Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G384750.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W0W3
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G174800 thioredoxin, putative, expressed K03671: thioredoxin 1
2 Sobic.002G408400 beta-amylase, putative, expressed -
3 Sobic.004G145550 - -
4 Sobic.006G244200 OsFBDUF42 - F-box and DUF domain containing protein, expressed -
5 Sobic.007G160050 - -
6 Sobic.008G057200 amino acid transporter, putative, expressed -
7 Sobic.003G370800 aminotransferase, classes I and II, domain containing protein, expressed K15849: PAT, bifunctional aspartate aminotransferase and glutamate/aspartate-prephenate aminotransferase
8 Sobic.009G143600 clathrin assembly protein, putative, expressed -
9 Sobic.001G159500 tesmin/TSO1-like CXC domain containing protein, expressed -
10 Sobic.009G212900 myosin head family protein, expressed K10357: myosin V
11 Sobic.008G104900 - -
12 Sobic.002G375200 expressed protein -
13 Sobic.001G444200 pentatricopeptide, putative, expressed -
14 Sobic.003G232500 - -
15 Sobic.008G014400 expressed protein -
16 Sobic.003G074300 expressed protein -
17 Sobic.001G123400 expressed protein -
18 Sobic.001G520600 DNA topoisomerase 2, putative, expressed -
19 Sobic.007G009900 - -
20 Sobic.001G336450 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G384750 Sobic003G384750 Sobic009G174800 Sobic009G174800 Sobic003G384750--Sobic009G174800 Sobic002G408400 Sobic002G408400 Sobic003G384750--Sobic002G408400 Sobic004G145550 Sobic004G145550 Sobic003G384750--Sobic004G145550 Sobic006G244200 Sobic006G244200 Sobic003G384750--Sobic006G244200 Sobic007G160050 Sobic007G160050 Sobic003G384750--Sobic007G160050 Sobic008G057200 Sobic008G057200 Sobic003G384750--Sobic008G057200 Sobic003G370800 Sobic003G370800 Sobic003G384750--Sobic003G370800 Sobic009G143600 Sobic009G143600 Sobic003G384750--Sobic009G143600 Sobic001G159500 Sobic001G159500 Sobic003G384750--Sobic001G159500 Sobic009G174800--Sobic003G384750 Sobic009G174800--Sobic007G160050 Sobic009G174800--Sobic004G145550 Sobic008G012200 Sobic008G012200 Sobic009G174800--Sobic008G012200 Sobic003G290200 Sobic003G290200 Sobic009G174800--Sobic003G290200 Sobic009G174800--Sobic006G244200 Sobic004G308600 Sobic004G308600 Sobic009G174800--Sobic004G308600 Sobic001G510500 Sobic001G510500 Sobic009G174800--Sobic001G510500 Sobic009G174800--Sobic002G408400 Sobic008G104900 Sobic008G104900 Sobic002G408400--Sobic008G104900 Sobic002G408400--Sobic003G370800 Sobic002G408400--Sobic008G057200 Sobic007G009900 Sobic007G009900 Sobic002G408400--Sobic007G009900 Sobic010G103400 Sobic010G103400 Sobic002G408400--Sobic010G103400 Sobic002G408400--Sobic003G384750 Sobic002G408400--Sobic009G143600 Sobic009G212900 Sobic009G212900 Sobic002G408400--Sobic009G212900 Sobic002G408400--Sobic006G244200 Sobic004G145550--Sobic006G244200 Sobic001G520600 Sobic001G520600 Sobic004G145550--Sobic001G520600 Sobic010G093200 Sobic010G093200 Sobic004G145550--Sobic010G093200 Sobic004G145550--Sobic003G384750 Sobic002G375200 Sobic002G375200 Sobic004G145550--Sobic002G375200 Sobic008G014400 Sobic008G014400 Sobic004G145550--Sobic008G014400 Sobic001G123400 Sobic001G123400 Sobic004G145550--Sobic001G123400 Sobic004G145550--Sobic009G143600 Sobic004G334601 Sobic004G334601 Sobic004G145550--Sobic004G334601 Sobic006G244200--Sobic004G145550 Sobic006G244200--Sobic009G143600 Sobic006G244200--Sobic003G384750 Sobic006G244200--Sobic001G520600 Sobic006G244200--Sobic010G093200 Sobic006G244200--Sobic002G375200 Sobic007G113101 Sobic007G113101 Sobic006G244200--Sobic007G113101 Sobic006G252800 Sobic006G252800 Sobic006G244200--Sobic006G252800 Sobic006G244200--Sobic002G408400 Sobic007G160050--Sobic003G384750 Sobic001G324000 Sobic001G324000 Sobic007G160050--Sobic001G324000 Sobic007G160050--Sobic009G174800 Sobic007G160050--Sobic001G159500 Sobic001G444200 Sobic001G444200 Sobic007G160050--Sobic001G444200 Sobic003G215400 Sobic003G215400 Sobic007G160050--Sobic003G215400 Sobic007G160050--Sobic008G057200 Sobic007G160050--Sobic008G014400 Sobic007G160050--Sobic002G408400 Sobic008G057200--Sobic010G103400 Sobic008G057200--Sobic002G408400 Sobic008G057200--Sobic008G104900 Sobic008G057200--Sobic007G009900 Sobic008G057200--Sobic003G384750 Sobic008G057200--Sobic003G370800 Sobic003G394000 Sobic003G394000 Sobic008G057200--Sobic003G394000 Sobic008G057200--Sobic009G212900 Sobic008G057200--Sobic001G123400 Sobic003G370800--Sobic002G408400 Sobic003G370800--Sobic008G104900 Sobic003G370800--Sobic009G212900 Sobic003G370800--Sobic009G143600 Sobic003G370800--Sobic007G009900 Sobic004G200100 Sobic004G200100 Sobic003G370800--Sobic004G200100 Sobic003G370800--Sobic003G394000 Sobic003G370800--Sobic003G384750 Sobic001G486800 Sobic001G486800 Sobic003G370800--Sobic001G486800 Sobic009G143600--Sobic006G244200 Sobic009G143600--Sobic003G370800 Sobic009G143600--Sobic009G212900 Sobic009G143600--Sobic002G408400 Sobic009G143600--Sobic004G145550 Sobic009G143600--Sobic003G384750 Sobic009G143600--Sobic007G009900 Sobic003G106800 Sobic003G106800 Sobic009G143600--Sobic003G106800 Sobic009G143600--Sobic001G123400 Sobic001G159500--Sobic003G384750 Sobic001G159500--Sobic007G160050 Sobic003G047400 Sobic003G047400 Sobic001G159500--Sobic003G047400 Sobic001G159500--Sobic001G444200 Sobic003G413550 Sobic003G413550 Sobic001G159500--Sobic003G413550 Sobic001G159500--Sobic004G145550 Sobic003G232500 Sobic003G232500 Sobic001G159500--Sobic003G232500 Sobic001G159500--Sobic008G057200 Sobic001G159500--Sobic009G174800
Octagon: transcription factors


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