Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G137500.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PSB1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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TAIR -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G183350 - -
2 Sobic.001G059001 - -
3 Sobic.004G193350 - -
4 Sobic.009G064300 cytokinin-O-glucosyltransferase 1, putative, expressed -
5 Sobic.002G012100 cytokinin inducible protein, putative, expressed -
6 Sobic.001G476600 Zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K10664: E3 ubiquitin-protein ligase ATL6/9/15/31/42/55
7 Sobic.005G152866 - -
8 Sobic.006G268900 "STKc_IRAK, catalytic domain of the serine/threonine kinases"(PubMedID : 29491869)@expressed protein -
9 Sobic.003G312800 - -
10 Sobic.009G101500 - -
11 Sobic.003G312900 - -
12 Sobic.007G141900 resistance protein SlVe1 precursor, putative, expressed -
13 Sobic.006G131700 CRS1/YhbY domain containing protein, putative, expressed -
14 Sobic.001G167000 HEAT repeat family protein, putative, expressed K11492: NCAPG2, condensin-2 complex subunit G2
15 Sobic.004G206600 osFTL5 FT-Like5 homologous to Flowering Locus T gene@ contains Pfam profile PF01161: Phosphatidylethanolamine-binding protein, expressed K16223: protein FLOWERING LOCUS T
16 Sobic.008G047150 - -
17 Sobic.003G312600 expressed protein -
18 Sobic.003G401700 - -
19 Sobic.003G030450 - -
20 Sobic.001G422432 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G137500 Sobic005G137500 Sobic010G183350 Sobic010G183350 Sobic005G137500--Sobic010G183350 Sobic001G059001 Sobic001G059001 Sobic005G137500--Sobic001G059001 Sobic004G193350 Sobic004G193350 Sobic005G137500--Sobic004G193350 Sobic009G064300 Sobic009G064300 Sobic005G137500--Sobic009G064300 Sobic002G012100 Sobic002G012100 Sobic005G137500--Sobic002G012100 Sobic001G476600 Sobic001G476600 Sobic005G137500--Sobic001G476600 Sobic005G152866 Sobic005G152866 Sobic005G137500--Sobic005G152866 Sobic006G268900 Sobic006G268900 Sobic005G137500--Sobic006G268900 Sobic003G312800 Sobic003G312800 Sobic005G137500--Sobic003G312800 Sobic003G375500 Sobic003G375500 Sobic010G183350--Sobic003G375500 Sobic003G401700 Sobic003G401700 Sobic010G183350--Sobic003G401700 Sobic009G026700 Sobic009G026700 Sobic010G183350--Sobic009G026700 Sobic010G183350--Sobic003G312800 Sobic010G183350--Sobic005G137500 Sobic009G074800 Sobic009G074800 Sobic010G183350--Sobic009G074800 Sobic003G124400 Sobic003G124400 Sobic010G183350--Sobic003G124400 Sobic001G250750 Sobic001G250750 Sobic010G183350--Sobic001G250750 Sobic002G009000 Sobic002G009000 Sobic010G183350--Sobic002G009000 Sobic001G059001--Sobic009G064300 Sobic001G059001--Sobic005G137500 Sobic001G190900 Sobic001G190900 Sobic001G059001--Sobic001G190900 Sobic003G312900 Sobic003G312900 Sobic001G059001--Sobic003G312900 Sobic001G059001--Sobic003G312800 Sobic001G059001--Sobic005G152866 Sobic008G072800 Sobic008G072800 Sobic001G059001--Sobic008G072800 Sobic001G059001--Sobic002G012100 Sobic001G059001--Sobic010G183350 Sobic002G159750 Sobic002G159750 Sobic004G193350--Sobic002G159750 Sobic003G238750 Sobic003G238750 Sobic004G193350--Sobic003G238750 Sobic004G322650 Sobic004G322650 Sobic004G193350--Sobic004G322650 Sobic001G476800 Sobic001G476800 Sobic004G193350--Sobic001G476800 Sobic004G193350--Sobic005G137500 Sobic008G171200 Sobic008G171200 Sobic004G193350--Sobic008G171200 Sobic010G175550 Sobic010G175550 Sobic004G193350--Sobic010G175550 Sobic003G286450 Sobic003G286450 Sobic004G193350--Sobic003G286450 Sobic003G016950 Sobic003G016950 Sobic004G193350--Sobic003G016950 Sobic009G064300--Sobic001G059001 Sobic009G064300--Sobic002G012100 Sobic007G078700 Sobic007G078700 Sobic009G064300--Sobic007G078700 Sobic007G141900 Sobic007G141900 Sobic009G064300--Sobic007G141900 Sobic003G023450 Sobic003G023450 Sobic009G064300--Sobic003G023450 Sobic003G338600 Sobic003G338600 Sobic009G064300--Sobic003G338600 Sobic009G064300--Sobic008G072800 Sobic009G064300--Sobic005G137500 Sobic009G064300--Sobic003G312900 Sobic002G012100--Sobic007G141900 Sobic001G167000 Sobic001G167000 Sobic002G012100--Sobic001G167000 Sobic002G012100--Sobic008G072800 Sobic004G206600 Sobic004G206600 Sobic002G012100--Sobic004G206600 Sobic008G067000 Sobic008G067000 Sobic002G012100--Sobic008G067000 Sobic004G242800 Sobic004G242800 Sobic002G012100--Sobic004G242800 Sobic010G196466 Sobic010G196466 Sobic002G012100--Sobic010G196466 Sobic002G012100--Sobic009G064300 Sobic002G012100--Sobic003G023450 Sobic001G476600--Sobic003G312800 Sobic001G476600--Sobic001G190900 Sobic003G312600 Sobic003G312600 Sobic001G476600--Sobic003G312600 Sobic001G239000 Sobic001G239000 Sobic001G476600--Sobic001G239000 Sobic009G026600 Sobic009G026600 Sobic001G476600--Sobic009G026600 Sobic001G370800 Sobic001G370800 Sobic001G476600--Sobic001G370800 Sobic001G476600--Sobic003G312900 Sobic005G027350 Sobic005G027350 Sobic001G476600--Sobic005G027350 Sobic009G094200 Sobic009G094200 Sobic001G476600--Sobic009G094200 Sobic003G030450 Sobic003G030450 Sobic005G152866--Sobic003G030450 Sobic001G202450 Sobic001G202450 Sobic005G152866--Sobic001G202450 Sobic003G163000 Sobic003G163000 Sobic005G152866--Sobic003G163000 Sobic005G152866--Sobic007G078700 Sobic006G052250 Sobic006G052250 Sobic005G152866--Sobic006G052250 Sobic005G045250 Sobic005G045250 Sobic005G152866--Sobic005G045250 Sobic001G136850 Sobic001G136850 Sobic005G152866--Sobic001G136850 Sobic001G373850 Sobic001G373850 Sobic005G152866--Sobic001G373850 Sobic005G152866--Sobic003G023450 Sobic006G268900--Sobic009G094200 Sobic004G227700 Sobic004G227700 Sobic006G268900--Sobic004G227700 Sobic004G250400 Sobic004G250400 Sobic006G268900--Sobic004G250400 Sobic008G142200 Sobic008G142200 Sobic006G268900--Sobic008G142200 Sobic003G063400 Sobic003G063400 Sobic006G268900--Sobic003G063400 Sobic006G268900--Sobic008G072800 Sobic010G100700 Sobic010G100700 Sobic006G268900--Sobic010G100700 Sobic004G033650 Sobic004G033650 Sobic006G268900--Sobic004G033650 Sobic006G268900--Sobic007G141900 Sobic003G312800--Sobic003G312900 Sobic002G398300 Sobic002G398300 Sobic003G312800--Sobic002G398300 Sobic005G068000 Sobic005G068000 Sobic003G312800--Sobic005G068000 Sobic003G312800--Sobic001G190900 Sobic003G312800--Sobic003G312600 Sobic004G209100 Sobic004G209100 Sobic003G312800--Sobic004G209100 Sobic003G312800--Sobic001G239000 Sobic005G180850 Sobic005G180850 Sobic003G312800--Sobic005G180850 Sobic003G312800--Sobic005G027350
Octagon: transcription factors


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