Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G112000.1
Synonym Sb06g019390
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PLF8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g39230.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a011071
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G348900 disease resistance-responsive family protein, putative, expressed -
2 Sobic.001G175200 expressed protein -
3 Sobic.006G059150 - -
4 Sobic.001G136850 - -
5 Sobic.006G263250 - -
6 Sobic.002G076350 - -
7 Sobic.001G207301 - -
8 Sobic.007G138600 no apical meristem protein, putative, expressed -
9 Sobic.006G261650 - -
10 Sobic.003G186066 - -
11 Sobic.004G276600 expressed protein -
12 Sobic.007G179200 peptidase, T1 family, putative, expressed K02738: 20S proteasome subunit beta 1
13 Sobic.009G177100 DELLA protein GAI, putative, expressed -
14 Sobic.010G053700 expressed protein -
15 Sobic.009G218700 pentatricopeptide, putative, expressed -
16 Sobic.003G169700 - -
17 Sobic.007G116300 - -
18 Sobic.001G420150 - -
19 Sobic.001G226401 - K06995: uncharacterized protein
20 Sobic.006G205800 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@plant protein of unknown function domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G112000 Sobic006G112000 Sobic003G348900 Sobic003G348900 Sobic006G112000--Sobic003G348900 Sobic001G175200 Sobic001G175200 Sobic006G112000--Sobic001G175200 Sobic006G059150 Sobic006G059150 Sobic006G112000--Sobic006G059150 Sobic001G136850 Sobic001G136850 Sobic006G112000--Sobic001G136850 Sobic006G263250 Sobic006G263250 Sobic006G112000--Sobic006G263250 Sobic002G076350 Sobic002G076350 Sobic006G112000--Sobic002G076350 Sobic001G207301 Sobic001G207301 Sobic006G112000--Sobic001G207301 Sobic007G138600 Sobic007G138600 Sobic006G112000--Sobic007G138600 Sobic006G261650 Sobic006G261650 Sobic006G112000--Sobic006G261650 Sobic003G348900--Sobic006G112000 Sobic008G033800 Sobic008G033800 Sobic003G348900--Sobic008G033800 Sobic003G348900--Sobic001G207301 Sobic004G291300 Sobic004G291300 Sobic003G348900--Sobic004G291300 Sobic006G205800 Sobic006G205800 Sobic003G348900--Sobic006G205800 Sobic004G191901 Sobic004G191901 Sobic003G348900--Sobic004G191901 Sobic003G348900--Sobic002G076350 Sobic006G146700 Sobic006G146700 Sobic003G348900--Sobic006G146700 Sobic003G348900--Sobic001G136850 Sobic004G061100 Sobic004G061100 Sobic001G175200--Sobic004G061100 Sobic004G079400 Sobic004G079400 Sobic001G175200--Sobic004G079400 Sobic006G038050 Sobic006G038050 Sobic001G175200--Sobic006G038050 Sobic001G175200--Sobic006G261650 Sobic010G228800 Sobic010G228800 Sobic001G175200--Sobic010G228800 Sobic001G509901 Sobic001G509901 Sobic001G175200--Sobic001G509901 Sobic003G311300 Sobic003G311300 Sobic001G175200--Sobic003G311300 Sobic007G190600 Sobic007G190600 Sobic001G175200--Sobic007G190600 Sobic003G257650 Sobic003G257650 Sobic001G175200--Sobic003G257650 Sobic010G053700 Sobic010G053700 Sobic006G059150--Sobic010G053700 Sobic007G116300 Sobic007G116300 Sobic006G059150--Sobic007G116300 Sobic001G420150 Sobic001G420150 Sobic006G059150--Sobic001G420150 Sobic004G276600 Sobic004G276600 Sobic006G059150--Sobic004G276600 Sobic007G190466 Sobic007G190466 Sobic006G059150--Sobic007G190466 Sobic001G093400 Sobic001G093400 Sobic006G059150--Sobic001G093400 Sobic004G129400 Sobic004G129400 Sobic006G059150--Sobic004G129400 Sobic006G059150--Sobic007G190600 Sobic001G423200 Sobic001G423200 Sobic006G059150--Sobic001G423200 Sobic009G260550 Sobic009G260550 Sobic001G136850--Sobic009G260550 Sobic006G052250 Sobic006G052250 Sobic001G136850--Sobic006G052250 Sobic001G136850--Sobic006G263250 Sobic003G169700 Sobic003G169700 Sobic001G136850--Sobic003G169700 Sobic001G136850--Sobic001G093400 Sobic001G136850--Sobic006G146700 Sobic001G136850--Sobic004G276600 Sobic007G078700 Sobic007G078700 Sobic001G136850--Sobic007G078700 Sobic002G074900 Sobic002G074900 Sobic001G136850--Sobic002G074900 Sobic006G263250--Sobic001G136850 Sobic006G263250--Sobic006G146700 Sobic006G263250--Sobic006G059150 Sobic001G118050 Sobic001G118050 Sobic006G263250--Sobic001G118050 Sobic006G100150 Sobic006G100150 Sobic006G263250--Sobic006G100150 Sobic001G039750 Sobic001G039750 Sobic006G263250--Sobic001G039750 Sobic001G470700 Sobic001G470700 Sobic006G263250--Sobic001G470700 Sobic004G252600 Sobic004G252600 Sobic006G263250--Sobic004G252600 Sobic006G263250--Sobic009G260550 Sobic006G048400 Sobic006G048400 Sobic002G076350--Sobic006G048400 Sobic002G076350--Sobic006G052250 Sobic002G076350--Sobic001G136850 Sobic003G312900 Sobic003G312900 Sobic002G076350--Sobic003G312900 Sobic002G076350--Sobic002G074900 Sobic001G229850 Sobic001G229850 Sobic002G076350--Sobic001G229850 Sobic002G076350--Sobic006G146700 Sobic002G076350--Sobic006G263250 Sobic005G180850 Sobic005G180850 Sobic002G076350--Sobic005G180850 Sobic001G207301--Sobic003G169700 SobicK031400 SobicK031400 Sobic001G207301--SobicK031400 Sobic006G217400 Sobic006G217400 Sobic001G207301--Sobic006G217400 Sobic004G332200 Sobic004G332200 Sobic001G207301--Sobic004G332200 Sobic001G207301--Sobic006G205800 Sobic001G207301--Sobic006G261650 Sobic003G163000 Sobic003G163000 Sobic001G207301--Sobic003G163000 Sobic001G207301--Sobic001G420150 Sobic001G207301--Sobic004G291300 Sobic007G138600--Sobic008G033800 Sobic006G135701 Sobic006G135701 Sobic007G138600--Sobic006G135701 Sobic007G138600--Sobic001G118050 Sobic006G206600 Sobic006G206600 Sobic007G138600--Sobic006G206600 Sobic007G138600--Sobic006G112000 Sobic007G138600--Sobic010G053700 Sobic002G220400 Sobic002G220400 Sobic007G138600--Sobic002G220400 Sobic007G138600--Sobic006G059150 Sobic005G021400 Sobic005G021400 Sobic007G138600--Sobic005G021400 Sobic005G154600 Sobic005G154600 Sobic006G261650--Sobic005G154600 Sobic006G261650--Sobic004G276600 Sobic002G337400 Sobic002G337400 Sobic006G261650--Sobic002G337400 Sobic006G261650--Sobic003G169700 Sobic002G154450 Sobic002G154450 Sobic006G261650--Sobic002G154450 Sobic006G261650--Sobic007G190600 Sobic006G261650--Sobic001G420150 Sobic007G085400 Sobic007G085400 Sobic006G261650--Sobic007G085400 Sobic007G127200 Sobic007G127200 Sobic006G261650--Sobic007G127200
Octagon: transcription factors


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