Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G144100.1
Synonym Sb01g012560
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5S5Y5
Pfam PF07911
Panther DB PTHR33108 PTHR33108:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G22540 : Protein of unknown function (DUF1677)
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g46300.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a017164
Brachypodium KQK13860
Barley HORVU4Hr1G002900.1 , HORVU4Hr1G002900.2
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G025600 OsWAK112d - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
2 Sobic.005G150700 resistance protein, putative, expressed -
3 Sobic.002G219100 - -
4 Sobic.001G325500 expressed protein -
5 Sobic.010G083100 CXE carboxylesterase, putative, expressed -
6 Sobic.003G229650 - -
7 Sobic.010G045966 - -
8 Sobic.010G252301 - -
9 Sobic.006G199601 - -
10 Sobic.003G012750 - -
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12 Sobic.010G127700 - -
13 Sobic.002G025900 expressed protein -
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15 Sobic.004G026900 ubiquitin conjugating enzyme protein, putative, expressed -
16 Sobic.004G061300 expressed protein -
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18 Sobic.009G178000 Myb transcription factor, putative, expressed -
19 Sobic.001G288500 expressed protein K10756: replication factor C subunit 3/5
20 Sobic.001G325100 DUF623 domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G144100 Sobic001G144100 Sobic010G025600 Sobic010G025600 Sobic001G144100--Sobic010G025600 Sobic005G150700 Sobic005G150700 Sobic001G144100--Sobic005G150700 Sobic002G219100 Sobic002G219100 Sobic001G144100--Sobic002G219100 Sobic001G325500 Sobic001G325500 Sobic001G144100--Sobic001G325500 Sobic010G083100 Sobic010G083100 Sobic001G144100--Sobic010G083100 Sobic003G229650 Sobic003G229650 Sobic001G144100--Sobic003G229650 Sobic010G045966 Sobic010G045966 Sobic001G144100--Sobic010G045966 Sobic010G252301 Sobic010G252301 Sobic001G144100--Sobic010G252301 Sobic006G199601 Sobic006G199601 Sobic001G144100--Sobic006G199601 Sobic003G012750 Sobic003G012750 Sobic010G025600--Sobic003G012750 Sobic005G110517 Sobic005G110517 Sobic010G025600--Sobic005G110517 Sobic010G025600--Sobic003G229650 Sobic010G025600--Sobic006G199601 Sobic008G053500 Sobic008G053500 Sobic010G025600--Sobic008G053500 Sobic004G140900 Sobic004G140900 Sobic010G025600--Sobic004G140900 Sobic010G025600--Sobic005G150700 Sobic010G025600--Sobic001G325500 Sobic010G025600--Sobic001G144100 Sobic005G150700--Sobic002G219100 Sobic009G037500 Sobic009G037500 Sobic005G150700--Sobic009G037500 Sobic005G150700--Sobic010G025600 Sobic003G210500 Sobic003G210500 Sobic005G150700--Sobic003G210500 Sobic001G279800 Sobic001G279800 Sobic005G150700--Sobic001G279800 Sobic005G150700--Sobic003G012750 Sobic007G175000 Sobic007G175000 Sobic005G150700--Sobic007G175000 Sobic005G150700--Sobic008G053500 Sobic003G068200 Sobic003G068200 Sobic005G150700--Sobic003G068200 Sobic002G219100--Sobic005G150700 Sobic002G219100--Sobic001G279800 Sobic002G219100--Sobic009G037500 Sobic002G219100--Sobic010G025600 Sobic008G147600 Sobic008G147600 Sobic002G219100--Sobic008G147600 Sobic002G219100--Sobic003G210500 Sobic002G219100--Sobic003G012750 Sobic002G219100--Sobic001G144100 Sobic009G180900 Sobic009G180900 Sobic002G219100--Sobic009G180900 Sobic001G325500--Sobic010G252301 Sobic001G325500--Sobic010G045966 Sobic002G025900 Sobic002G025900 Sobic001G325500--Sobic002G025900 Sobic005G183900 Sobic005G183900 Sobic001G325500--Sobic005G183900 Sobic001G325500--Sobic010G025600 Sobic004G061300 Sobic004G061300 Sobic001G325500--Sobic004G061300 Sobic010G094750 Sobic010G094750 Sobic001G325500--Sobic010G094750 Sobic004G026900 Sobic004G026900 Sobic001G325500--Sobic004G026900 Sobic001G325500--Sobic008G053500 Sobic004G055400 Sobic004G055400 Sobic010G083100--Sobic004G055400 Sobic009G030701 Sobic009G030701 Sobic010G083100--Sobic009G030701 Sobic001G418300 Sobic001G418300 Sobic010G083100--Sobic001G418300 Sobic006G281300 Sobic006G281300 Sobic010G083100--Sobic006G281300 Sobic002G185000 Sobic002G185000 Sobic010G083100--Sobic002G185000 Sobic005G199500 Sobic005G199500 Sobic010G083100--Sobic005G199500 Sobic003G076300 Sobic003G076300 Sobic010G083100--Sobic003G076300 Sobic006G018500 Sobic006G018500 Sobic010G083100--Sobic006G018500 Sobic002G162900 Sobic002G162900 Sobic010G083100--Sobic002G162900 Sobic004G203666 Sobic004G203666 Sobic003G229650--Sobic004G203666 Sobic009G202101 Sobic009G202101 Sobic003G229650--Sobic009G202101 Sobic010G206100 Sobic010G206100 Sobic003G229650--Sobic010G206100 Sobic003G229650--Sobic010G025600 Sobic003G229650--Sobic004G026900 Sobic003G229650--Sobic005G110517 Sobic001G107700 Sobic001G107700 Sobic003G229650--Sobic001G107700 Sobic003G229650--Sobic004G061300 Sobic003G229650--Sobic001G325500 Sobic010G045966--Sobic010G252301 Sobic010G045966--Sobic002G025900 Sobic010G045966--Sobic001G325500 Sobic010G045966--Sobic008G053500 Sobic010G045966--Sobic005G183900 Sobic005G110350 Sobic005G110350 Sobic010G045966--Sobic005G110350 Sobic001G325100 Sobic001G325100 Sobic010G045966--Sobic001G325100 Sobic002G325000 Sobic002G325000 Sobic010G045966--Sobic002G325000 Sobic001G440401 Sobic001G440401 Sobic010G045966--Sobic001G440401 Sobic010G252301--Sobic010G045966 Sobic010G252301--Sobic002G025900 Sobic010G252301--Sobic001G325500 Sobic010G252301--Sobic005G183900 Sobic010G252301--Sobic005G110350 Sobic009G055700 Sobic009G055700 Sobic010G252301--Sobic009G055700 Sobic003G348300 Sobic003G348300 Sobic010G252301--Sobic003G348300 Sobic010G252301--Sobic002G325000 Sobic004G092950 Sobic004G092950 Sobic010G252301--Sobic004G092950 Sobic006G199601--Sobic005G110517 Sobic001G288500 Sobic001G288500 Sobic006G199601--Sobic001G288500 Sobic006G199601--Sobic008G053500 Sobic006G199601--Sobic003G012750 Sobic006G199601--Sobic001G325100 Sobic010G055900 Sobic010G055900 Sobic006G199601--Sobic010G055900 Sobic006G199601--Sobic010G025600 Sobic010G167700 Sobic010G167700 Sobic006G199601--Sobic010G167700 Sobic010G127700 Sobic010G127700 Sobic006G199601--Sobic010G127700
Octagon: transcription factors


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