Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G142501.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VT16
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a024700 , Zm00025a048629
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G174500 carrier, putative, expressed -
2 Sobic.006G111000 expressed protein -
3 Sobic.003G329300 disease resistance RPP13-like protein 1, putative, expressed -
4 Sobic.008G100900 - -
5 Sobic.009G176100 - -
6 Sobic.008G085800 - -
7 Sobic.010G274700 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence./late senescence marker during developmental senescence(PubMedID : 27586543)@receptor kinase, putative, expressed -
8 Sobic.004G117850 - -
9 Sobic.009G011100 SCARECROW, putative, expressed -
10 Sobic.002G208500 glutamate receptor 2.6 precursor, putative, expressed K05387: glutamate receptor, ionotropic, plant
11 Sobic.008G100801 - -
12 Sobic.004G255550 - -
13 Sobic.008G113200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide, putative, expressed -
14 Sobic.002G226200 - -
15 Sobic.002G033200 ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type, putative, expressed -
16 Sobic.006G041200 - -
17 Sobic.002G212900 expressed protein -
18 Sobic.007G182300 Plant PDR ABC transporter associated domain containing protein, expressed -
19 Sobic.002G171901 - -
20 Sobic.003G312900 - -


Gene co-expression network
sample Sobic010G142501 Sobic010G142501 Sobic007G174500 Sobic007G174500 Sobic010G142501--Sobic007G174500 Sobic006G111000 Sobic006G111000 Sobic010G142501--Sobic006G111000 Sobic003G329300 Sobic003G329300 Sobic010G142501--Sobic003G329300 Sobic008G100900 Sobic008G100900 Sobic010G142501--Sobic008G100900 Sobic009G176100 Sobic009G176100 Sobic010G142501--Sobic009G176100 Sobic008G085800 Sobic008G085800 Sobic010G142501--Sobic008G085800 Sobic010G274700 Sobic010G274700 Sobic010G142501--Sobic010G274700 Sobic004G117850 Sobic004G117850 Sobic010G142501--Sobic004G117850 Sobic009G011100 Sobic009G011100 Sobic010G142501--Sobic009G011100 Sobic007G174500--Sobic008G085800 Sobic007G174500--Sobic010G142501 Sobic007G174500--Sobic010G274700 Sobic007G174500--Sobic003G329300 Sobic002G375500 Sobic002G375500 Sobic007G174500--Sobic002G375500 Sobic002G208500 Sobic002G208500 Sobic007G174500--Sobic002G208500 Sobic004G138100 Sobic004G138100 Sobic007G174500--Sobic004G138100 Sobic001G431600 Sobic001G431600 Sobic007G174500--Sobic001G431600 Sobic005G231000 Sobic005G231000 Sobic007G174500--Sobic005G231000 Sobic006G041200 Sobic006G041200 Sobic006G111000--Sobic006G041200 Sobic006G111000--Sobic008G100900 Sobic007G182300 Sobic007G182300 Sobic006G111000--Sobic007G182300 Sobic006G111000--Sobic004G117850 Sobic004G084600 Sobic004G084600 Sobic006G111000--Sobic004G084600 Sobic004G255550 Sobic004G255550 Sobic006G111000--Sobic004G255550 Sobic002G171901 Sobic002G171901 Sobic006G111000--Sobic002G171901 Sobic003G336550 Sobic003G336550 Sobic006G111000--Sobic003G336550 Sobic006G111000--Sobic009G176100 Sobic007G137100 Sobic007G137100 Sobic003G329300--Sobic007G137100 Sobic003G329300--Sobic008G085800 Sobic003G329300--Sobic010G274700 Sobic003G329300--Sobic009G176100 Sobic003G329300--Sobic007G174500 Sobic003G329300--Sobic002G171901 Sobic005G182100 Sobic005G182100 Sobic003G329300--Sobic005G182100 Sobic003G358150 Sobic003G358150 Sobic003G329300--Sobic003G358150 Sobic002G033200 Sobic002G033200 Sobic003G329300--Sobic002G033200 Sobic002G142950 Sobic002G142950 Sobic008G100900--Sobic002G142950 Sobic008G100801 Sobic008G100801 Sobic008G100900--Sobic008G100801 Sobic008G100900--Sobic006G111000 Sobic004G133201 Sobic004G133201 Sobic008G100900--Sobic004G133201 Sobic004G127766 Sobic004G127766 Sobic008G100900--Sobic004G127766 Sobic008G115200 Sobic008G115200 Sobic008G100900--Sobic008G115200 Sobic007G113000 Sobic007G113000 Sobic008G100900--Sobic007G113000 Sobic010G169950 Sobic010G169950 Sobic008G100900--Sobic010G169950 Sobic008G100900--Sobic004G117850 Sobic009G176100--Sobic008G085800 Sobic009G176100--Sobic006G111000 Sobic007G096833 Sobic007G096833 Sobic009G176100--Sobic007G096833 Sobic009G176100--Sobic003G329300 Sobic009G176100--Sobic002G171901 Sobic009G176100--Sobic008G100900 Sobic009G176100--Sobic007G174500 Sobic009G176100--Sobic004G117850 Sobic009G176100--Sobic010G142501 Sobic008G085800--Sobic002G171901 Sobic008G085800--Sobic007G174500 Sobic006G223101 Sobic006G223101 Sobic008G085800--Sobic006G223101 Sobic008G085800--Sobic003G329300 Sobic008G085800--Sobic009G176100 Sobic008G085800--Sobic004G138100 Sobic007G004400 Sobic007G004400 Sobic008G085800--Sobic007G004400 Sobic003G335100 Sobic003G335100 Sobic008G085800--Sobic003G335100 Sobic003G334400 Sobic003G334400 Sobic008G085800--Sobic003G334400 Sobic010G274700--Sobic003G329300 Sobic010G274700--Sobic007G174500 Sobic010G274700--Sobic002G375500 Sobic006G248450 Sobic006G248450 Sobic010G274700--Sobic006G248450 Sobic006G145300 Sobic006G145300 Sobic010G274700--Sobic006G145300 Sobic010G274700--Sobic010G142501 Sobic010G274700--Sobic001G431600 Sobic007G175100 Sobic007G175100 Sobic010G274700--Sobic007G175100 Sobic001G229850 Sobic001G229850 Sobic010G274700--Sobic001G229850 Sobic004G117850--Sobic006G111000 Sobic004G117850--Sobic002G171901 Sobic004G117850--Sobic008G100900 Sobic004G117850--Sobic008G085800 Sobic004G117850--Sobic004G084600 Sobic003G368450 Sobic003G368450 Sobic004G117850--Sobic003G368450 Sobic010G163666 Sobic010G163666 Sobic004G117850--Sobic010G163666 Sobic007G203800 Sobic007G203800 Sobic004G117850--Sobic007G203800 Sobic004G117850--Sobic003G329300 Sobic009G011000 Sobic009G011000 Sobic009G011100--Sobic009G011000 Sobic009G011100--Sobic010G142501 Sobic009G011100--Sobic004G138100 Sobic009G011100--Sobic007G174500 Sobic009G011200 Sobic009G011200 Sobic009G011100--Sobic009G011200 Sobic007G190600 Sobic007G190600 Sobic009G011100--Sobic007G190600 Sobic004G249200 Sobic004G249200 Sobic009G011100--Sobic004G249200 Sobic006G108900 Sobic006G108900 Sobic009G011100--Sobic006G108900 Sobic007G190466 Sobic007G190466 Sobic009G011100--Sobic007G190466
Octagon: transcription factors


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