Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G174100.1
Synonym Sb01g015165
Functional annotation GRAS family transcription factor containing protein, expressed
UniProt C5WT94
Pfam PF03514
Panther DB PTHR31636 PTHR31636:SF60
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G37650 : GRAS family transcription factor
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g40080.1 : GRAS family transcription factor containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a007196
Brachypodium -
Barley HORVU3Hr1G012520.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G168200 -(PubMedID : 34525227)@expressed protein K17911: beta-carotene isomerase
2 Sobic.002G375500 protein kinase domain containing protein, expressed -
3 Sobic.004G267650 - -
4 Sobic.007G175100 carrier, putative, expressed -
5 Sobic.007G038100 lectin-like receptor kinase, putative, expressed -
6 Sobic.002G046150 - -
7 Sobic.001G145550 - -
8 Sobic.002G208500 glutamate receptor 2.6 precursor, putative, expressed K05387: glutamate receptor, ionotropic, plant
9 Sobic.008G046700 nodulation-signaling pathway 2 protein, putative, expressed -
10 Sobic.004G209100 GRAM domain containing protein, expressed -
11 Sobic.010G274700 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence./late senescence marker during developmental senescence(PubMedID : 27586543)@receptor kinase, putative, expressed -
12 Sobic.002G398300 expressed protein -
13 Sobic.007G149500 expressed protein -
14 Sobic.002G176700 receptor-like protein kinase 2, putative, expressed -
15 Sobic.001G422001 - -
16 Sobic.007G175000 carrier, putative, expressed -
17 Sobic.009G247200 - -
18 Sobic.001G174200 GRAS family transcription factor containing protein, expressed -
19 Sobic.006G215650 - -
20 Sobic.006G145300 Os4bglu14 - monolignol beta-glucoside homologue without catalytic acid/base, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G174100 Sobic001G174100 Sobic005G168200 Sobic005G168200 Sobic001G174100--Sobic005G168200 Sobic002G375500 Sobic002G375500 Sobic001G174100--Sobic002G375500 Sobic004G267650 Sobic004G267650 Sobic001G174100--Sobic004G267650 Sobic007G175100 Sobic007G175100 Sobic001G174100--Sobic007G175100 Sobic007G038100 Sobic007G038100 Sobic001G174100--Sobic007G038100 Sobic002G046150 Sobic002G046150 Sobic001G174100--Sobic002G046150 Sobic001G145550 Sobic001G145550 Sobic001G174100--Sobic001G145550 Sobic002G208500 Sobic002G208500 Sobic001G174100--Sobic002G208500 Sobic008G046700 Sobic008G046700 Sobic001G174100--Sobic008G046700 Sobic009G247200 Sobic009G247200 Sobic005G168200--Sobic009G247200 Sobic005G168200--Sobic001G145550 Sobic005G168200--Sobic001G174100 Sobic005G168200--Sobic002G375500 Sobic001G422001 Sobic001G422001 Sobic005G168200--Sobic001G422001 Sobic005G168200--Sobic002G046150 Sobic005G168200--Sobic002G208500 Sobic002G212900 Sobic002G212900 Sobic005G168200--Sobic002G212900 Sobic009G213150 Sobic009G213150 Sobic005G168200--Sobic009G213150 Sobic002G375500--Sobic007G175100 Sobic002G375500--Sobic007G038100 Sobic002G375500--Sobic002G208500 Sobic007G174500 Sobic007G174500 Sobic002G375500--Sobic007G174500 Sobic010G274700 Sobic010G274700 Sobic002G375500--Sobic010G274700 Sobic002G375500--Sobic001G145550 Sobic006G054200 Sobic006G054200 Sobic002G375500--Sobic006G054200 Sobic002G375500--Sobic005G168200 Sobic002G375500--Sobic001G174100 Sobic004G267650--Sobic001G174100 Sobic004G267650--Sobic008G046700 Sobic003G433000 Sobic003G433000 Sobic004G267650--Sobic003G433000 Sobic004G267650--Sobic002G046150 Sobic003G069601 Sobic003G069601 Sobic004G267650--Sobic003G069601 Sobic006G280250 Sobic006G280250 Sobic004G267650--Sobic006G280250 Sobic010G089350 Sobic010G089350 Sobic004G267650--Sobic010G089350 Sobic007G149500 Sobic007G149500 Sobic004G267650--Sobic007G149500 Sobic004G267400 Sobic004G267400 Sobic004G267650--Sobic004G267400 Sobic007G175100--Sobic002G375500 Sobic007G175000 Sobic007G175000 Sobic007G175100--Sobic007G175000 Sobic007G175100--Sobic007G038100 Sobic001G174200 Sobic001G174200 Sobic007G175100--Sobic001G174200 Sobic007G175100--Sobic010G274700 Sobic003G057000 Sobic003G057000 Sobic007G175100--Sobic003G057000 Sobic007G175100--Sobic001G174100 Sobic007G175100--Sobic001G145550 Sobic007G175100--Sobic001G422001 Sobic007G038100--Sobic002G375500 Sobic007G038100--Sobic007G175100 Sobic007G038100--Sobic007G175000 Sobic007G038100--Sobic007G174500 Sobic007G038100--Sobic001G145550 Sobic006G215650 Sobic006G215650 Sobic007G038100--Sobic006G215650 Sobic007G038100--Sobic001G174100 Sobic003G368550 Sobic003G368550 Sobic007G038100--Sobic003G368550 Sobic007G038100--Sobic009G213150 Sobic002G046150--Sobic007G149500 Sobic002G046150--Sobic006G215650 Sobic002G046150--Sobic009G247200 Sobic006G221500 Sobic006G221500 Sobic002G046150--Sobic006G221500 Sobic002G086900 Sobic002G086900 Sobic002G046150--Sobic002G086900 Sobic003G230800 Sobic003G230800 Sobic002G046150--Sobic003G230800 Sobic002G208700 Sobic002G208700 Sobic002G046150--Sobic002G208700 Sobic002G046150--Sobic005G168200 Sobic009G173700 Sobic009G173700 Sobic002G046150--Sobic009G173700 Sobic009G037500 Sobic009G037500 Sobic001G145550--Sobic009G037500 Sobic001G145550--Sobic001G422001 Sobic001G145550--Sobic009G213150 Sobic001G145550--Sobic007G149500 Sobic006G094900 Sobic006G094900 Sobic001G145550--Sobic006G094900 Sobic002G094000 Sobic002G094000 Sobic001G145550--Sobic002G094000 Sobic004G278800 Sobic004G278800 Sobic001G145550--Sobic004G278800 Sobic003G142500 Sobic003G142500 Sobic001G145550--Sobic003G142500 Sobic001G145550--Sobic002G375500 Sobic002G208500--Sobic002G375500 Sobic002G208500--Sobic007G174500 Sobic002G226200 Sobic002G226200 Sobic002G208500--Sobic002G226200 Sobic002G208500--Sobic009G247200 Sobic002G208500--Sobic003G230800 Sobic010G142501 Sobic010G142501 Sobic002G208500--Sobic010G142501 Sobic003G219300 Sobic003G219300 Sobic002G208500--Sobic003G219300 Sobic002G129900 Sobic002G129900 Sobic002G208500--Sobic002G129900 Sobic002G208500--Sobic005G168200 Sobic008G046700--Sobic003G069601 Sobic008G046700--Sobic004G267650 Sobic002G181500 Sobic002G181500 Sobic008G046700--Sobic002G181500 Sobic001G261452 Sobic001G261452 Sobic008G046700--Sobic001G261452 Sobic007G183600 Sobic007G183600 Sobic008G046700--Sobic007G183600 Sobic008G046700--Sobic002G046150 Sobic008G046700--Sobic001G174100 Sobic004G072201 Sobic004G072201 Sobic008G046700--Sobic004G072201 Sobic008G046700--Sobic003G433000
Octagon: transcription factors


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