Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G177100.1
Synonym SGR1, Sb09g023750, SCR
Functional annotation DELLA protein GAI, putative, expressed
UniProt C5YZV9
Pfam PF03514
Panther DB PTHR31636 PTHR31636:SF22
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G54220 : GRAS family transcription factor
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g40710.1 : DELLA protein GAI, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley HORVU1Hr1G069140.2 , HORVU1Hr1G069140.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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19 Sobic.005G137500 - -
20 Sobic.010G122300 - -


Gene co-expression network
sample Sobic009G177100 Sobic009G177100 Sobic001G089850 Sobic001G089850 Sobic009G177100--Sobic001G089850 Sobic001G239000 Sobic001G239000 Sobic009G177100--Sobic001G239000 Sobic006G263250 Sobic006G263250 Sobic009G177100--Sobic006G263250 Sobic010G160850 Sobic010G160850 Sobic009G177100--Sobic010G160850 Sobic001G486400 Sobic001G486400 Sobic009G177100--Sobic001G486400 Sobic003G312800 Sobic003G312800 Sobic009G177100--Sobic003G312800 Sobic002G076350 Sobic002G076350 Sobic009G177100--Sobic002G076350 Sobic003G312900 Sobic003G312900 Sobic009G177100--Sobic003G312900 Sobic010G228800 Sobic010G228800 Sobic009G177100--Sobic010G228800 Sobic007G137201 Sobic007G137201 Sobic001G089850--Sobic007G137201 Sobic004G080901 Sobic004G080901 Sobic001G089850--Sobic004G080901 Sobic010G226100 Sobic010G226100 Sobic001G089850--Sobic010G226100 Sobic005G078600 Sobic005G078600 Sobic001G089850--Sobic005G078600 Sobic003G257650 Sobic003G257650 Sobic001G089850--Sobic003G257650 Sobic001G089850--Sobic009G177100 Sobic001G089850--Sobic001G486400 Sobic005G198150 Sobic005G198150 Sobic001G089850--Sobic005G198150 Sobic001G089850--Sobic010G228800 Sobic005G068000 Sobic005G068000 Sobic001G239000--Sobic005G068000 Sobic003G124400 Sobic003G124400 Sobic001G239000--Sobic003G124400 Sobic001G239000--Sobic003G312800 Sobic005G027350 Sobic005G027350 Sobic001G239000--Sobic005G027350 Sobic003G312600 Sobic003G312600 Sobic001G239000--Sobic003G312600 Sobic002G398300 Sobic002G398300 Sobic001G239000--Sobic002G398300 Sobic008G037300 Sobic008G037300 Sobic001G239000--Sobic008G037300 Sobic001G476600 Sobic001G476600 Sobic001G239000--Sobic001G476600 Sobic001G079000 Sobic001G079000 Sobic001G239000--Sobic001G079000 Sobic001G136850 Sobic001G136850 Sobic006G263250--Sobic001G136850 Sobic006G146700 Sobic006G146700 Sobic006G263250--Sobic006G146700 Sobic006G059150 Sobic006G059150 Sobic006G263250--Sobic006G059150 Sobic001G118050 Sobic001G118050 Sobic006G263250--Sobic001G118050 Sobic006G100150 Sobic006G100150 Sobic006G263250--Sobic006G100150 Sobic001G039750 Sobic001G039750 Sobic006G263250--Sobic001G039750 Sobic001G470700 Sobic001G470700 Sobic006G263250--Sobic001G470700 Sobic004G252600 Sobic004G252600 Sobic006G263250--Sobic004G252600 Sobic009G260550 Sobic009G260550 Sobic006G263250--Sobic009G260550 Sobic010G160850--Sobic002G398300 Sobic007G133733 Sobic007G133733 Sobic010G160850--Sobic007G133733 Sobic008G128800 Sobic008G128800 Sobic010G160850--Sobic008G128800 Sobic010G160850--Sobic003G312800 Sobic005G150501 Sobic005G150501 Sobic010G160850--Sobic005G150501 Sobic010G054400 Sobic010G054400 Sobic010G160850--Sobic010G054400 Sobic010G160850--Sobic001G239000 Sobic002G326300 Sobic002G326300 Sobic010G160850--Sobic002G326300 Sobic006G248450 Sobic006G248450 Sobic010G160850--Sobic006G248450 Sobic002G262250 Sobic002G262250 Sobic001G486400--Sobic002G262250 Sobic001G486400--Sobic010G228800 Sobic001G486400--Sobic002G326300 Sobic001G174200 Sobic001G174200 Sobic001G486400--Sobic001G174200 Sobic001G486400--Sobic005G198150 Sobic010G274700 Sobic010G274700 Sobic001G486400--Sobic010G274700 Sobic001G221700 Sobic001G221700 Sobic001G486400--Sobic001G221700 Sobic008G187450 Sobic008G187450 Sobic001G486400--Sobic008G187450 Sobic008G060800 Sobic008G060800 Sobic001G486400--Sobic008G060800 Sobic003G312800--Sobic003G312900 Sobic003G312800--Sobic002G398300 Sobic003G312800--Sobic005G068000 Sobic001G190900 Sobic001G190900 Sobic003G312800--Sobic001G190900 Sobic003G312800--Sobic003G312600 Sobic004G209100 Sobic004G209100 Sobic003G312800--Sobic004G209100 Sobic003G312800--Sobic001G239000 Sobic005G180850 Sobic005G180850 Sobic003G312800--Sobic005G180850 Sobic003G312800--Sobic005G027350 Sobic006G048400 Sobic006G048400 Sobic002G076350--Sobic006G048400 Sobic006G052250 Sobic006G052250 Sobic002G076350--Sobic006G052250 Sobic002G076350--Sobic001G136850 Sobic002G076350--Sobic003G312900 Sobic002G074900 Sobic002G074900 Sobic002G076350--Sobic002G074900 Sobic001G229850 Sobic001G229850 Sobic002G076350--Sobic001G229850 Sobic002G076350--Sobic006G146700 Sobic002G076350--Sobic006G263250 Sobic002G076350--Sobic005G180850 Sobic003G312900--Sobic003G312800 Sobic003G312900--Sobic004G209100 Sobic003G312900--Sobic001G229850 Sobic003G312900--Sobic005G180850 Sobic003G312900--Sobic001G190900 Sobic008G132500 Sobic008G132500 Sobic003G312900--Sobic008G132500 Sobic001G226401 Sobic001G226401 Sobic003G312900--Sobic001G226401 Sobic005G118800 Sobic005G118800 Sobic003G312900--Sobic005G118800 Sobic003G232600 Sobic003G232600 Sobic003G312900--Sobic003G232600 Sobic010G228800--Sobic005G198150 Sobic001G175200 Sobic001G175200 Sobic010G228800--Sobic001G175200 Sobic006G241500 Sobic006G241500 Sobic010G228800--Sobic006G241500 Sobic001G509901 Sobic001G509901 Sobic010G228800--Sobic001G509901 Sobic006G224600 Sobic006G224600 Sobic010G228800--Sobic006G224600 Sobic004G061100 Sobic004G061100 Sobic010G228800--Sobic004G061100 Sobic010G228800--Sobic001G486400 Sobic003G340200 Sobic003G340200 Sobic010G228800--Sobic003G340200 Sobic005G166200 Sobic005G166200 Sobic010G228800--Sobic005G166200
Octagon: transcription factors


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