Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G145550.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RMK9
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G244200 OsFBDUF42 - F-box and DUF domain containing protein, expressed -
2 Sobic.001G520600 DNA topoisomerase 2, putative, expressed -
3 Sobic.010G093200 expressed protein -
4 Sobic.003G384750 - -
5 Sobic.002G375200 expressed protein -
6 Sobic.008G014400 expressed protein -
7 Sobic.001G123400 expressed protein -
8 Sobic.009G143600 clathrin assembly protein, putative, expressed -
9 Sobic.004G334601 - -
10 Sobic.007G113101 - -
11 Sobic.006G252800 - -
12 Sobic.010G176000 - -
13 Sobic.009G174800 thioredoxin, putative, expressed K03671: thioredoxin 1
14 Sobic.007G116300 - -
15 Sobic.006G059150 - -
16 Sobic.010G053700 expressed protein -
17 Sobic.001G420150 - -
18 Sobic.007G090433 - -
19 Sobic.001G423200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide, putative, expressed -
20 Sobic.007G107800 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic004G145550 Sobic004G145550 Sobic006G244200 Sobic006G244200 Sobic004G145550--Sobic006G244200 Sobic001G520600 Sobic001G520600 Sobic004G145550--Sobic001G520600 Sobic010G093200 Sobic010G093200 Sobic004G145550--Sobic010G093200 Sobic003G384750 Sobic003G384750 Sobic004G145550--Sobic003G384750 Sobic002G375200 Sobic002G375200 Sobic004G145550--Sobic002G375200 Sobic008G014400 Sobic008G014400 Sobic004G145550--Sobic008G014400 Sobic001G123400 Sobic001G123400 Sobic004G145550--Sobic001G123400 Sobic009G143600 Sobic009G143600 Sobic004G145550--Sobic009G143600 Sobic004G334601 Sobic004G334601 Sobic004G145550--Sobic004G334601 Sobic006G244200--Sobic004G145550 Sobic006G244200--Sobic009G143600 Sobic006G244200--Sobic003G384750 Sobic006G244200--Sobic001G520600 Sobic006G244200--Sobic010G093200 Sobic006G244200--Sobic002G375200 Sobic007G113101 Sobic007G113101 Sobic006G244200--Sobic007G113101 Sobic006G252800 Sobic006G252800 Sobic006G244200--Sobic006G252800 Sobic002G408400 Sobic002G408400 Sobic006G244200--Sobic002G408400 Sobic001G520600--Sobic004G145550 Sobic001G520600--Sobic010G093200 Sobic001G520600--Sobic001G123400 Sobic001G520600--Sobic006G244200 Sobic006G143800 Sobic006G143800 Sobic001G520600--Sobic006G143800 Sobic007G009900 Sobic007G009900 Sobic001G520600--Sobic007G009900 Sobic001G520600--Sobic003G384750 Sobic008G057200 Sobic008G057200 Sobic001G520600--Sobic008G057200 Sobic010G103400 Sobic010G103400 Sobic001G520600--Sobic010G103400 Sobic010G093200--Sobic001G123400 Sobic001G303300 Sobic001G303300 Sobic010G093200--Sobic001G303300 Sobic005G106700 Sobic005G106700 Sobic010G093200--Sobic005G106700 Sobic010G093200--Sobic004G145550 Sobic010G093200--Sobic001G520600 Sobic010G093200--Sobic006G244200 Sobic004G327900 Sobic004G327900 Sobic010G093200--Sobic004G327900 Sobic003G106800 Sobic003G106800 Sobic010G093200--Sobic003G106800 Sobic008G072400 Sobic008G072400 Sobic010G093200--Sobic008G072400 Sobic009G174800 Sobic009G174800 Sobic003G384750--Sobic009G174800 Sobic003G384750--Sobic002G408400 Sobic003G384750--Sobic004G145550 Sobic003G384750--Sobic006G244200 Sobic007G160050 Sobic007G160050 Sobic003G384750--Sobic007G160050 Sobic003G384750--Sobic008G057200 Sobic003G370800 Sobic003G370800 Sobic003G384750--Sobic003G370800 Sobic003G384750--Sobic009G143600 Sobic001G159500 Sobic001G159500 Sobic003G384750--Sobic001G159500 Sobic002G375200--Sobic008G014400 Sobic002G375200--Sobic006G244200 Sobic002G375200--Sobic004G145550 Sobic003G142800 Sobic003G142800 Sobic002G375200--Sobic003G142800 Sobic002G375200--Sobic007G113101 Sobic005G070901 Sobic005G070901 Sobic002G375200--Sobic005G070901 Sobic003G416200 Sobic003G416200 Sobic002G375200--Sobic003G416200 Sobic002G375200--Sobic003G384750 Sobic004G332200 Sobic004G332200 Sobic002G375200--Sobic004G332200 Sobic008G014400--Sobic002G375200 Sobic008G014400--Sobic004G145550 Sobic007G107800 Sobic007G107800 Sobic008G014400--Sobic007G107800 Sobic008G014400--Sobic007G113101 Sobic008G014400--Sobic006G244200 Sobic008G014400--Sobic005G070901 Sobic006G206600 Sobic006G206600 Sobic008G014400--Sobic006G206600 Sobic004G208800 Sobic004G208800 Sobic008G014400--Sobic004G208800 Sobic008G014400--Sobic003G384750 Sobic001G123400--Sobic010G093200 Sobic001G123400--Sobic007G009900 Sobic001G123400--Sobic004G327900 Sobic001G123400--Sobic001G520600 Sobic009G212900 Sobic009G212900 Sobic001G123400--Sobic009G212900 Sobic001G123400--Sobic005G106700 Sobic004G234000 Sobic004G234000 Sobic001G123400--Sobic004G234000 Sobic001G123400--Sobic004G145550 Sobic004G200100 Sobic004G200100 Sobic001G123400--Sobic004G200100 Sobic009G143600--Sobic006G244200 Sobic009G143600--Sobic003G370800 Sobic009G143600--Sobic009G212900 Sobic009G143600--Sobic002G408400 Sobic009G143600--Sobic004G145550 Sobic009G143600--Sobic003G384750 Sobic009G143600--Sobic007G009900 Sobic009G143600--Sobic003G106800 Sobic009G143600--Sobic001G123400 Sobic003G168700 Sobic003G168700 Sobic004G334601--Sobic003G168700 Sobic004G303433 Sobic004G303433 Sobic004G334601--Sobic004G303433 Sobic008G156800 Sobic008G156800 Sobic004G334601--Sobic008G156800 Sobic003G394701 Sobic003G394701 Sobic004G334601--Sobic003G394701 Sobic010G176000 Sobic010G176000 Sobic004G334601--Sobic010G176000 Sobic001G205950 Sobic001G205950 Sobic004G334601--Sobic001G205950 Sobic002G042700 Sobic002G042700 Sobic004G334601--Sobic002G042700 Sobic007G054200 Sobic007G054200 Sobic004G334601--Sobic007G054200 Sobic007G046700 Sobic007G046700 Sobic004G334601--Sobic007G046700
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.