Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G004200.1
Synonym Sb06g000540
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YBA8
Pfam PF08224
Panther DB PTHR33377 PTHR33377:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g01560.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS3B02G528000
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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19 Sobic.003G327950 - -
20 Sobic.001G201933 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G004200 Sobic006G004200 Sobic003G271100 Sobic003G271100 Sobic006G004200--Sobic003G271100 Sobic006G219400 Sobic006G219400 Sobic006G004200--Sobic006G219400 Sobic005G028500 Sobic005G028500 Sobic006G004200--Sobic005G028500 Sobic006G210233 Sobic006G210233 Sobic006G004200--Sobic006G210233 Sobic002G191900 Sobic002G191900 Sobic006G004200--Sobic002G191900 Sobic005G224601 Sobic005G224601 Sobic006G004200--Sobic005G224601 Sobic006G074600 Sobic006G074600 Sobic006G004200--Sobic006G074600 Sobic004G078200 Sobic004G078200 Sobic006G004200--Sobic004G078200 Sobic009G131032 Sobic009G131032 Sobic006G004200--Sobic009G131032 Sobic003G271100--Sobic005G028500 Sobic003G271100--Sobic006G219400 Sobic003G271100--Sobic004G078200 Sobic003G271100--Sobic002G191900 Sobic003G271100--Sobic009G131032 Sobic007G028300 Sobic007G028300 Sobic003G271100--Sobic007G028300 Sobic002G088300 Sobic002G088300 Sobic003G271100--Sobic002G088300 Sobic001G201933 Sobic001G201933 Sobic003G271100--Sobic001G201933 Sobic003G271100--Sobic006G074600 Sobic006G219400--Sobic004G078200 Sobic006G219400--Sobic005G028500 Sobic001G465600 Sobic001G465600 Sobic006G219400--Sobic001G465600 Sobic006G219400--Sobic002G191900 Sobic001G331650 Sobic001G331650 Sobic006G219400--Sobic001G331650 Sobic004G224733 Sobic004G224733 Sobic006G219400--Sobic004G224733 Sobic003G139600 Sobic003G139600 Sobic006G219400--Sobic003G139600 Sobic006G219400--Sobic003G271100 Sobic006G219400--Sobic006G074600 Sobic005G028500--Sobic004G078200 Sobic005G028500--Sobic006G219400 Sobic005G028500--Sobic003G271100 Sobic009G192200 Sobic009G192200 Sobic005G028500--Sobic009G192200 Sobic009G255000 Sobic009G255000 Sobic005G028500--Sobic009G255000 Sobic007G113566 Sobic007G113566 Sobic005G028500--Sobic007G113566 Sobic005G028500--Sobic002G191900 Sobic005G028500--Sobic001G465600 Sobic010G002301 Sobic010G002301 Sobic005G028500--Sobic010G002301 Sobic006G210233--Sobic005G224601 Sobic005G165950 Sobic005G165950 Sobic006G210233--Sobic005G165950 Sobic006G089350 Sobic006G089350 Sobic006G210233--Sobic006G089350 Sobic008G179400 Sobic008G179400 Sobic006G210233--Sobic008G179400 Sobic001G505033 Sobic001G505033 Sobic006G210233--Sobic001G505033 Sobic004G104250 Sobic004G104250 Sobic006G210233--Sobic004G104250 Sobic009G124100 Sobic009G124100 Sobic006G210233--Sobic009G124100 Sobic001G324000 Sobic001G324000 Sobic006G210233--Sobic001G324000 Sobic010G081950 Sobic010G081950 Sobic006G210233--Sobic010G081950 Sobic002G191900--Sobic001G201933 Sobic002G191900--Sobic010G002301 Sobic002G191900--Sobic001G465600 Sobic002G191900--Sobic006G219400 Sobic002G191900--Sobic003G139600 Sobic002G191900--Sobic005G028500 Sobic002G191900--Sobic003G271100 Sobic002G191900--Sobic007G113566 Sobic004G157050 Sobic004G157050 Sobic002G191900--Sobic004G157050 Sobic005G224601--Sobic006G210233 Sobic005G224601--Sobic005G165950 Sobic005G224601--Sobic008G179400 Sobic005G224601--Sobic004G104250 Sobic005G224601--Sobic009G124100 Sobic005G224601--Sobic006G089350 Sobic005G224601--Sobic001G505033 Sobic005G224601--Sobic001G324000 Sobic005G224601--Sobic010G081950 Sobic006G074600--Sobic006G219400 Sobic006G074600--Sobic004G078200 Sobic006G074600--Sobic004G224733 Sobic006G074600--Sobic001G331650 Sobic004G207800 Sobic004G207800 Sobic006G074600--Sobic004G207800 Sobic003G233266 Sobic003G233266 Sobic006G074600--Sobic003G233266 Sobic006G074600--Sobic007G028300 Sobic001G397550 Sobic001G397550 Sobic006G074600--Sobic001G397550 Sobic006G074600--Sobic005G028500 Sobic004G078200--Sobic007G028300 Sobic006G100150 Sobic006G100150 Sobic004G078200--Sobic006G100150 Sobic004G303900 Sobic004G303900 Sobic004G078200--Sobic004G303900 Sobic004G078200--Sobic004G207800 Sobic004G078200--Sobic006G219400 Sobic004G078200--Sobic005G028500 Sobic004G078200--Sobic007G113566 Sobic004G078200--Sobic003G139600 Sobic004G078200--Sobic001G331650 Sobic001G490350 Sobic001G490350 Sobic009G131032--Sobic001G490350 Sobic005G166200 Sobic005G166200 Sobic009G131032--Sobic005G166200 Sobic009G131032--Sobic002G088300 Sobic009G131032--Sobic003G271100 Sobic010G203400 Sobic010G203400 Sobic009G131032--Sobic010G203400 Sobic006G025066 Sobic006G025066 Sobic009G131032--Sobic006G025066 Sobic004G252250 Sobic004G252250 Sobic009G131032--Sobic004G252250 Sobic004G199100 Sobic004G199100 Sobic009G131032--Sobic004G199100 Sobic009G131032--Sobic001G505033
Octagon: transcription factors


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