Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G167700.1
Synonym
Functional annotation receptor-like protein kinase 5 precursor, putative, expressed
UniProt A0A194YJN6
Pfam PF00560 PF00069
Panther DB PTHR27000 PTHR27000:SF124
NCBI CDD KOG1187; Serine/threonine protein kinase
KEGG Orthology K04733; interleukin-1 receptor-associated kinase 4
Gene Ontology GO:0005515; protein binding GO:0006468protein phosphorylation GO:0005524ATP binding GO:0004672protein kinase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G25930 : Protein kinase family protein with leucine-rich repeat domain
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g12910.1 : receptor-like protein kinase 5 precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS4A02G380300 , TraesCS4A02G380300
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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18 Sobic.002G074700 receptor kinase, putative, expressed -
19 Sobic.003G072000 receptor kinase, putative, expressed -
20 Sobic.005G187700 receptor kinase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic010G167700 Sobic010G167700 Sobic003G301050 Sobic003G301050 Sobic010G167700--Sobic003G301050 Sobic003G411150 Sobic003G411150 Sobic010G167700--Sobic003G411150 Sobic005G110517 Sobic005G110517 Sobic010G167700--Sobic005G110517 Sobic006G199601 Sobic006G199601 Sobic010G167700--Sobic006G199601 Sobic001G288500 Sobic001G288500 Sobic010G167700--Sobic001G288500 SobicK043600 SobicK043600 Sobic010G167700--SobicK043600 Sobic001G251750 Sobic001G251750 Sobic010G167700--Sobic001G251750 Sobic010G124100 Sobic010G124100 Sobic010G167700--Sobic010G124100 Sobic003G012750 Sobic003G012750 Sobic010G167700--Sobic003G012750 Sobic003G301050--Sobic010G167700 Sobic003G301050--SobicK043600 Sobic003G072000 Sobic003G072000 Sobic003G301050--Sobic003G072000 Sobic001G527550 Sobic001G527550 Sobic003G301050--Sobic001G527550 Sobic005G187700 Sobic005G187700 Sobic003G301050--Sobic005G187700 Sobic004G140900 Sobic004G140900 Sobic003G301050--Sobic004G140900 Sobic002G074700 Sobic002G074700 Sobic003G301050--Sobic002G074700 Sobic003G301050--Sobic001G251750 Sobic007G079901 Sobic007G079901 Sobic003G301050--Sobic007G079901 Sobic003G411150--Sobic010G167700 Sobic003G411150--Sobic005G110517 Sobic003G411150--Sobic001G288500 Sobic003G411150--Sobic003G301050 Sobic006G099400 Sobic006G099400 Sobic003G411150--Sobic006G099400 Sobic003G411150--Sobic006G199601 Sobic010G055900 Sobic010G055900 Sobic003G411150--Sobic010G055900 Sobic003G411150--Sobic010G124100 Sobic003G411150--Sobic001G527550 Sobic005G110517--Sobic006G199601 Sobic005G110517--Sobic001G288500 Sobic010G025600 Sobic010G025600 Sobic005G110517--Sobic010G025600 Sobic005G110517--Sobic003G012750 Sobic005G110517--Sobic010G167700 Sobic003G229650 Sobic003G229650 Sobic005G110517--Sobic003G229650 Sobic008G053500 Sobic008G053500 Sobic005G110517--Sobic008G053500 Sobic010G127700 Sobic010G127700 Sobic005G110517--Sobic010G127700 Sobic005G110517--Sobic003G411150 Sobic006G199601--Sobic005G110517 Sobic006G199601--Sobic001G288500 Sobic006G199601--Sobic008G053500 Sobic006G199601--Sobic003G012750 Sobic001G325100 Sobic001G325100 Sobic006G199601--Sobic001G325100 Sobic006G199601--Sobic010G055900 Sobic006G199601--Sobic010G025600 Sobic006G199601--Sobic010G167700 Sobic006G199601--Sobic010G127700 Sobic001G288500--Sobic006G199601 Sobic001G288500--Sobic005G110517 Sobic001G288500--Sobic008G053500 Sobic001G288500--Sobic010G167700 Sobic001G288500--Sobic003G012750 Sobic001G288500--Sobic010G055900 Sobic001G288500--Sobic010G025600 Sobic001G288500--Sobic003G411150 Sobic001G288500--Sobic010G127700 Sobic003G168600 Sobic003G168600 SobicK043600--Sobic003G168600 SobicK031300 SobicK031300 SobicK043600--SobicK031300 Sobic004G272950 Sobic004G272950 SobicK043600--Sobic004G272950 Sobic003G172000 Sobic003G172000 SobicK043600--Sobic003G172000 Sobic002G121050 Sobic002G121050 SobicK043600--Sobic002G121050 Sobic002G112200 Sobic002G112200 SobicK043600--Sobic002G112200 Sobic009G095720 Sobic009G095720 SobicK043600--Sobic009G095720 Sobic009G209650 Sobic009G209650 SobicK043600--Sobic009G209650 Sobic001G401750 Sobic001G401750 SobicK043600--Sobic001G401750 Sobic001G251750--Sobic004G140900 Sobic001G251750--SobicK043600 Sobic001G251750--Sobic002G074700 Sobic001G251750--Sobic003G301050 Sobic001G251750--Sobic010G167700 Sobic001G251750--Sobic008G053500 Sobic001G251750--Sobic006G199601 Sobic001G251750--Sobic003G012750 Sobic002G365200 Sobic002G365200 Sobic001G251750--Sobic002G365200 Sobic010G124100--Sobic002G112200 Sobic010G124100--Sobic001G401750 Sobic005G119400 Sobic005G119400 Sobic010G124100--Sobic005G119400 Sobic010G124100--SobicK043600 Sobic010G061400 Sobic010G061400 Sobic010G124100--Sobic010G061400 Sobic001G050650 Sobic001G050650 Sobic010G124100--Sobic001G050650 Sobic010G124100--Sobic010G167700 Sobic010G124100--Sobic003G301050 Sobic010G124100--Sobic003G168600 Sobic003G012750--Sobic010G025600 Sobic003G012750--Sobic006G199601 Sobic003G012750--Sobic008G053500 Sobic003G012750--Sobic005G110517 Sobic003G012750--Sobic002G365200 Sobic003G012750--Sobic004G140900 Sobic003G012750--Sobic001G288500 Sobic003G012750--Sobic010G167700 Sobic003G012750--Sobic001G251750
Octagon: transcription factors


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