Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G053500.2
Synonym Sb08g004520
Functional annotation bile acid sodium symporter family protein, putative, expressed
UniProt A0A1Z5R508
Pfam PF13593
Panther DB PTHR10361 PTHR10361:SF36
NCBI CDD -
KEGG Orthology K03453; bile acid:Na+ symporter, BASS family
Gene Ontology GO:0016020; membrane


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G78560 : Sodium Bile acid symporter family
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g07270.1 : bile acid sodium symporter family protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a025733
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G365200 - -
2 Sobic.006G199601 - -
3 Sobic.001G325100 DUF623 domain containing protein, expressed -
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15 Sobic.003G263450 - -
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17 Sobic.002G149600 - -
18 Sobic.001G251750 - K03935: NADH dehydrogenase (ubiquinone) Fe-S protein 2
19 Sobic.009G078401 - -
20 Sobic.009G078300 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic008G053500 Sobic008G053500 Sobic002G365200 Sobic002G365200 Sobic008G053500--Sobic002G365200 Sobic006G199601 Sobic006G199601 Sobic008G053500--Sobic006G199601 Sobic001G325100 Sobic001G325100 Sobic008G053500--Sobic001G325100 Sobic010G045966 Sobic010G045966 Sobic008G053500--Sobic010G045966 Sobic003G012750 Sobic003G012750 Sobic008G053500--Sobic003G012750 Sobic002G074700 Sobic002G074700 Sobic008G053500--Sobic002G074700 Sobic010G025600 Sobic010G025600 Sobic008G053500--Sobic010G025600 Sobic001G288500 Sobic001G288500 Sobic008G053500--Sobic001G288500 Sobic008G138850 Sobic008G138850 Sobic008G053500--Sobic008G138850 Sobic002G365200--Sobic008G053500 Sobic002G365200--Sobic003G012750 Sobic002G365200--Sobic002G074700 Sobic002G365200--Sobic006G199601 Sobic003G263450 Sobic003G263450 Sobic002G365200--Sobic003G263450 Sobic002G365200--Sobic001G325100 Sobic007G079901 Sobic007G079901 Sobic002G365200--Sobic007G079901 Sobic004G140900 Sobic004G140900 Sobic002G365200--Sobic004G140900 Sobic002G149600 Sobic002G149600 Sobic002G365200--Sobic002G149600 Sobic005G110517 Sobic005G110517 Sobic006G199601--Sobic005G110517 Sobic006G199601--Sobic001G288500 Sobic006G199601--Sobic008G053500 Sobic006G199601--Sobic003G012750 Sobic006G199601--Sobic001G325100 Sobic010G055900 Sobic010G055900 Sobic006G199601--Sobic010G055900 Sobic006G199601--Sobic010G025600 Sobic010G167700 Sobic010G167700 Sobic006G199601--Sobic010G167700 Sobic010G127700 Sobic010G127700 Sobic006G199601--Sobic010G127700 Sobic001G325100--Sobic008G053500 Sobic001G325100--Sobic008G138850 Sobic002G075400 Sobic002G075400 Sobic001G325100--Sobic002G075400 Sobic001G325100--Sobic010G045966 Sobic001G325100--Sobic006G199601 Sobic009G078401 Sobic009G078401 Sobic001G325100--Sobic009G078401 Sobic001G279800 Sobic001G279800 Sobic001G325100--Sobic001G279800 Sobic001G325100--Sobic010G055900 Sobic009G255400 Sobic009G255400 Sobic001G325100--Sobic009G255400 Sobic010G252301 Sobic010G252301 Sobic010G045966--Sobic010G252301 Sobic002G025900 Sobic002G025900 Sobic010G045966--Sobic002G025900 Sobic001G325500 Sobic001G325500 Sobic010G045966--Sobic001G325500 Sobic010G045966--Sobic008G053500 Sobic005G183900 Sobic005G183900 Sobic010G045966--Sobic005G183900 Sobic005G110350 Sobic005G110350 Sobic010G045966--Sobic005G110350 Sobic010G045966--Sobic001G325100 Sobic002G325000 Sobic002G325000 Sobic010G045966--Sobic002G325000 Sobic001G440401 Sobic001G440401 Sobic010G045966--Sobic001G440401 Sobic003G012750--Sobic010G025600 Sobic003G012750--Sobic006G199601 Sobic003G012750--Sobic008G053500 Sobic003G012750--Sobic005G110517 Sobic003G012750--Sobic002G365200 Sobic003G012750--Sobic004G140900 Sobic003G012750--Sobic001G288500 Sobic003G012750--Sobic010G167700 Sobic001G251750 Sobic001G251750 Sobic003G012750--Sobic001G251750 Sobic002G074700--Sobic002G149600 Sobic002G121050 Sobic002G121050 Sobic002G074700--Sobic002G121050 Sobic003G172000 Sobic003G172000 Sobic002G074700--Sobic003G172000 Sobic002G074700--Sobic003G263450 Sobic001G154450 Sobic001G154450 Sobic002G074700--Sobic001G154450 Sobic004G072600 Sobic004G072600 Sobic002G074700--Sobic004G072600 Sobic002G163400 Sobic002G163400 Sobic002G074700--Sobic002G163400 Sobic009G094100 Sobic009G094100 Sobic002G074700--Sobic009G094100 Sobic006G094900 Sobic006G094900 Sobic002G074700--Sobic006G094900 Sobic010G025600--Sobic003G012750 Sobic010G025600--Sobic005G110517 Sobic003G229650 Sobic003G229650 Sobic010G025600--Sobic003G229650 Sobic010G025600--Sobic006G199601 Sobic010G025600--Sobic008G053500 Sobic010G025600--Sobic004G140900 Sobic005G150700 Sobic005G150700 Sobic010G025600--Sobic005G150700 Sobic010G025600--Sobic001G325500 Sobic001G144100 Sobic001G144100 Sobic010G025600--Sobic001G144100 Sobic001G288500--Sobic006G199601 Sobic001G288500--Sobic005G110517 Sobic001G288500--Sobic008G053500 Sobic001G288500--Sobic010G167700 Sobic001G288500--Sobic003G012750 Sobic001G288500--Sobic010G055900 Sobic001G288500--Sobic010G025600 Sobic003G411150 Sobic003G411150 Sobic001G288500--Sobic003G411150 Sobic001G288500--Sobic010G127700 Sobic008G138850--Sobic009G078401 Sobic009G078300 Sobic009G078300 Sobic008G138850--Sobic009G078300 Sobic008G138850--Sobic009G255400 Sobic005G024500 Sobic005G024500 Sobic008G138850--Sobic005G024500 Sobic008G138850--Sobic001G325100 Sobic004G278800 Sobic004G278800 Sobic008G138850--Sobic004G278800 Sobic005G019300 Sobic005G019300 Sobic008G138850--Sobic005G019300 Sobic008G138850--Sobic002G075400 Sobic003G441301 Sobic003G441301 Sobic008G138850--Sobic003G441301
Octagon: transcription factors


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