Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G110517.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A109NDF8
Pfam PF04535
Panther DB PTHR33573 PTHR33573:SF4
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G36330 : Uncharacterised protein family (UPF0497)
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g45360.1 : membrane associated DUF588 domain containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G199601 - -
2 Sobic.001G288500 expressed protein K10756: replication factor C subunit 3/5
3 Sobic.010G025600 OsWAK112d - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
4 Sobic.003G012750 - -
5 Sobic.010G167700 receptor-like protein kinase 5 precursor, putative, expressed K04733: interleukin-1 receptor-associated kinase 4
6 Sobic.003G229650 - -
7 Sobic.008G053500 bile acid sodium symporter family protein, putative, expressed K03453: bile acid:Na+ symporter, BASS family
8 Sobic.010G127700 - -
9 Sobic.003G411150 - -
10 Sobic.010G055900 - -
11 Sobic.004G140900 - -
12 Sobic.001G251750 - K03935: NADH dehydrogenase (ubiquinone) Fe-S protein 2
13 Sobic.003G301050 - -
14 Sobic.002G365200 - -
15 Sobic.001G325500 expressed protein -
16 Sobic.003G068200 receptor kinase, putative, expressed -
17 Sobic.001G325100 DUF623 domain containing protein, expressed -
18 Sobic.009G202101 - -
19 Sobic.004G203666 - -
20 Sobic.001G293666 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G110517 Sobic005G110517 Sobic006G199601 Sobic006G199601 Sobic005G110517--Sobic006G199601 Sobic001G288500 Sobic001G288500 Sobic005G110517--Sobic001G288500 Sobic010G025600 Sobic010G025600 Sobic005G110517--Sobic010G025600 Sobic003G012750 Sobic003G012750 Sobic005G110517--Sobic003G012750 Sobic010G167700 Sobic010G167700 Sobic005G110517--Sobic010G167700 Sobic003G229650 Sobic003G229650 Sobic005G110517--Sobic003G229650 Sobic008G053500 Sobic008G053500 Sobic005G110517--Sobic008G053500 Sobic010G127700 Sobic010G127700 Sobic005G110517--Sobic010G127700 Sobic003G411150 Sobic003G411150 Sobic005G110517--Sobic003G411150 Sobic006G199601--Sobic005G110517 Sobic006G199601--Sobic001G288500 Sobic006G199601--Sobic008G053500 Sobic006G199601--Sobic003G012750 Sobic001G325100 Sobic001G325100 Sobic006G199601--Sobic001G325100 Sobic010G055900 Sobic010G055900 Sobic006G199601--Sobic010G055900 Sobic006G199601--Sobic010G025600 Sobic006G199601--Sobic010G167700 Sobic006G199601--Sobic010G127700 Sobic001G288500--Sobic006G199601 Sobic001G288500--Sobic005G110517 Sobic001G288500--Sobic008G053500 Sobic001G288500--Sobic010G167700 Sobic001G288500--Sobic003G012750 Sobic001G288500--Sobic010G055900 Sobic001G288500--Sobic010G025600 Sobic001G288500--Sobic003G411150 Sobic001G288500--Sobic010G127700 Sobic010G025600--Sobic003G012750 Sobic010G025600--Sobic005G110517 Sobic010G025600--Sobic003G229650 Sobic010G025600--Sobic006G199601 Sobic010G025600--Sobic008G053500 Sobic004G140900 Sobic004G140900 Sobic010G025600--Sobic004G140900 Sobic005G150700 Sobic005G150700 Sobic010G025600--Sobic005G150700 Sobic001G325500 Sobic001G325500 Sobic010G025600--Sobic001G325500 Sobic001G144100 Sobic001G144100 Sobic010G025600--Sobic001G144100 Sobic003G012750--Sobic010G025600 Sobic003G012750--Sobic006G199601 Sobic003G012750--Sobic008G053500 Sobic003G012750--Sobic005G110517 Sobic002G365200 Sobic002G365200 Sobic003G012750--Sobic002G365200 Sobic003G012750--Sobic004G140900 Sobic003G012750--Sobic001G288500 Sobic003G012750--Sobic010G167700 Sobic001G251750 Sobic001G251750 Sobic003G012750--Sobic001G251750 Sobic003G301050 Sobic003G301050 Sobic010G167700--Sobic003G301050 Sobic010G167700--Sobic003G411150 Sobic010G167700--Sobic005G110517 Sobic010G167700--Sobic006G199601 Sobic010G167700--Sobic001G288500 SobicK043600 SobicK043600 Sobic010G167700--SobicK043600 Sobic010G167700--Sobic001G251750 Sobic010G124100 Sobic010G124100 Sobic010G167700--Sobic010G124100 Sobic010G167700--Sobic003G012750 Sobic004G203666 Sobic004G203666 Sobic003G229650--Sobic004G203666 Sobic009G202101 Sobic009G202101 Sobic003G229650--Sobic009G202101 Sobic010G206100 Sobic010G206100 Sobic003G229650--Sobic010G206100 Sobic003G229650--Sobic010G025600 Sobic004G026900 Sobic004G026900 Sobic003G229650--Sobic004G026900 Sobic003G229650--Sobic005G110517 Sobic001G107700 Sobic001G107700 Sobic003G229650--Sobic001G107700 Sobic004G061300 Sobic004G061300 Sobic003G229650--Sobic004G061300 Sobic003G229650--Sobic001G325500 Sobic008G053500--Sobic002G365200 Sobic008G053500--Sobic006G199601 Sobic008G053500--Sobic001G325100 Sobic010G045966 Sobic010G045966 Sobic008G053500--Sobic010G045966 Sobic008G053500--Sobic003G012750 Sobic002G074700 Sobic002G074700 Sobic008G053500--Sobic002G074700 Sobic008G053500--Sobic010G025600 Sobic008G053500--Sobic001G288500 Sobic008G138850 Sobic008G138850 Sobic008G053500--Sobic008G138850 Sobic010G127700--Sobic006G199601 Sobic010G127700--Sobic005G110517 Sobic010G127700--Sobic008G053500 Sobic010G127700--Sobic010G025600 Sobic010G127700--Sobic001G288500 Sobic010G127700--Sobic001G325500 Sobic010G127700--Sobic010G045966 Sobic010G127700--Sobic003G012750 Sobic010G127700--Sobic001G325100 Sobic003G411150--Sobic010G167700 Sobic003G411150--Sobic005G110517 Sobic003G411150--Sobic001G288500 Sobic003G411150--Sobic003G301050 Sobic006G099400 Sobic006G099400 Sobic003G411150--Sobic006G099400 Sobic003G411150--Sobic006G199601 Sobic003G411150--Sobic010G055900 Sobic003G411150--Sobic010G124100 Sobic001G527550 Sobic001G527550 Sobic003G411150--Sobic001G527550
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.