Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G171600.1
Synonym Sb05g023170
Functional annotation SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence. (PubMedID : 27586543)
expressed protein
UniProt C5Y5F9
Pfam PF08224
Panther DB PTHR33377 PTHR33377:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g02980.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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10 Sobic.001G324000 OsFBX238 - F-box domain containing protein, expressed -
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14 Sobic.004G238400 RWP-RK domain-containing protein, putative, expressed -
15 Sobic.010G203400 - -
16 Sobic.002G310400 chalcone synthase, putative, expressed -
17 Sobic.001G035700 - -
18 Sobic.003G438000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@CorA-like magnesium transporter protein, putative, expressed -
19 Sobic.002G395400 - -
20 Sobic.003G271100 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic005G171600 Sobic005G171600 Sobic005G224601 Sobic005G224601 Sobic005G171600--Sobic005G224601 Sobic006G210233 Sobic006G210233 Sobic005G171600--Sobic006G210233 Sobic005G165950 Sobic005G165950 Sobic005G171600--Sobic005G165950 Sobic004G104250 Sobic004G104250 Sobic005G171600--Sobic004G104250 Sobic009G124100 Sobic009G124100 Sobic005G171600--Sobic009G124100 Sobic008G179400 Sobic008G179400 Sobic005G171600--Sobic008G179400 Sobic001G505033 Sobic001G505033 Sobic005G171600--Sobic001G505033 Sobic006G089350 Sobic006G089350 Sobic005G171600--Sobic006G089350 Sobic003G116400 Sobic003G116400 Sobic005G171600--Sobic003G116400 Sobic005G224601--Sobic006G210233 Sobic005G224601--Sobic005G165950 Sobic005G224601--Sobic008G179400 Sobic005G224601--Sobic004G104250 Sobic005G224601--Sobic009G124100 Sobic005G224601--Sobic006G089350 Sobic005G224601--Sobic001G505033 Sobic001G324000 Sobic001G324000 Sobic005G224601--Sobic001G324000 Sobic010G081950 Sobic010G081950 Sobic005G224601--Sobic010G081950 Sobic006G210233--Sobic005G224601 Sobic006G210233--Sobic005G165950 Sobic006G210233--Sobic006G089350 Sobic006G210233--Sobic008G179400 Sobic006G210233--Sobic001G505033 Sobic006G210233--Sobic004G104250 Sobic006G210233--Sobic009G124100 Sobic006G210233--Sobic001G324000 Sobic006G210233--Sobic010G081950 Sobic005G165950--Sobic006G210233 Sobic005G165950--Sobic005G224601 Sobic005G165950--Sobic006G089350 Sobic005G165950--Sobic008G179400 Sobic005G165950--Sobic001G505033 Sobic005G165950--Sobic009G124100 Sobic005G165950--Sobic004G104250 Sobic005G165950--Sobic001G324000 Sobic005G165950--Sobic010G081950 Sobic004G104250--Sobic009G124100 Sobic004G104250--Sobic010G081950 Sobic002G310400 Sobic002G310400 Sobic004G104250--Sobic002G310400 Sobic004G104250--Sobic006G089350 Sobic004G104250--Sobic005G224601 Sobic004G104250--Sobic006G210233 Sobic001G035700 Sobic001G035700 Sobic004G104250--Sobic001G035700 Sobic001G488800 Sobic001G488800 Sobic004G104250--Sobic001G488800 Sobic004G104250--Sobic005G165950 Sobic009G124100--Sobic004G104250 Sobic009G124100--Sobic010G081950 Sobic009G124100--Sobic001G035700 Sobic009G124100--Sobic002G310400 Sobic009G124100--Sobic006G089350 Sobic009G124100--Sobic005G224601 Sobic009G124100--Sobic006G210233 Sobic009G124100--Sobic001G488800 Sobic009G124100--Sobic005G165950 Sobic004G175800 Sobic004G175800 Sobic008G179400--Sobic004G175800 Sobic008G179400--Sobic001G505033 Sobic008G179400--Sobic006G210233 Sobic008G179400--Sobic005G224601 Sobic008G179400--Sobic005G165950 Sobic008G179400--Sobic001G324000 Sobic002G395400 Sobic002G395400 Sobic008G179400--Sobic002G395400 Sobic003G094900 Sobic003G094900 Sobic008G179400--Sobic003G094900 Sobic008G179400--Sobic006G089350 Sobic001G505033--Sobic008G179400 Sobic001G505033--Sobic006G210233 Sobic001G505033--Sobic005G224601 Sobic001G505033--Sobic005G165950 Sobic001G505033--Sobic004G175800 Sobic001G505033--Sobic001G324000 Sobic001G505033--Sobic003G094900 Sobic002G071201 Sobic002G071201 Sobic001G505033--Sobic002G071201 Sobic009G131032 Sobic009G131032 Sobic001G505033--Sobic009G131032 Sobic006G089350--Sobic006G210233 Sobic006G089350--Sobic005G165950 Sobic006G089350--Sobic004G104250 Sobic006G089350--Sobic009G124100 Sobic006G089350--Sobic005G224601 Sobic006G089350--Sobic010G081950 Sobic006G089350--Sobic002G310400 Sobic006G089350--Sobic008G179400 Sobic006G089350--Sobic001G488800 Sobic003G116400--Sobic005G171600 Sobic003G116400--Sobic005G224601 Sobic004G238400 Sobic004G238400 Sobic003G116400--Sobic004G238400 Sobic003G116400--Sobic001G505033 Sobic003G116400--Sobic006G210233 Sobic003G409150 Sobic003G409150 Sobic003G116400--Sobic003G409150 Sobic003G116400--Sobic008G179400 Sobic003G116400--Sobic005G165950 Sobic003G116400--Sobic001G324000
Octagon: transcription factors


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