protein phosphorylation GO:0004672protein kinase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G47570 : Leucine-rich repeat protein kinase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g12400.1 : receptor-like protein kinase precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQJ94027
Barley -
Wheat TraesCS7B02G279700 , TraesCS7B02G279600 , TraesCS7D02G374700 , TraesCS6B02G212300 , TraesCS7B02G396600
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G115600 protein kinase family protein, putative, expressed -
2 Sobic.004G067800 zinc-binding protein, putative, expressed -
3 Sobic.003G348300 expressed protein -
4 Sobic.006G281300 - -
5 Sobic.010G083100 CXE carboxylesterase, putative, expressed -
6 Sobic.004G272000 - -
7 Sobic.008G176266 - -
8 Sobic.001G005100 lipid binding protein, putative, expressed -
9 Sobic.006G223850 - -
10 Sobic.009G025950 - -
11 Sobic.001G144100 expressed protein -
12 Sobic.001G403900 ECAGL1 - ECA1 gametogenesis related family protein precursor, expressed -
13 Sobic.004G347833 - -
14 Sobic.004G007166 - -
15 Sobic.001G387400 expressed protein -
16 Sobic.004G202900 Ser/Thr protein phosphatase family protein, putative, expressed -
17 Sobic.002G219100 - -
18 Sobic.007G183500 CC-NBS-LRR, putative, expressed -
19 Sobic.001G221700 NB-ARC domain containing protein, expressed -
20 Sobic.004G055400 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G091500 Sobic004G091500 Sobic007G115600 Sobic007G115600 Sobic004G091500--Sobic007G115600 Sobic004G067800 Sobic004G067800 Sobic004G091500--Sobic004G067800 Sobic003G348300 Sobic003G348300 Sobic004G091500--Sobic003G348300 Sobic006G281300 Sobic006G281300 Sobic004G091500--Sobic006G281300 Sobic010G083100 Sobic010G083100 Sobic004G091500--Sobic010G083100 Sobic004G272000 Sobic004G272000 Sobic004G091500--Sobic004G272000 Sobic008G176266 Sobic008G176266 Sobic004G091500--Sobic008G176266 Sobic001G005100 Sobic001G005100 Sobic004G091500--Sobic001G005100 Sobic006G223850 Sobic006G223850 Sobic004G091500--Sobic006G223850 Sobic001G403900 Sobic001G403900 Sobic007G115600--Sobic001G403900 Sobic008G154500 Sobic008G154500 Sobic007G115600--Sobic008G154500 Sobic007G115600--Sobic006G281300 Sobic007G115600--Sobic006G223850 Sobic007G115600--Sobic010G083100 Sobic006G107332 Sobic006G107332 Sobic007G115600--Sobic006G107332 Sobic010G129900 Sobic010G129900 Sobic007G115600--Sobic010G129900 Sobic007G176300 Sobic007G176300 Sobic007G115600--Sobic007G176300 Sobic002G221000 Sobic002G221000 Sobic007G115600--Sobic002G221000 Sobic008G064200 Sobic008G064200 Sobic004G067800--Sobic008G064200 Sobic004G347833 Sobic004G347833 Sobic004G067800--Sobic004G347833 Sobic007G187500 Sobic007G187500 Sobic004G067800--Sobic007G187500 Sobic009G180900 Sobic009G180900 Sobic004G067800--Sobic009G180900 Sobic006G139900 Sobic006G139900 Sobic004G067800--Sobic006G139900 Sobic001G228500 Sobic001G228500 Sobic004G067800--Sobic001G228500 Sobic006G054200 Sobic006G054200 Sobic004G067800--Sobic006G054200 Sobic009G218450 Sobic009G218450 Sobic004G067800--Sobic009G218450 Sobic004G074400 Sobic004G074400 Sobic004G067800--Sobic004G074400 Sobic009G055700 Sobic009G055700 Sobic003G348300--Sobic009G055700 Sobic009G190100 Sobic009G190100 Sobic003G348300--Sobic009G190100 Sobic004G092950 Sobic004G092950 Sobic003G348300--Sobic004G092950 Sobic001G461101 Sobic001G461101 Sobic003G348300--Sobic001G461101 Sobic007G145300 Sobic007G145300 Sobic003G348300--Sobic007G145300 Sobic010G252301 Sobic010G252301 Sobic003G348300--Sobic010G252301 Sobic003G361150 Sobic003G361150 Sobic003G348300--Sobic003G361150 Sobic009G197350 Sobic009G197350 Sobic003G348300--Sobic009G197350 Sobic009G156700 Sobic009G156700 Sobic003G348300--Sobic009G156700 Sobic006G281300--Sobic010G083100 Sobic005G199500 Sobic005G199500 Sobic006G281300--Sobic005G199500 Sobic004G055400 Sobic004G055400 Sobic006G281300--Sobic004G055400 Sobic001G418300 Sobic001G418300 Sobic006G281300--Sobic001G418300 Sobic006G281300--Sobic010G129900 Sobic007G069750 Sobic007G069750 Sobic006G281300--Sobic007G069750 Sobic002G185000 Sobic002G185000 Sobic006G281300--Sobic002G185000 Sobic009G030701 Sobic009G030701 Sobic006G281300--Sobic009G030701 Sobic001G267950 Sobic001G267950 Sobic006G281300--Sobic001G267950 Sobic010G083100--Sobic004G055400 Sobic010G083100--Sobic009G030701 Sobic010G083100--Sobic001G418300 Sobic010G083100--Sobic006G281300 Sobic010G083100--Sobic002G185000 Sobic010G083100--Sobic005G199500 Sobic003G076300 Sobic003G076300 Sobic010G083100--Sobic003G076300 Sobic006G018500 Sobic006G018500 Sobic010G083100--Sobic006G018500 Sobic002G162900 Sobic002G162900 Sobic010G083100--Sobic002G162900 Sobic008G026500 Sobic008G026500 Sobic004G272000--Sobic008G026500 Sobic004G089801 Sobic004G089801 Sobic004G272000--Sobic004G089801 Sobic001G084133 Sobic001G084133 Sobic004G272000--Sobic001G084133 Sobic005G230900 Sobic005G230900 Sobic004G272000--Sobic005G230900 Sobic002G365300 Sobic002G365300 Sobic004G272000--Sobic002G365300 Sobic004G272000--Sobic002G221000 Sobic004G007166 Sobic004G007166 Sobic004G272000--Sobic004G007166 Sobic004G272000--Sobic001G005100 Sobic004G272000--Sobic008G176266 Sobic008G176266--Sobic004G007166 Sobic008G176266--Sobic004G272000 Sobic008G176266--Sobic002G221000 Sobic008G187450 Sobic008G187450 Sobic008G176266--Sobic008G187450 Sobic003G340500 Sobic003G340500 Sobic008G176266--Sobic003G340500 Sobic008G176266--Sobic008G026500 Sobic001G387400 Sobic001G387400 Sobic008G176266--Sobic001G387400 Sobic002G070500 Sobic002G070500 Sobic008G176266--Sobic002G070500 Sobic007G203600 Sobic007G203600 Sobic008G176266--Sobic007G203600 Sobic003G278800 Sobic003G278800 Sobic001G005100--Sobic003G278800 Sobic002G033100 Sobic002G033100 Sobic001G005100--Sobic002G033100 Sobic001G005100--Sobic002G162900 Sobic001G005100--Sobic001G403900 Sobic006G222200 Sobic006G222200 Sobic001G005100--Sobic006G222200 Sobic010G000401 Sobic010G000401 Sobic001G005100--Sobic010G000401 Sobic001G221750 Sobic001G221750 Sobic001G005100--Sobic001G221750 Sobic001G005100--Sobic004G089801 Sobic001G005100--Sobic004G055400 Sobic002G237400 Sobic002G237400 Sobic006G223850--Sobic002G237400 Sobic006G223850--Sobic010G129900 Sobic006G223850--Sobic001G403900 Sobic006G223850--Sobic004G055400 Sobic006G223850--Sobic007G069750 Sobic006G223850--Sobic001G005100 Sobic001G112300 Sobic001G112300 Sobic006G223850--Sobic001G112300 Sobic006G223850--Sobic006G222200 Sobic006G223850--Sobic001G221750
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.