Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G160050.6,Sobic.007G160050.1,Sobic.007G160050.7,Sobic.007G160050.3,Sobic.007G160050.4,Sobic.007G160050.8,Sobic.007G160050.2,Sobic.007G160050.9,Sobic.007G160050.5
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RA53 , A0A1Z5RB96 , A0A1Z5RB38 , A0A1Z5RB24 , A0A1Z5RA58 , A0A1Z5RA51 , A0A1Z5RAR3
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G384750 - -
2 Sobic.001G324000 OsFBX238 - F-box domain containing protein, expressed -
3 Sobic.009G174800 thioredoxin, putative, expressed K03671: thioredoxin 1
4 Sobic.001G159500 tesmin/TSO1-like CXC domain containing protein, expressed -
5 Sobic.001G444200 pentatricopeptide, putative, expressed -
6 Sobic.003G215400 pleiotropic drug resistance protein, putative, expressed -
7 Sobic.008G057200 amino acid transporter, putative, expressed -
8 Sobic.008G014400 expressed protein -
9 Sobic.002G408400 beta-amylase, putative, expressed -
10 Sobic.003G232500 - -
11 Sobic.005G224601 - -
12 Sobic.002G395400 - -
13 Sobic.006G210233 - -
14 Sobic.002G191900 OsFBX325 - F-box domain containing protein, expressed -
15 Sobic.003G047400 pentatricopeptide, putative, expressed -
16 Sobic.003G290200 expressed protein -
17 Sobic.004G104250 - -
18 Sobic.008G012200 DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, putative, expressed K03013: RPB5, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1
19 Sobic.001G332933 - -
20 Sobic.002G292000 - -


Gene co-expression network
sample Sobic007G160050 Sobic007G160050 Sobic003G384750 Sobic003G384750 Sobic007G160050--Sobic003G384750 Sobic001G324000 Sobic001G324000 Sobic007G160050--Sobic001G324000 Sobic009G174800 Sobic009G174800 Sobic007G160050--Sobic009G174800 Sobic001G159500 Sobic001G159500 Sobic007G160050--Sobic001G159500 Sobic001G444200 Sobic001G444200 Sobic007G160050--Sobic001G444200 Sobic003G215400 Sobic003G215400 Sobic007G160050--Sobic003G215400 Sobic008G057200 Sobic008G057200 Sobic007G160050--Sobic008G057200 Sobic008G014400 Sobic008G014400 Sobic007G160050--Sobic008G014400 Sobic002G408400 Sobic002G408400 Sobic007G160050--Sobic002G408400 Sobic003G384750--Sobic009G174800 Sobic003G384750--Sobic002G408400 Sobic004G145550 Sobic004G145550 Sobic003G384750--Sobic004G145550 Sobic006G244200 Sobic006G244200 Sobic003G384750--Sobic006G244200 Sobic003G384750--Sobic007G160050 Sobic003G384750--Sobic008G057200 Sobic003G370800 Sobic003G370800 Sobic003G384750--Sobic003G370800 Sobic009G143600 Sobic009G143600 Sobic003G384750--Sobic009G143600 Sobic003G384750--Sobic001G159500 Sobic005G224601 Sobic005G224601 Sobic001G324000--Sobic005G224601 Sobic006G210233 Sobic006G210233 Sobic001G324000--Sobic006G210233 Sobic005G165950 Sobic005G165950 Sobic001G324000--Sobic005G165950 Sobic001G505033 Sobic001G505033 Sobic001G324000--Sobic001G505033 Sobic008G179400 Sobic008G179400 Sobic001G324000--Sobic008G179400 Sobic001G324000--Sobic003G215400 Sobic004G175800 Sobic004G175800 Sobic001G324000--Sobic004G175800 Sobic006G089350 Sobic006G089350 Sobic001G324000--Sobic006G089350 Sobic004G104250 Sobic004G104250 Sobic001G324000--Sobic004G104250 Sobic009G174800--Sobic003G384750 Sobic009G174800--Sobic007G160050 Sobic009G174800--Sobic004G145550 Sobic008G012200 Sobic008G012200 Sobic009G174800--Sobic008G012200 Sobic003G290200 Sobic003G290200 Sobic009G174800--Sobic003G290200 Sobic009G174800--Sobic006G244200 Sobic004G308600 Sobic004G308600 Sobic009G174800--Sobic004G308600 Sobic001G510500 Sobic001G510500 Sobic009G174800--Sobic001G510500 Sobic009G174800--Sobic002G408400 Sobic001G159500--Sobic003G384750 Sobic001G159500--Sobic007G160050 Sobic003G047400 Sobic003G047400 Sobic001G159500--Sobic003G047400 Sobic001G159500--Sobic001G444200 Sobic003G413550 Sobic003G413550 Sobic001G159500--Sobic003G413550 Sobic001G159500--Sobic004G145550 Sobic003G232500 Sobic003G232500 Sobic001G159500--Sobic003G232500 Sobic001G159500--Sobic008G057200 Sobic001G159500--Sobic009G174800 Sobic001G444200--Sobic007G160050 Sobic001G444200--Sobic003G384750 Sobic004G208800 Sobic004G208800 Sobic001G444200--Sobic004G208800 Sobic001G444200--Sobic001G159500 Sobic001G201933 Sobic001G201933 Sobic001G444200--Sobic001G201933 Sobic001G444200--Sobic003G047400 Sobic001G444200--Sobic004G145550 Sobic001G395600 Sobic001G395600 Sobic001G444200--Sobic001G395600 Sobic003G139600 Sobic003G139600 Sobic001G444200--Sobic003G139600 Sobic003G215400--Sobic001G324000 Sobic003G215400--Sobic001G505033 Sobic003G215400--Sobic008G179400 Sobic003G215400--Sobic005G224601 Sobic003G215400--Sobic004G175800 Sobic003G215400--Sobic006G210233 Sobic003G215400--Sobic007G160050 Sobic003G215400--Sobic005G165950 Sobic002G071201 Sobic002G071201 Sobic003G215400--Sobic002G071201 Sobic010G103400 Sobic010G103400 Sobic008G057200--Sobic010G103400 Sobic008G057200--Sobic002G408400 Sobic008G104900 Sobic008G104900 Sobic008G057200--Sobic008G104900 Sobic007G009900 Sobic007G009900 Sobic008G057200--Sobic007G009900 Sobic008G057200--Sobic003G384750 Sobic008G057200--Sobic003G370800 Sobic003G394000 Sobic003G394000 Sobic008G057200--Sobic003G394000 Sobic009G212900 Sobic009G212900 Sobic008G057200--Sobic009G212900 Sobic001G123400 Sobic001G123400 Sobic008G057200--Sobic001G123400 Sobic002G375200 Sobic002G375200 Sobic008G014400--Sobic002G375200 Sobic008G014400--Sobic004G145550 Sobic007G107800 Sobic007G107800 Sobic008G014400--Sobic007G107800 Sobic007G113101 Sobic007G113101 Sobic008G014400--Sobic007G113101 Sobic008G014400--Sobic006G244200 Sobic005G070901 Sobic005G070901 Sobic008G014400--Sobic005G070901 Sobic006G206600 Sobic006G206600 Sobic008G014400--Sobic006G206600 Sobic008G014400--Sobic004G208800 Sobic008G014400--Sobic003G384750 Sobic002G408400--Sobic008G104900 Sobic002G408400--Sobic003G370800 Sobic002G408400--Sobic008G057200 Sobic002G408400--Sobic007G009900 Sobic002G408400--Sobic010G103400 Sobic002G408400--Sobic003G384750 Sobic002G408400--Sobic009G143600 Sobic002G408400--Sobic009G212900 Sobic002G408400--Sobic006G244200
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.