Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G324000.2
Synonym Sb01g031400
Functional annotation OsFBX238 - F-box domain containing protein, expressed
UniProt A0A1Z5S987
Pfam -
Panther DB PTHR10706 PTHR10706:SF131
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G07610 : F-box family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g35050.1 : OsFBX237 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQK11386
Barley -
Wheat TraesCS7B02G382400 , TraesCS7D02G468400
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.003G438000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@CorA-like magnesium transporter protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G324000 Sobic001G324000 Sobic005G224601 Sobic005G224601 Sobic001G324000--Sobic005G224601 Sobic006G210233 Sobic006G210233 Sobic001G324000--Sobic006G210233 Sobic005G165950 Sobic005G165950 Sobic001G324000--Sobic005G165950 Sobic001G505033 Sobic001G505033 Sobic001G324000--Sobic001G505033 Sobic008G179400 Sobic008G179400 Sobic001G324000--Sobic008G179400 Sobic003G215400 Sobic003G215400 Sobic001G324000--Sobic003G215400 Sobic004G175800 Sobic004G175800 Sobic001G324000--Sobic004G175800 Sobic006G089350 Sobic006G089350 Sobic001G324000--Sobic006G089350 Sobic004G104250 Sobic004G104250 Sobic001G324000--Sobic004G104250 Sobic005G224601--Sobic006G210233 Sobic005G224601--Sobic005G165950 Sobic005G224601--Sobic008G179400 Sobic005G224601--Sobic004G104250 Sobic009G124100 Sobic009G124100 Sobic005G224601--Sobic009G124100 Sobic005G224601--Sobic006G089350 Sobic005G224601--Sobic001G505033 Sobic005G224601--Sobic001G324000 Sobic010G081950 Sobic010G081950 Sobic005G224601--Sobic010G081950 Sobic006G210233--Sobic005G224601 Sobic006G210233--Sobic005G165950 Sobic006G210233--Sobic006G089350 Sobic006G210233--Sobic008G179400 Sobic006G210233--Sobic001G505033 Sobic006G210233--Sobic004G104250 Sobic006G210233--Sobic009G124100 Sobic006G210233--Sobic001G324000 Sobic006G210233--Sobic010G081950 Sobic005G165950--Sobic006G210233 Sobic005G165950--Sobic005G224601 Sobic005G165950--Sobic006G089350 Sobic005G165950--Sobic008G179400 Sobic005G165950--Sobic001G505033 Sobic005G165950--Sobic009G124100 Sobic005G165950--Sobic004G104250 Sobic005G165950--Sobic001G324000 Sobic005G165950--Sobic010G081950 Sobic001G505033--Sobic008G179400 Sobic001G505033--Sobic006G210233 Sobic001G505033--Sobic005G224601 Sobic001G505033--Sobic005G165950 Sobic001G505033--Sobic004G175800 Sobic001G505033--Sobic001G324000 Sobic003G094900 Sobic003G094900 Sobic001G505033--Sobic003G094900 Sobic002G071201 Sobic002G071201 Sobic001G505033--Sobic002G071201 Sobic009G131032 Sobic009G131032 Sobic001G505033--Sobic009G131032 Sobic008G179400--Sobic004G175800 Sobic008G179400--Sobic001G505033 Sobic008G179400--Sobic006G210233 Sobic008G179400--Sobic005G224601 Sobic008G179400--Sobic005G165950 Sobic008G179400--Sobic001G324000 Sobic002G395400 Sobic002G395400 Sobic008G179400--Sobic002G395400 Sobic008G179400--Sobic003G094900 Sobic008G179400--Sobic006G089350 Sobic003G215400--Sobic001G324000 Sobic003G215400--Sobic001G505033 Sobic003G215400--Sobic008G179400 Sobic003G215400--Sobic005G224601 Sobic003G215400--Sobic004G175800 Sobic003G215400--Sobic006G210233 Sobic007G160050 Sobic007G160050 Sobic003G215400--Sobic007G160050 Sobic003G215400--Sobic005G165950 Sobic003G215400--Sobic002G071201 Sobic004G175800--Sobic008G179400 Sobic004G175800--Sobic001G505033 Sobic004G175800--Sobic002G395400 Sobic007G043750 Sobic007G043750 Sobic004G175800--Sobic007G043750 Sobic004G175800--Sobic005G224601 Sobic004G175800--Sobic006G210233 Sobic003G257650 Sobic003G257650 Sobic004G175800--Sobic003G257650 Sobic004G175800--Sobic003G094900 Sobic003G432400 Sobic003G432400 Sobic004G175800--Sobic003G432400 Sobic006G089350--Sobic006G210233 Sobic006G089350--Sobic005G165950 Sobic006G089350--Sobic004G104250 Sobic006G089350--Sobic009G124100 Sobic006G089350--Sobic005G224601 Sobic006G089350--Sobic010G081950 Sobic002G310400 Sobic002G310400 Sobic006G089350--Sobic002G310400 Sobic006G089350--Sobic008G179400 Sobic001G488800 Sobic001G488800 Sobic006G089350--Sobic001G488800 Sobic004G104250--Sobic009G124100 Sobic004G104250--Sobic010G081950 Sobic004G104250--Sobic002G310400 Sobic004G104250--Sobic006G089350 Sobic004G104250--Sobic005G224601 Sobic004G104250--Sobic006G210233 Sobic001G035700 Sobic001G035700 Sobic004G104250--Sobic001G035700 Sobic004G104250--Sobic001G488800 Sobic004G104250--Sobic005G165950
Octagon: transcription factors


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