Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G375200.1
Synonym Sb02g039280
Functional annotation expressed protein
UniProt C5XE19
Pfam -
Panther DB PTHR36797
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G16950 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g08510.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley HORVU5Hr1G106890.5 , HORVU5Hr1G106890.4 , HORVU5Hr1G106890.7 , HORVU5Hr1G106890.6 , HORVU5Hr1G106890.1 , HORVU5Hr1G106890.3 , HORVU5Hr1G106890.2
Wheat TraesCS5A02G446700 , TraesCS5D02G453700
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G014400 expressed protein -
2 Sobic.006G244200 OsFBDUF42 - F-box and DUF domain containing protein, expressed -
3 Sobic.004G145550 - -
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11 Sobic.001G423200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide, putative, expressed -
12 Sobic.006G252800 - -
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14 Sobic.001G294800 mediator of RNA polymerase II transcription subunit 31, putative, expressed K15153: MED31, mediator of RNA polymerase II transcription subunit 31
15 Sobic.009G097400 - -
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18 Sobic.K031900 - -
19 Sobic.001G420150 - -
20 Sobic.003G244250 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G375200 Sobic002G375200 Sobic008G014400 Sobic008G014400 Sobic002G375200--Sobic008G014400 Sobic006G244200 Sobic006G244200 Sobic002G375200--Sobic006G244200 Sobic004G145550 Sobic004G145550 Sobic002G375200--Sobic004G145550 Sobic003G142800 Sobic003G142800 Sobic002G375200--Sobic003G142800 Sobic007G113101 Sobic007G113101 Sobic002G375200--Sobic007G113101 Sobic005G070901 Sobic005G070901 Sobic002G375200--Sobic005G070901 Sobic003G416200 Sobic003G416200 Sobic002G375200--Sobic003G416200 Sobic003G384750 Sobic003G384750 Sobic002G375200--Sobic003G384750 Sobic004G332200 Sobic004G332200 Sobic002G375200--Sobic004G332200 Sobic008G014400--Sobic002G375200 Sobic008G014400--Sobic004G145550 Sobic007G107800 Sobic007G107800 Sobic008G014400--Sobic007G107800 Sobic008G014400--Sobic007G113101 Sobic008G014400--Sobic006G244200 Sobic008G014400--Sobic005G070901 Sobic006G206600 Sobic006G206600 Sobic008G014400--Sobic006G206600 Sobic004G208800 Sobic004G208800 Sobic008G014400--Sobic004G208800 Sobic008G014400--Sobic003G384750 Sobic006G244200--Sobic004G145550 Sobic009G143600 Sobic009G143600 Sobic006G244200--Sobic009G143600 Sobic006G244200--Sobic003G384750 Sobic001G520600 Sobic001G520600 Sobic006G244200--Sobic001G520600 Sobic010G093200 Sobic010G093200 Sobic006G244200--Sobic010G093200 Sobic006G244200--Sobic002G375200 Sobic006G244200--Sobic007G113101 Sobic006G252800 Sobic006G252800 Sobic006G244200--Sobic006G252800 Sobic002G408400 Sobic002G408400 Sobic006G244200--Sobic002G408400 Sobic004G145550--Sobic006G244200 Sobic004G145550--Sobic001G520600 Sobic004G145550--Sobic010G093200 Sobic004G145550--Sobic003G384750 Sobic004G145550--Sobic002G375200 Sobic004G145550--Sobic008G014400 Sobic001G123400 Sobic001G123400 Sobic004G145550--Sobic001G123400 Sobic004G145550--Sobic009G143600 Sobic004G334601 Sobic004G334601 Sobic004G145550--Sobic004G334601 Sobic010G132400 Sobic010G132400 Sobic003G142800--Sobic010G132400 Sobic005G154600 Sobic005G154600 Sobic003G142800--Sobic005G154600 Sobic003G142800--Sobic004G332200 Sobic004G276600 Sobic004G276600 Sobic003G142800--Sobic004G276600 Sobic006G035350 Sobic006G035350 Sobic003G142800--Sobic006G035350 SobicK031900 SobicK031900 Sobic003G142800--SobicK031900 Sobic001G420150 Sobic001G420150 Sobic003G142800--Sobic001G420150 Sobic001G423200 Sobic001G423200 Sobic003G142800--Sobic001G423200 Sobic004G260250 Sobic004G260250 Sobic003G142800--Sobic004G260250 Sobic007G085400 Sobic007G085400 Sobic007G113101--Sobic007G085400 Sobic003G169700 Sobic003G169700 Sobic007G113101--Sobic003G169700 Sobic001G093400 Sobic001G093400 Sobic007G113101--Sobic001G093400 Sobic007G113101--Sobic001G423200 Sobic007G113101--Sobic001G420150 Sobic007G113101--Sobic004G332200 Sobic003G163000 Sobic003G163000 Sobic007G113101--Sobic003G163000 Sobic002G337400 Sobic002G337400 Sobic007G113101--Sobic002G337400 Sobic007G113101--Sobic004G276600 Sobic006G219400 Sobic006G219400 Sobic005G070901--Sobic006G219400 Sobic004G224733 Sobic004G224733 Sobic005G070901--Sobic004G224733 Sobic008G040501 Sobic008G040501 Sobic005G070901--Sobic008G040501 Sobic003G233266 Sobic003G233266 Sobic005G070901--Sobic003G233266 Sobic001G331650 Sobic001G331650 Sobic005G070901--Sobic001G331650 Sobic010G214150 Sobic010G214150 Sobic005G070901--Sobic010G214150 Sobic001G465600 Sobic001G465600 Sobic005G070901--Sobic001G465600 Sobic001G488800 Sobic001G488800 Sobic005G070901--Sobic001G488800 Sobic004G207800 Sobic004G207800 Sobic005G070901--Sobic004G207800 Sobic009G097400 Sobic009G097400 Sobic003G416200--Sobic009G097400 Sobic003G172966 Sobic003G172966 Sobic003G416200--Sobic003G172966 Sobic006G216150 Sobic006G216150 Sobic003G416200--Sobic006G216150 Sobic001G436450 Sobic001G436450 Sobic003G416200--Sobic001G436450 Sobic003G244250 Sobic003G244250 Sobic003G416200--Sobic003G244250 Sobic004G206050 Sobic004G206050 Sobic003G416200--Sobic004G206050 Sobic003G416200--Sobic004G332200 Sobic003G056200 Sobic003G056200 Sobic003G416200--Sobic003G056200 Sobic010G136700 Sobic010G136700 Sobic003G416200--Sobic010G136700 Sobic009G174800 Sobic009G174800 Sobic003G384750--Sobic009G174800 Sobic003G384750--Sobic002G408400 Sobic003G384750--Sobic004G145550 Sobic003G384750--Sobic006G244200 Sobic007G160050 Sobic007G160050 Sobic003G384750--Sobic007G160050 Sobic008G057200 Sobic008G057200 Sobic003G384750--Sobic008G057200 Sobic003G370800 Sobic003G370800 Sobic003G384750--Sobic003G370800 Sobic003G384750--Sobic009G143600 Sobic001G159500 Sobic001G159500 Sobic003G384750--Sobic001G159500 Sobic004G332200--Sobic004G276600 Sobic004G332200--Sobic001G420150 Sobic004G332200--Sobic004G224733 Sobic007G090433 Sobic007G090433 Sobic004G332200--Sobic007G090433 Sobic001G202450 Sobic001G202450 Sobic004G332200--Sobic001G202450 Sobic002G214000 Sobic002G214000 Sobic004G332200--Sobic002G214000 Sobic004G332200--Sobic001G423200 Sobic004G332200--Sobic003G163000 Sobic004G332200--Sobic005G154600
Octagon: transcription factors


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