Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G108900.1
Synonym PMT5, Sb02g009280, ATPLT5, ATPMT5
Functional annotation transporter family protein, putative, expressed
UniProt C5X3N3
Pfam PF00083
Panther DB PTHR23500 PTHR23500:SF17
NCBI CDD KOG0254; Predicted transporter (major facilitator superfamily)
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016021; integral component of membrane


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G18830 : polyol/monosaccharide transporter 5
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g41850.1 : transporter family protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a029256 , Zm00025a029259 , Zm00025a029260 , Zm00025a029265
Brachypodium KQJ87608
Barley -
Wheat TraesCS7D02G422500 , TraesCS4B02G062900 , TraesCS4D02G061900
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G178650 - -
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8 Sobic.010G020000 cytochrome P450 86A1, putative, expressed -
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11 Sobic.002G018200 OsFBX209 - F-box domain containing protein, expressed -
12 Sobic.007G083700 - -
13 Sobic.007G013700 - -
14 Sobic.003G263450 - -
15 Sobic.001G376332 - -
16 Sobic.004G216650 - -
17 Sobic.004G334501 - -
18 Sobic.003G394150 - -
19 Sobic.003G416200 NADPH-dependent oxidoreductase, putative, expressed -
20 Sobic.001G143850 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G108900 Sobic002G108900 Sobic009G178650 Sobic009G178650 Sobic002G108900--Sobic009G178650 Sobic009G077901 Sobic009G077901 Sobic002G108900--Sobic009G077901 Sobic001G308350 Sobic001G308350 Sobic002G108900--Sobic001G308350 Sobic003G373050 Sobic003G373050 Sobic002G108900--Sobic003G373050 Sobic001G235600 Sobic001G235600 Sobic002G108900--Sobic001G235600 Sobic010G246800 Sobic010G246800 Sobic002G108900--Sobic010G246800 Sobic009G053700 Sobic009G053700 Sobic002G108900--Sobic009G053700 Sobic010G020000 Sobic010G020000 Sobic002G108900--Sobic010G020000 Sobic002G168700 Sobic002G168700 Sobic002G108900--Sobic002G168700 Sobic009G178650--Sobic009G077901 Sobic009G178650--Sobic009G053700 Sobic009G178650--Sobic010G246800 Sobic009G178650--Sobic003G373050 Sobic004G159866 Sobic004G159866 Sobic009G178650--Sobic004G159866 Sobic009G178650--Sobic001G235600 Sobic002G018200 Sobic002G018200 Sobic009G178650--Sobic002G018200 Sobic009G178650--Sobic010G020000 Sobic009G178650--Sobic002G168700 Sobic009G077901--Sobic009G178650 Sobic009G077901--Sobic003G373050 Sobic009G077901--Sobic010G246800 Sobic009G077901--Sobic001G235600 Sobic009G077901--Sobic002G018200 Sobic004G334501 Sobic004G334501 Sobic009G077901--Sobic004G334501 Sobic003G013300 Sobic003G013300 Sobic009G077901--Sobic003G013300 Sobic009G077901--Sobic009G053700 Sobic009G077901--Sobic004G159866 Sobic001G308350--Sobic010G246800 Sobic001G308350--Sobic009G178650 Sobic001G308350--Sobic009G077901 Sobic003G116200 Sobic003G116200 Sobic001G308350--Sobic003G116200 Sobic001G143850 Sobic001G143850 Sobic001G308350--Sobic001G143850 Sobic002G204700 Sobic002G204700 Sobic001G308350--Sobic002G204700 Sobic001G308350--Sobic009G053700 Sobic010G120900 Sobic010G120900 Sobic001G308350--Sobic010G120900 Sobic003G394150 Sobic003G394150 Sobic001G308350--Sobic003G394150 Sobic003G373050--Sobic001G235600 Sobic003G373050--Sobic002G168700 Sobic003G373050--Sobic009G077901 Sobic003G373050--Sobic009G178650 Sobic001G376332 Sobic001G376332 Sobic003G373050--Sobic001G376332 Sobic009G078300 Sobic009G078300 Sobic003G373050--Sobic009G078300 Sobic003G373050--Sobic002G018200 Sobic003G373050--Sobic004G159866 Sobic007G083700 Sobic007G083700 Sobic003G373050--Sobic007G083700 Sobic001G235600--Sobic003G373050 Sobic001G235600--Sobic002G168700 Sobic001G235600--Sobic009G078300 Sobic001G235600--Sobic001G376332 Sobic001G235600--Sobic009G077901 Sobic001G235600--Sobic002G018200 Sobic009G078401 Sobic009G078401 Sobic001G235600--Sobic009G078401 Sobic008G174200 Sobic008G174200 Sobic001G235600--Sobic008G174200 Sobic001G235600--Sobic009G178650 Sobic010G246800--Sobic009G178650 Sobic010G246800--Sobic009G077901 Sobic010G246800--Sobic003G116200 Sobic001G314350 Sobic001G314350 Sobic010G246800--Sobic001G314350 Sobic010G246800--Sobic001G308350 Sobic010G246800--Sobic001G143850 Sobic010G246800--Sobic009G053700 Sobic010G214150 Sobic010G214150 Sobic010G246800--Sobic010G214150 Sobic002G312550 Sobic002G312550 Sobic010G246800--Sobic002G312550 Sobic009G053700--Sobic009G178650 Sobic009G053700--Sobic010G020000 Sobic009G053700--Sobic001G143850 Sobic004G216650 Sobic004G216650 Sobic009G053700--Sobic004G216650 Sobic009G053700--Sobic009G077901 Sobic009G053700--Sobic004G159866 Sobic009G053700--Sobic010G246800 Sobic009G053700--Sobic007G083700 Sobic009G053700--Sobic003G394150 Sobic010G020000--Sobic003G394150 Sobic010G020000--Sobic009G053700 Sobic010G020000--Sobic002G168700 Sobic010G020000--Sobic007G083700 Sobic003G383000 Sobic003G383000 Sobic010G020000--Sobic003G383000 Sobic010G020000--Sobic009G178650 Sobic010G020000--Sobic004G216650 Sobic003G257650 Sobic003G257650 Sobic010G020000--Sobic003G257650 Sobic010G020000--Sobic003G373050 Sobic002G168700--Sobic003G373050 Sobic002G168750 Sobic002G168750 Sobic002G168700--Sobic002G168750 Sobic002G168700--Sobic007G083700 Sobic002G168700--Sobic001G235600 Sobic002G168700--Sobic001G376332 Sobic007G013700 Sobic007G013700 Sobic002G168700--Sobic007G013700 Sobic002G168700--Sobic009G078300 Sobic002G168700--Sobic004G159866 Sobic006G233900 Sobic006G233900 Sobic002G168700--Sobic006G233900
Octagon: transcription factors


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