Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G449300.1
Synonym Sb01g042230
Functional annotation LYK, putative, expressed
UniProt A0A1Z5SAT6
Pfam PF01476 PF07714
Panther DB PTHR27001 PTHR27001:SF170
NCBI CDD KOG1187; Serine/threonine protein kinase
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006468; protein phosphorylation GO:0004672protein kinase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G33580 : Protein kinase superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g13080.1 : LYK, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a001398 , Zm00025a052995
Brachypodium -
Barley HORVU4Hr1G066170.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G074700 receptor kinase, putative, expressed -
2 Sobic.003G172000 - -
3 Sobic.K043600 - -
4 Sobic.002G121050 - -
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8 Sobic.006G094900 DUF567 domain containing protein, putative, expressed -
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11 Sobic.009G094100 - -
12 Sobic.003G168600 cytochrome b6-f complex subunit 4, putative, expressed K02637: cytochrome b6-f complex subunit 4
13 Sobic.007G103200 - -
14 Sobic.003G296250 - -
15 Sobic.005G024500 expressed protein -
16 Sobic.004G140900 - -
17 Sobic.009G209650 - -
18 Sobic.002G152100 alpha-galactosidase precursor, putative, expressed -
19 Sobic.001G045100 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
20 Sobic.004G072600 - -


Gene co-expression network
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